E_pe_tot = 0 do i = 1, n_atoms-1 do j = i+1, n_atoms if (mol(i) /= mol(j)) then dx = xu(i) - xu(j) dy = yu(i) - yu(j) do while (dx > L/2.d0) dx = dx - L end do do while (dx < -L/2.d0) dx = dx + L end do do while (dy > L/2.d0) dy = dy - L end do do while (dy < -L/2.d0) dy = dy + L end do dx_min = dx dy_min = dy dis = sqrt(dx_min**2+dy_min**2) E_pe = 0 delta_d = 0 if (dis < radius(i)+radius(j)) then delta_d = (radius(i)+radius(j)-dis) r_eff = sqrt(radius(i)*radius(j)/(radius(i)+radius(j))) E_pe = 0.4d0*r_eff*Kn*(delta_d ** 2.5) end if E_pe_tot = E_pe_tot + E_pe end if end do end do

时间: 2024-02-10 07:18:56 浏览: 182
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bailuandoantotnghiep-1-??-chuy?n-??i-1_tot_pdf_

这是一个Fortran代码片段,可以用于计算分子系统中原子之间的相互作用能量。该代码使用了一个双重循环来遍历所有原子对,并计算它们之间的相互作用。其中,mol(i)代表第i个原子所属的分子,xu(i)和yu(i)代表第i个原子的x和y坐标,L代表系统的尺寸,radius(i)代表第i个原子的半径,Kn代表弹性系数。在计算过程中,将两个原子之间的距离限制在半径之内,使用了一个6-12势函数来计算相互作用能量。总能量E_pe_tot累加了所有原子对之间的相互作用能量E_pe。 需要注意的是,该代码并没有使用空间分割法,而是采用了暴力计算的方法。这种方法的缺点是计算量较大,计算时间较长,但是可以得到较为精确的结果。如果要使用空间分割法来优化计算效率,则需要对系统进行空间划分,并只计算处于同一或相邻立方体中的原子对之间的相互作用。
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把这份代码转换成c++代码var n,i,j,p,x,min,tot,t,len:longint; 2 out_,in_,a,heap:array[0..30005] of longint; 3 son,nxt:array[0..1000005] of longint; 4 lnk:array[0..30005] of longint; 5 procedure print_no; 6 begin 7 writeln('no solution'); 8 close(input); close(output); 9 halt; 10 end; 11 procedure put(id:longint); 12 var i:longint; 13 begin 14 inc(len); heap[len]:=id; i:=len; 15 while (i>1) do 16 begin 17 if (heap[i>>1]>heap[i]) then 18 begin 19 heap[0]:=heap[i]; heap[i]:=heap[i>>1]; heap[i>>1]:=heap[0]; 20 i:=i>>1; 21 end 22 else break; 23 end; 24 end; 25 function get:longint; 26 var fa,son:longint; 27 begin 28 get:=heap[1]; heap[1]:=heap[len]; dec(len); fa:=1; 29 while (fa<<1<=len) do 30 begin 31 if (fa<<1+1>len) or (heap[fa<<1]<heap[fa<<1+1]) then son:=fa*2 32 else son:=fa*2+1; 33 if heap[fa]>heap[son] then 34 begin 35 heap[0]:=heap[fa]; heap[fa]:=heap[son]; heap[son]:=heap[0]; 36 fa:=son; 37 end 38 else break; 39 end; 40 end; 41 procedure add(x,y:longint); 42 begin 43 inc(tot); son[tot]:=y; nxt[tot]:=lnk[x]; lnk[x]:=tot; 44 end; 45 begin 46 readln(n); 47 for i:=1 to n do 48 begin 49 read(out_[i]); 50 for j:=1 to out_[i] do 51 begin 52 read(x); inc(in_[x]); add(i,x); 53 end; 54 end; 55 min:=maxlongint; 56 for i:=1 to n do 57 if (in_[i]=0) then begin min:=0; put(i); end; 58 if min<>0 then print_no; 59 repeat 60 p:=get; inc(t); a[t]:=p; j:=lnk[p]; 61 in_[p]:=-1; 62 while j<>0 do 63 begin 64 dec(in_[son[j]]); 65 if in_[son[j]]=0 then put(son[j]); 66 j:=nxt[j]; 67 end; 68 until len=0; 69 writeln(t); 70 for i:=1 to t do write(a[i],' '); 71 end.

