请用pandas库读入csv文件中一列smiles数据,并将其依次转换为mol格式
时间: 2024-04-30 20:22:48 浏览: 114
使用pandas读取csv文件的指定列方法
以下是Python代码示例:
```python
import pandas as pd
from rdkit import Chem
# 读入csv文件中的smiles列
df = pd.read_csv('data.csv')
smiles_list = df['smiles']
# 将smiles转换为mol格式
mol_list = []
for smiles in smiles_list:
mol = Chem.MolFromSmiles(smiles)
mol_list.append(mol)
```
其中,`data.csv`是包含smiles数据的csv文件。使用`pd.read_csv()`函数可以读入csv文件,然后使用`df['smiles']`选取其中的smiles列。接着,使用RDKit库中的`Chem.MolFromSmiles()`函数将每个smiles字符串转换为mol格式,最终得到一个mol对象的列表。
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