中文详细解释每一句代码def diceCoeff(pred, gt, smooth=1, activation='sigmoid'): r""" computational formula: dice = (2 * (pred ∩ gt)) / (pred ∪ gt) """ if activation is None or activation == "none": activation_fn = lambda x: x elif activation == "sigmoid": activation_fn = nn.Sigmoid() elif activation == "softmax2d": activation_fn = nn.Softmax2d() else: raise NotImplementedError("Activation implemented for sigmoid and softmax2d 激活函数的操作") pred = activation_fn(pred) N = gt.size(0) pred_flat = pred.view(N, -1) gt_flat = gt.view(N, -1) intersection = (pred_flat * gt_flat).sum(1) unionset = pred_flat.sum(1) + gt_flat.sum(1) loss = 2 * (intersection + smooth) / (unionset + smooth) return loss.sum() / N
时间: 2024-04-28 10:23:36 浏览: 371
这是一个 Python 函数,用于计算 Dice 系数(Dice Coefficient)的值,它接受三个参数:
- pred: 预测的张量,即模型输出的结果;
- gt: 真实的张量,即标签或真实值;
- smooth: 平滑系数,用于防止分母为零。
该函数首先定义了一个计算 Dice 系数的公式:
dice = (2 * (pred ∩ gt)) / (pred ∪ gt)
其中,∩ 表示交集(Intersection),∪ 表示并集(Union),* 表示张量的按元素乘法。
接下来,根据传入的激活函数类型,定义了一个激活函数,如果是 None 或者 "none",则直接返回输入值,如果是 "sigmoid",则使用 PyTorch 中自带的 Sigmoid 函数,如果是 "softmax2d",则使用 PyTorch 中自带的 Softmax2d 函数。
然后,对预测的张量进行激活函数的操作,接着获取真实张量的批次数 N,将预测张量和真实张量展开成二维矩阵,计算它们的交集和并集,最后根据公式计算 Dice 系数,将所有批次的 Dice 系数求和并除以批次数 N,得到最终的 Dice 系数值。
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# extract dataset x1_x2_train = data_train[:, :-1] t_train = data_train[:, 2] # x1_x2_test = data_test[:, :-1] t_test = data_test[:, 2] if choice == 1: model = svm_bi.SVM(svm_bi.linear_kernel) elif choice == 2: #model = SVM(polynormal_kernel) model = svm_bi.SVM(svm_bi.gaussian_kernel) #model = svm_bi.SVM(svm_bi.sigmoid_kernel) elif choice == 3: model3 = svm_multi.SVM_Multi() elif choice == 4: from sklearn.svm import SVC model4 = SVC(kernel='sigmoid') else: exit() support_vec = None if choice == 4: model4.fit(x1_x2_train, t_train) pred_train = model4.predict(x1_x2_train) pred_test = model4.predict(x1_x2_test) elif choice == 1 or choice == 2: support_vec = model.train(data_train) # shape(N,1) [pred_t] pred_train = model(x1_x2_train) pred_test = model(x1_x2_test) elif choice == 3: support_vec = model3.train(data_train) pred_train = model3(x1_x2_train) pred_test = model3(x1_x2_test) else: support_vec = None pred_train = None pred_train = None,这段代码的含义是什么
这段代码主要是根据用户选择的 SVM 算法类型,建立相应的 SVM 模型,并使用训练集数据进行训练,并对训练集和测试集进行预测。
首先,根据选择的 SVM 类型,判断需要使用哪个 SVM 模型进行训练。如果选择了线性 SVM(choice=1),则使用 svm_bi.SVM(svm_bi.linear_kernel) 建立模型;如果选择了非线性 SVM(choice=2),则可以选择使用 svm_bi.SVM(svm_bi.gaussian_kernel) 或 svm_bi.SVM(svm_bi.sigmoid_kernel) 建立模型;如果选择了多分类 SVM(choice=3),则使用 svm_multi.SVM_Multi() 建立模型;如果选择了 sklearn SVM(choice=4),则使用 sklearn.svm.SVC(kernel='sigmoid') 建立模型。
然后,根据选择的 SVM 模型类型,使用训练集数据进行训练,并对训练集和测试集进行预测。如果选择的是 sklearn SVM 模型,则使用 model4.fit(x1_x2_train, t_train) 对模型进行训练,并使用 model4.predict(x1_x2_train) 和 model4.predict(x1_x2_test) 对训练集和测试集进行预测;如果选择的是 SVM(linear、gaussian 或 sigmoid kernel)模型,则使用 model.train(data_train) 对模型进行训练,并使用 model(x1_x2_train) 和 model(x1_x2_test) 对训练集和测试集进行预测。如果选择的是多分类 SVM 模型,则使用 model3.train(data_train) 对模型进行训练,并使用 model3(x1_x2_train) 和 model3(x1_x2_test) 对训练集和测试集进行预测。
最后,根据选择的 SVM 模型类型,返回预测结果 pred_train 和 pred_test,以及支持向量 support_vec。如果选择的是 SVM(linear、gaussian 或 sigmoid kernel)模型或多分类 SVM 模型,返回的支持向量 support_vec 非空,否则为空。
def dice_coef_fun(smooth=1): def dice_coef(y_true, y_pred): #求得每个sample的每个类的dice intersection = K.sum(y_true * y_pred, axis=(1,2,3)) union = K.sum(y_true, axis=(1,2,3)) + K.sum(y_pred, axis=(1,2,3)) sample_dices=(2. * intersection + smooth) / (union + smooth) #一维数组 为各个类别的dice #求得每个类的dice dices=K.mean(sample_dices,axis=0) return K.mean(dices) #所有类别dice求平均的dice return dice_coef def dice_coef_loss_fun(smooth=0): def dice_coef_loss(y_true,y_pred): return 1-1-dice_coef_fun(smooth=smooth)(y_true=y_true,y_pred=y_pred) return dice_coef_loss
这段代码定义了两个函数,`dice_coef_fun` 和 `dice_coef_loss_fun`,用于计算 Dice Coefficient 和 Dice Coefficient Loss。
首先是 `dice_coef_fun` 函数,它接受一个平滑因子 `smooth` 的默认值为 1。在函数内部,首先计算了预测值 `y_pred` 和真实标签 `y_true` 的交集,并对其进行求和操作,轴为 (1,2,3)。然后,计算了真实标签和预测值的总和,并同样进行求和操作。最后,根据 Dice Coefficient 的公式,将交集乘以 2 并加上平滑因子,再除以总和与平滑因子之和,得到每个类别的 Dice Coefficient。最终,将所有类别的 Dice Coefficient 求平均,作为函数的返回值。
接下来是 `dice_coef_loss_fun` 函数,它接受一个平滑因子 `smooth` 的默认值为 0。在函数内部,调用了 `dice_coef_fun` 函数,并将 `y_true` 和 `y_pred` 作为参数传入。然后,将 `dice_coef_fun` 的返回值与 1 相减,并再次减去 1,得到 Dice Coefficient Loss 的值,作为函数的返回值。
这段代码使用了 Keras(或者 TensorFlow)的张量操作。如果你有关于这些函数的任何问题,请继续提问。
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