可以不用python吗

当然可以。你可以使用Linux系统自带的命令行工具来完成这个任务。具体步骤如下：

1. 使用`cat`命令读取CSV文件，并使用`cut`命令获取V2列的内容：

   cat your_csv_file.csv | cut -d ',' -f 2 > v2_content.txt

这个命令将CSV文件的内容通过管道传递给`cut`命令，指定分隔符为逗号，获取第二列的内容，并将结果输出到一个名为`v2_content.txt`的文本文件中。

2. 遍历文件夹中的每一个文件，并根据V2列的内容来对文件进行重命名。假设你的文件夹路径为`/path/to/your/folder`，则可以使用以下命令：

   cd /path/to/your/folder
   
   for file in *.fa
   do
       # 根据文件名获取对应的V2列的内容
       v2_content=$(sed -n "$(echo "${file%.*}" | awk '{print $1}')p" /path/to/v2_content.txt)
       
       # 构建新的文件名
       new_filename=$(echo "${file%.*}" | awk -F ',' -v v2="$v2_content" '{printf("%s::%s::%s::%s::%s::%s", $1, v2, $3, $4, $5, $6)}').fa
       
       # 对文件进行重命名
       mv "$file" "$new_filename"
   done

这个命令会遍历文件夹中的每一个`.fa`文件，并根据文件名获取对应的V2列的内容。然后，使用`awk`命令构建新的文件名，并使用`mv`命令对文件进行重命名。

需要注意的是，这个命令中的`/path/to/v2_content.txt`需要替换成你实际存储V2列内容的文件路径。另外，如果你的CSV文件中的列名中有空格，需要使用双引号将整个列名括起来。