static void pvq_pyr_project(const Word16 dim_proj, /* end vector dimension+1 */ const Word16 *xabs, /* absolute vector values */ Word32 L_xsum, /* absolute vector sum over dim */ Word16 num, /* target number of pulses */ Word16 * y, /* projected output vector */ Word16 *pulse_tot_ptr, Word32 *L_xy_ptr, /* accumulated correlation Q(in+0+1) = Qin+1 */ Word32 *L_yy_ptr /* accumulated energy Q0 */ ) { // pvq_pyr_project(dim, xabs, L_xsum, pulses_proj[0], y_far, &pulse_tot_far, &L_xy, // &L_yy); /* outlier submode projection */ Dyn_Mem_Deluxe_In( Counter i; Word32 L_tmp, L_num; Word16 den, shift_num, shift_den, shift_delta, proj_fac; ); *pulse_tot_ptr = 0; move16(); *L_xy_ptr = L_deposit_l(0); *L_yy_ptr = L_deposit_l(0); shift_den = norm_l(L_xsum); /* x_sum input Qin */ den = extract_h(L_shl_pos(L_xsum, shift_den)); /* now in Qin+shift_den */ L_num = L_deposit_l(num); shift_num = sub(norm_l(L_num), 1); L_num = L_shl_pos(L_num, shift_num); /* now in Q0 +shift_num -1 */ proj_fac = div_l(L_num, den); /* L_num always has to be less than den<<16 , norm_l-1 makes that happen */ shift_delta = sub(shift_num, shift_den); FOR (i = 0; i < dim_proj; i++) { L_tmp = L_mult(proj_fac, xabs[i]); /* Q shift_delta + PVQ_SEARCH_QIN */ y[i] = extract_h(L_shr(L_tmp, shift_delta)); move16(); /* to Q0 with floor , and potential sturation */ ; *pulse_tot_ptr = add(*pulse_tot_ptr, y[i]); /* Q0 */ *L_yy_ptr = L_mac0(*L_yy_ptr, y[i], y[i]); /* Energy, Q0 */ *L_xy_ptr = L_mac(*L_xy_ptr, xabs[i], y[i]); /* Corr, Q0*Q12 +1 --> Q13 */ } Dyn_Mem_Deluxe_Out(); }

#include <bits/stdc++.h> using namespace std; #define MAXSIZE 1001 int tot; struct Node{ string data; int lchild; int rchild; int fchild; }node[MAXSIZE]; int stack_num[MAXSIZE];//下标数组 int stack_op[MAXSIZE];//运算符数组 int top_num; int top_op; int op_rank[255]; int makenode(string x){ tot++; node[tot].data=x; node[tot].lchild=0; node[tot].rchild=0; node[tot].fchild=0; return tot; }//叶子节点的构造 int maketree(int a,int b,char c){ tot++; node[tot].data=c; node[tot].lchild=a; node[tot].rchild=b; node[tot].fchild=0; node[a].fchild=tot; node[b].fchild=tot; return tot; }//叶子结点构造树 void print_tree(int x){ if(x==0) return; print_tree(node[x].lchild); print_tree(node[x].rchild); cout<<node[x].data<<' '; }//后序遍历 void push_num(int num){ top_num++; stack_num[top_num]=num; } int pop_num(){ return stack_num[top_num--]; } void push_op(char c){ top_op++; stack_op[top_op]=c; } char pop_op(){ return stack_op[top_op--]; } void solve(){ char c=pop_op(); while(c!='('){ int b=pop_num(); int a=pop_num(); push_num(maketree(a,b,c)); c=pop_op(); } } void judge_op(char c){ if(op_rank[c]>op_rank[stack_op[top_op]]||top_op==0){ push_op(c); return; } char x=pop_op(); int b=pop_num(); int a=pop_num(); push_num(maketree(a,b,x)); judge_op(c); } void clearstack(){ while(top_op!=0){ char c=pop_op(); int b=pop_num(); int a=pop_num(); push_num(maketree(a,b,c)); } } int main(){ op_rank['(']=1; op_rank['+']=2; op_rank['-']=2; op_rank['*']=3; op_rank['/']=3; op_rank[')']=4; string s; getline(cin,s); s=s+'@'; tot=0; string s_num; for(int i=0;i<s.size();i++){ switch(s[i]){ case '@': if(s_num!="") push_num(makenode(s_num)); clearstack(); break; case'(': push_op('('); solve(); break; case '+': case '-': case '*': case '/': if(s_num!="") push_num(makenode(s_num)); s_num=""; judge_op(s[i]); break; default: s_num+=s[i]; break; } } print_tree(pop_num()); return 0; }修改此代码使能输出结果

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