def get_subsample(dataSet, ratio): subdataSet = [] lenSubdata = round(len(dataSet) * ratio)

时间: 2023-05-22 12:00:50 浏览: 155
这是一个函数,用于从数据集中随机抽取一定比例的数据。其中,dataSet是原始数据集,ratio是抽取比例。函数的返回值是抽取后的子数据集subdataSet。lenSubdata是子数据集的长度,通过round函数将原始数据集长度乘以抽取比例得到。
相关问题

def get_subsample(dataSet, ratio): subdataSet = [] lenSubdata = round(len(dataSet) * ratio)#返回浮点数 while len(subdataSet) < lenSubdata: index = randrange(len(dataSet) - 1)

这是一个Python函数,名为get_subsample,它有两个参数:dataSet和ratio。它的作用是从数据集中随机抽取一部分数据,抽取的比例由ratio参数指定。抽取的数据存储在subdataSet列表中,列表的长度由lenSubdata变量指定,它是数据集长度乘以ratio后四舍五入的结果。

def get_CIFAR10_data(num_training=500, num_validation=50, num_test=50): """ Load the CIFAR-10 dataset from disk and perform preprocessing to prepare it for classifiers. These are the same steps as we used for the SVM, but condensed to a single function. """ # Load the raw CIFAR-10 data cifar10_dir = 'C:/download/cifar-10-python/cifar-10-batches-py/data_batch_1' X_train, y_train, X_test, y_test = load_CIFAR10(cifar10_dir) print (X_train.shape) # Subsample the data mask = range(num_training, num_training + num_validation) X_val = X_train[mask] y_val = y_train[mask] mask = range(num_training) X_train = X_train[mask] y_train = y_train[mask] mask = range(num_test) X_test = X_test[mask] y_test = y_test[mask] # Normalize the data: subtract the mean image mean_image = np.mean(X_train, axis=0) X_train -= mean_image X_val -= mean_image X_test -= mean_image # Transpose so that channels come first X_train = X_train.transpose(0, 3, 1, 2).copy() X_val = X_val.transpose(0, 3, 1, 2).copy() X_test = X_test.transpose(0, 3, 1, 2).copy() # Package data into a dictionary return { 'X_train': X_train, 'y_train': y_train, 'X_val': X_val, 'y_val': y_val, 'X_test': X_test, 'y_test': y_test, }

这段代码定义了一个函数get_CIFAR10_data,用于加载和预处理CIFAR-10数据集,并返回一个包含训练集、验证集和测试集的字典。 具体来说,这个函数完成了以下几个步骤: 1. 调用load_CIFAR10函数加载CIFAR-10数据集,得到原始的训练集和测试集数据(X_train, y_train, X_test, y_test)。 2. 对原始数据进行子采样,得到num_training个样本作为训练集,num_validation个样本作为验证集,num_test个样本作为测试集。 3. 对训练集、验证集和测试集进行均值归一化,即将每个像素减去训练集的均值像素值。这个操作可以提高模型的训练效果和泛化能力。 4. 对训练集、验证集和测试集进行通道转置,即将原来的(样本数, 高, 宽, 通道数)的四维数组转换为(样本数, 通道数, 高, 宽)的四维数组。这个操作是因为在深度学习中,通常把通道数放在第二个维度上,方便卷积计算。 5. 将处理后的训练集、验证集和测试集打包成一个字典,返回给调用者。 需要注意的是,这个函数中使用了load_CIFAR10函数,也就是另一个函数,用于从文件中加载CIFAR-10数据集。另外,这里的cifar10_dir变量指定了CIFAR-10数据集的路径,需要根据实际情况进行修改。
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根据以下代码,利用shap库写出绘制bar plot图的代码“def five_fold_train(x: pd.DataFrame, y: pd.DataFrame, model_class: type, super_parameters: dict = None, return_model=False): """ 5折交叉验证训练器 :param x: :param y: :param model_class: 学习方法类别,传入一个类型 :param super_parameters: 超参数 :param return_model: 是否返回每个模型 :return: list of [pred_y,val_y,auc,precision,recall] """ res = [] models = [] k_fold = KFold(5, random_state=456, shuffle=True) for train_index, val_index in k_fold.split(x, y): #即对数据进行位置索引,从而在数据表中提取出相应的数据 train_x, train_y, val_x, val_y = x.iloc[train_index], y.iloc[train_index], x.iloc[val_index], y.iloc[val_index] if super_parameters is None: super_parameters = {} model = model_class(**super_parameters).fit(train_x, train_y) pred_y = model.predict(val_x) auc = metrics.roc_auc_score(val_y, pred_y) precision = metrics.precision_score(val_y, (pred_y > 0.5) * 1) recall = metrics.recall_score(val_y, (pred_y > 0.5) * 1) res.append([pred_y, val_y, auc, precision, recall]) models.append(model) # print(f"fold: auc{auc} precision{precision} recall{recall}") if return_model: return res, models else: return res best_params = { "n_estimators": 500, "learning_rate": 0.05, "max_depth": 6, "colsample_bytree": 0.6, "min_child_weight": 1, "gamma": 0.7, "subsample": 0.6, "random_state": 456 } res, models = five_fold_train(x, y, XGBRegressor, super_parameters=best_params, return_model=True)”

