X_tsne = tsne.fit_transform(X)这是什么意思

时间: 2024-05-17 08:19:50 浏览: 4
这是一个使用 t-SNE 算法对数据进行降维的过程。t-SNE(t-Distributed Stochastic Neighbor Embedding)是一种非线性降维算法,可以将高维数据映射到低维空间中(通常是二维或三维),以便更好地可视化数据。 在这里,X 是一个包含原始数据的矩阵或数组。tsne 是 t-SNE 算法的一个实例,通过对 X 进行降维,得到 X 在低维空间中的表示。具体而言,X_tsne 是 X 在 t-SNE 算法下的降维结果,它是一个矩阵或数组,其行数与 X 相同,但列数通常较小,表示 X 在低维空间中的坐标。
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X_tsne = tsne.fit_transform(X)怎么取每一行里的指定列

要取每一行里的指定列,可以使用 Python 中的切片(slice)操作。比如,假设你想要取 X_tsne 矩阵中每一行的第 1 列和第 3 列,你可以这样做: ```python selected_cols = [0, 2] # 选择第 1 列和第 3 列 X_selected = X_tsne[:, selected_cols] # 取出每一行的指定列 ``` 这里,我们首先定义了一个列表 selected_cols,其中包含要选择的列的索引。然后,我们使用切片操作 `X_tsne[:, selected_cols]` 取出了每一行的指定列,结果存储在 X_selected 变量中。 需要注意的是,切片操作中的 `:` 表示取所有行,而 `selected_cols` 表示取指定的列。在 Python 中,切片操作的语法为 `start:stop:step`,其中 start 表示开始位置,stop 表示结束位置,step 表示步长。如果不指定其中的任何一个值,Python 会默认使用合适的默认值。

具体代码“# T-SNE降维 tsne = manifold.TSNE(n_components=3, init="pca") train_x = tsne.fit_transform(train_x) # GMM聚类 GMM = GaussianMixture(n_components=2) GMM.fit(train_x, train_y) pred_val_y = GMM.predict(val_x)”报错ValueError: Expected the input data X have 3 features, but got 30 features,我该怎么修改?尝试写一段修改后的代码

根你提供的代码,可以看出你在使用 T-SNE 进行降维后,传入了 train_x 和 val_x 分别进行 GMM 聚类。由于你的数据集中每个数据点都有 30 个特征,因此在进行 T-SNE 降维时,你需要指定 n_components=3,将输入数据从 30 维降到 3 维。但是,在进行 GMM 聚类时,你又将降维后的数据 train_x 和 val_x 直接传入了 GMM 模型,导致了特征数量不匹配的错误。 解决这个问题的方法是,在使用 T-SNE 进行降维后,只保留降维后的前三个特征,然后再将这三个特征传入 GMM 模型进行聚类。具体的代码如下: ``` # T-SNE降维 tsne = manifold.TSNE(n_components=3, init="pca") train_x = tsne.fit_transform(train_x) val_x = tsne.transform(val_x) # 注意,这里也需要将 val_x 进行降维 # 只保留前三个特征 train_x = train_x[:, :3] val_x = val_x[:, :3] # GMM聚类 GMM = GaussianMixture(n_components=2) GMM.fit(train_x, train_y) pred_val_y = GMM.predict(val_x) ``` 在这段代码中,我们首先对 train_x 和 val_x 进行 T-SNE 降维,并只保留前三个特征。然后,我们将降维后的 train_x 和 train_y 传入 GMM 模型进行聚类,并使用聚类模型对 val_x 进行预测。这样就可以避免特征数量不匹配的错误。

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修改下面代码,另画一张可视化图展示出t_sne里面的数据每15行数据个用一种颜色画出。 import pandas as pd from sklearn import cluster from sklearn import metrics import matplotlib.pyplot as plt from sklearn.manifold import TSNE from sklearn.decomposition import PCA def k_means(data_set, output_file, png_file, t_labels, score_file, set_name): model = cluster.KMeans(n_clusters=7, max_iter=1000, init="k-means++") model.fit(data_set) # print(list(model.labels_)) p_labels = list(model.labels_) r = pd.concat([data_set, pd.Series(model.labels_, index=data_set.index)], axis=1) r.columns = list(data_set.columns) + [u'聚类类别'] print(r) # r.to_excel(output_file) with open(score_file, "a") as sf: sf.write("By k-means, the f-m_score of " + set_name + " is: " + str(metrics.fowlkes_mallows_score(t_labels, p_labels))+"\n") sf.write("By k-means, the rand_score of " + set_name + " is: " + str(metrics.adjusted_rand_score(t_labels, p_labels))+"\n") '''pca = PCA(n_components=2) pca.fit(data_set) pca_result = pca.transform(data_set) t_sne = pd.DataFrame(pca_result, index=data_set.index)''' t_sne = TSNE() t_sne.fit(data_set) t_sne = pd.DataFrame(t_sne.embedding_, index=data_set.index) plt.rcParams['font.sans-serif'] = ['SimHei'] plt.rcParams['axes.unicode_minus'] = False dd = t_sne[r[u'聚类类别'] == 0] plt.plot(dd[0], dd[1], 'r.') dd = t_sne[r[u'聚类类别'] == 1] plt.plot(dd[0], dd[1], 'go') dd = t_sne[r[u'聚类类别'] == 2] plt.plot(dd[0], dd[1], 'b*') dd = t_sne[r[u'聚类类别'] == 3] plt.plot(dd[0], dd[1], 'o') dd = t_sne[r[u'聚类类别'] == 4] plt.plot(dd[0], dd[1], 'm.') dd = t_sne[r[u'聚类类别'] == 5] plt.plot(dd[0], dd[1], 'co') dd = t_sne[r[u'聚类类别'] == 6] plt.plot(dd[0], dd[1], 'y*') plt.savefig(png_file) plt.clf() '''plt.scatter(data_set.iloc[:, 0], data_set.iloc[:, 1], c=model.labels_) plt.savefig(png_file) plt.clf()''' frog_data = pd.read_csv("D:/PyCharmPython/pythonProject/mfcc3.csv") tLabel = [] for family in frog_data['name']: if family == "A": tLabel.append(0) elif family == "B": tLabel.append(1) elif family == "C": tLabel.append(2) elif family == "D": tLabel.append(3) elif family == "E": tLabel.append(4) elif family == "F": tLabel.append(5) elif family == "G": tLabel.append(6) scoreFile = "D:/PyCharmPython/pythonProject/scoreOfClustering.txt" first_set = frog_data.iloc[:, 1:1327] k_means(first_set, "D:/PyCharmPython/pythonProject/kMeansSet_1.xlsx", "D:/PyCharmPython/pythonProject/kMeansSet_2.png", tLabel, scoreFile, "Set_1")

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