python写KPCA降维
时间: 2023-07-05 18:28:13 浏览: 176
下面是使用Python实现KPCA降维的示例代码:
```python
import numpy as np
from sklearn.decomposition import KernelPCA
from sklearn.datasets import make_circles
# 生成模拟数据
X, y = make_circles(n_samples=1000, random_state=123, noise=0.1, factor=0.2)
# 定义KPCA模型
kpca = KernelPCA(n_components=2, kernel='rbf')
# 拟合模型并降维
X_kpca = kpca.fit_transform(X)
# 打印降维后的数据
print(X_kpca)
```
这个示例代码中,我们使用了scikit-learn库中的KernelPCA类来实现KPCA降维。我们首先生成了一个模拟数据集,然后定义了一个KernelPCA对象,并设置了要降维到的维度数和核函数类型。最后,我们使用fit_transform()方法将数据拟合到模型中,并进行降维,得到了降维后的数据X_kpca。
相关问题
sklearn中的KPCA降维方法,如何得到他的映射矩阵
在scikit-learn中,使用KernelPCA类进行KPCA降维时,可以通过其核函数和主成分分析的特征向量来计算映射矩阵。
具体步骤如下:
1. 首先,使用KernelPCA类拟合数据集,这将计算出主成分分析的特征向量。
2. 根据所选的核函数(例如,高斯核函数),计算每个样本点与所有其他样本点之间的内积,得到Gram矩阵。
3. 使用主成分分析的特征向量和Gram矩阵,计算出映射矩阵。映射矩阵的每一行对应于一个样本在低维空间中的坐标。
这个过程可以通过以下代码实现:
```python
from sklearn.decomposition import KernelPCA
# 创建KPCA对象,设置核函数和降维后的维度
kpca = KernelPCA(kernel='rbf', n_components=2)
# 拟合数据集
kpca.fit(X)
# 计算Gram矩阵
gram = kpca.kernel(X)
# 计算映射矩阵
mapping_matrix = np.zeros((X.shape[1], kpca.n_components))
for i in range(kpca.n_components):
mapping_matrix[:, i] = np.sum(kpca.alphas_[:, i] * gram.T, axis=1) / np.sqrt(kpca.lambdas_[i])
```
其中,`X`是原始数据集。在计算映射矩阵时,使用了KPCA对象的`alphas_`属性和`lambdas_`属性,分别表示主成分分析的特征向量和特征值。
python写一段KPCA根据方差贡献率确定降维数的代码
好的,以下是一个简单的KPCA降维代码示例,其中包含根据方差贡献率确定降维数的部分:
```python
import numpy as np
from sklearn.decomposition import KernelPCA
# 加载数据集
X = np.loadtxt('data.txt')
# 计算KPCA主成分
kpca = KernelPCA(kernel='rbf')
kpca.fit(X)
# 计算方差贡献率并排序
variance_ratio = kpca.explained_variance_ratio_
idx = np.argsort(variance_ratio)[::-1]
variance_ratio = variance_ratio[idx]
# 累计方差贡献率
cumulative_variance_ratio = np.cumsum(variance_ratio)
# 根据方差贡献率阈值确定降维数
threshold = 0.95
n_components = np.argmax(cumulative_variance_ratio >= threshold) + 1
# 降维
kpca = KernelPCA(kernel='rbf', n_components=n_components)
X_new = kpca.fit_transform(X)
```
在这个示例代码中,我们首先使用sklearn库中的KernelPCA类来计算KPCA主成分。然后,我们计算每个主成分的方差贡献率,并按照贡献率从大到小排序。接下来,我们计算累计方差贡献率,并根据方差贡献率阈值确定降维数。最后,我们使用KernelPCA类进行数据降维,并得到降维后的新数据集X_new。
阅读全文