R语言中,做收敛交叉映射分析代码怎么实现
时间: 2024-09-20 16:07:14 浏览: 68
Sugi_CCM_因果_
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在R语言中,做收敛交叉映射(Convergent Cross Mapping,CCM)是一种用于评估两个时间序列之间潜在因果关系的技术,它基于Granger因果性和Takens嵌入理论。以下是使用`ccm()`函数从`pracma`包进行CCM分析的基本步骤:
首先,你需要安装并加载必要的包,如`pracma`和`tidyverse`(如果尚未安装):
```r
install.packages(c("pracma", "tidyverse"))
library(pracma)
library(tidyverse)
```
接下来,假设你有两个时间序列 `x` 和 `y`,你可以按照以下代码编写CCM分析:
```r
# 假设 x 和 y 是你的数据,这里用随机生成的数据举例
set.seed(42) # 设置随机种子以保证结果可复现
x <- rnorm(1000)
y <- rnorm(1000)
# 对数据进行预处理,例如标准化
x_norm <- (x - mean(x)) / sd(x)
y_norm <- (y - mean(y)) / sd(y)
# 进行CCM分析
lag <- ccm(x_norm, y_norm)$lags[which.max(ccm(x_norm, y_norm)$corr)] # 搜索最优延迟步长
cross_corr <- ccm(x_norm, y_norm, lag = lag)$corr
# 输出结果
cat("最优延迟步长:", lag, "\n")
cat("收敛交叉相关系数:", cross_corr, "\n")
# 如果你想可视化结果,可以创建散点图
scattergram <- data.frame(
x = x_norm,
y = y_norm,
z = ifelse(lag == 0, 1, 0),
col = ifelse(lag > 0, "red", "blue"),
shape = rep(c(16, 17), each = length(x_norm)/2)
)
ggplot(scattergram, aes(x, y, color = z, shape = z)) +
geom_point(size = 3) +
theme_minimal() +
ggtitle(paste0("CCM Scatterplot (Lag =", lag, ")"))
```
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