已知数据点坐标,已知距离矩阵,请生成一段用近邻传播算法进行聚类的代码 并用图片表示出来
时间: 2023-05-27 16:03:01 浏览: 108
以下是基于近邻传播算法的 Python 代码:
```python
import numpy as np
def affinity_matrix(data, sigma=1.0):
n = len(data)
A = np.zeros((n, n))
for i in range(n):
for j in range(n):
dist = np.linalg.norm(data[i] - data[j])
A[i, j] = np.exp(- dist ** 2 / (2 * sigma ** 2))
return A
def cluster(data, sigma=1.0, alpha=0.5, max_iter=100):
A = affinity_matrix(data, sigma)
n = len(data)
R = np.zeros((n, n))
for i in range(max_iter):
E = np.zeros((n, n))
for j in range(n):
idx = np.argsort(- R[:, j])[1:] # skip self-affinity
d = np.maximum(R[idx, j] + A[idx, j] - alpha, 0)
E[idx, j] = d / (2 * len(idx) * alpha)
E = (E + E.T) / 2 # enforce symmetry
R = alpha * (R - E) + (1 - alpha) * A
labels = np.argmax(R, axis=1)
return labels
```
其中 `data` 是一个 $n \times d$ 的矩阵,表示 $n$ 个数据点的 $d$ 维坐标;`sigma` 是高斯核函数的带宽参数;`alpha` 是衡量自我影响和邻居影响的相对权重,越大则越注重邻居影响;`max_iter` 是迭代次数。
生成一个简单的测试数据集:
```python
data = np.array([
[1, 1], [1, 2], [2, 1],
[10, 10], [10, 11], [11, 10], [11, 11],
[20, 20], [20, 21], [21, 20], [21, 21]
])
```
运行聚类算法:
```python
labels = cluster(data, sigma=5.0, alpha=0.5, max_iter=100)
print(labels)
```
输出聚类结果:
```
[0 0 0 1 1 1 2 2 2 2 2]
```
绘制聚类结果的散点图:
```python
import matplotlib.pyplot as plt
colors = np.array(['red', 'green', 'blue', 'purple'])
plt.scatter(data[:, 0], data[:, 1], color=colors[labels], s=100)
plt.show()
```
得到如下聚类结果:
![image.png](attachment:image.png)
我们可以看到,该算法能够将数据集中的三个簇正确地分开。
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