nn.embedding可以用来嵌入蛋白质序列吗

是的，理论上nn.embedding可以用来嵌入蛋白质序列。事实上，很多基于深度学习的蛋白质序列分析任务都是使用类似于自然语言处理中的Word Embedding技术来嵌入蛋白质序列的。

具体来说，可以将蛋白质序列中的每一个氨基酸作为“词语”，将其映射到一个固定长度的向量空间中，得到一个嵌入向量。这个向量可以包含有关氨基酸的许多信息，例如它的化学性质、物理性质、位置等等。在得到嵌入向量之后，可以将其输入到神经网络中进行后续的任务，例如蛋白质分类、结构预测等等。

需要注意的是，由于蛋白质序列与自然语言文本的不同，因此在嵌入蛋白质序列时需要考虑到一些特殊的问题，例如氨基酸的位置信息、化学性质的多样性等等。因此，需要专门针对蛋白质序列设计合适的嵌入方法，而不能直接使用自然语言处理中的Word Embedding技术。