pyEDM实现收敛交叉映射ccm及显著性检验
时间: 2023-07-28 16:10:34 浏览: 1024
pyEDM是一个Python库,用于执行经验动力学分析(EDA)中的各种方法,其中包括收敛交叉映射(CCM)和显著性检验。CCM是一种非线性数据分析方法,用于确定两个时间序列之间的因果关系。显著性检验用于确定CCM结果的可靠性。
要使用pyEDM执行CCM和显著性检验,需要执行以下步骤:
1. 从pyEDM库导入CCM模块和Significance模块。
2. 加载要分析的时间序列数据,可以使用pandas或numpy等Python库加载CSV或其他格式的数据文件。
3. 使用CCM模块执行CCM分析,指定参数,例如嵌入维度和时间延迟。
4. 使用Significance模块执行显著性检验,指定参数,例如置信水平和重复次数。
以下是一个简单的示例代码,用于执行CCM和显著性检验:
```
import pandas as pd
import numpy as np
from pyEDM import CCM, Significance
# 加载时间序列数据
data = pd.read_csv('data.csv')
# 执行CCM分析
CCM_output = CCM( dataFrame = data, E = 3, Tp = 1, columns=['column1', 'column2'] )
# 执行显著性检验
Significance_output = Significance( Result = CCM_output['Prediction'],
E = 3, Tp = 1, columns=['column1', 'column2'],
TestType='Randomization', Sample=100 )
```
这个示例代码加载了一个名为data.csv的数据文件,其中包含两列名为column1和column2的时间序列数据。然后,它使用CCM模块执行了CCM分析,指定了嵌入维度为3,时间延迟为1。最后,它使用Significance模块执行了显著性检验,指定了置信水平为95%,重复次数为100。
请注意,此示例代码仅用于演示目的,并且需要根据您的实际数据和参数进行修改。
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