给一个data,用coxph做完生存分析后,怎样画图对比不同的效应的生存概率图像,只有一个变量Group,Group里面只有1和2。我想绘制的是cox结果的拟合图像,和KM估计的对比
时间: 2024-05-07 19:20:12 浏览: 146
范围:多变量 cox 回归:使用存储在 excel 文件中的删失生存数据计算和绘制 cox 回归拟合-matlab开发
要画出不同组别的生存概率曲线,你可以按照以下步骤操作:
1. 用 `coxph()` 函数对数据进行生存分析,得出模型结果。
2. 用 `survfit()` 函数对不同组别的生存曲线进行估计。其中,你需要将 `type` 参数设置为 `surv`,表示生存曲线;`newdata` 参数设置为你要估计的数据框,包括你要比较的组别。
3. 用 `plot()` 函数将两组生存曲线绘制在同一个图中,进行比较。其中,你需要设置 `lty` 参数来控制曲线的线型,`col` 参数来控制曲线的颜色。
下面是一个代码示例:
```R
# 对数据进行生存分析
fit <- coxph(Surv(time, status) ~ Group, data = data)
# 估计不同组别的生存曲线
fit1 <- survfit(fit, type = "surv", newdata = data.frame(Group = 1))
fit2 <- survfit(fit, type = "surv", newdata = data.frame(Group = 2))
# 绘制生存曲线
plot(fit1, col = "red", lty = 1)
lines(fit2, col = "blue", lty = 2)
legend("topright", legend = c("Group 1", "Group 2"), col = c("red", "blue"), lty = c(1, 2))
```
其中,`data` 是你的数据框,`time` 是生存时间变量,`status` 是二元变量,表示是否发生事件;`Group` 是你要比较的变量。`legend()` 函数用于在图像上添加图例,方便比较。
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