def xgb_cv(max_depth, learning_rate, n_estimators, gamma, min_child_weight, subsample, colsample_bytree): date_x = pd.read_csv('Train_data1.csv') # Well logging data date_x.rename(columns={"TC": 'label'}, inplace=True) date_x.drop('Depth', axis=1, inplace=True) date_x.drop('MSFL', axis=1, inplace=True) date_x.drop('CNL', axis=1, inplace=True) date_x.drop('AC', axis=1, inplace=True) date_x.drop('GR', axis=1, inplace=True) data = date_x.iloc[2:42, :] label = data.iloc[:, 1:2] data2 = data.iloc[:, :7] train_x, test_x, train_y, test_y = train_test_split(data2, label, test_size=0.5, random_state=0) xgb_train = xgb.DMatrix(train_x, label=train_y) xgb_test = xgb.DMatrix(test_x, label=test_y) params = { 'eval_metric': 'rmse', 'max_depth': int(max_depth), 'learning_rate': learning_rate, 'n_estimators': int(n_estimators), 'gamma': gamma, 'min_child_weight': int(min_child_weight), 'subsample': subsample, 'colsample_bytree': colsample_bytree, 'n_jobs': -1, 'random_state': 42 } # 进行交叉验证 cv_result = xgb.cv(params, xgb_train, num_boost_round=100, early_stopping_rounds=10, stratified=False) return -1.0 * cv_result['test-rmse-mean'].iloc[-1] # 定义参数范围 pbounds = {'max_depth': (3, 10), 'learning_rate': (0.01, 0.3), 'n_estimators': (50, 200), 'gamma': (0, 10), 'min_child_weight': (1, 10), 'subsample': (0.5, 1), 'colsample_bytree': (0.1, 1)} # 进行贝叶斯优化,找到最优超参数 optimizer = BayesianOptimization(f=xgb_cv, pbounds=pbounds, random_state=42) optimizer.maximize(init_points=5, n_iter=25) # 输出最优结果 print(optimizer.max) model = xgb.train(optimizer.max, xgb_train) model.save_model("model3.xgb") return optimizer.max

data = pd.read_excel(‘C:/lydata/Traintest1.xlsx’) X = data.drop(‘HER2_G’, axis=1) y = data[‘HER2_G’] kf = KFold(n_splits=5, shuffle=True, random_state=42) accuracy_scores = [] precision_scores = [] recall_scores = [] f1_scores = [] auc_scores = [] total_confusion_matrix = np.zeros((len(np.unique(y)), len(np.unique(y))), dtype=int) rf = RandomForestClassifier(random_state=42, n_estimators=49, max_depth=4, class_weight=‘balanced’) rfe = RFE(rf, n_features_to_select=10) pipeline = Pipeline([ (‘smote’, SMOTE(k_neighbors=1,sampling_strategy=0.8, random_state=42)), (‘tomek’, TomekLinks()), (‘scaler’, StandardScaler()), (‘rfe’, rfe), (‘gb’, GradientBoostingClassifier( loss=‘log_loss’, learning_rate=0.03, n_estimators=1300, subsample=0.9, criterion=‘friedman_mse’, min_samples_split=2, min_samples_leaf=2, min_weight_fraction_leaf=0.0, max_depth=4, min_impurity_decrease=0.0, init=None, random_state=42, max_features=None, verbose=0, max_leaf_nodes=None, warm_start=True, validation_fraction=0.1, n_iter_no_change=None, tol=0.0001, ccp_alpha=0.0 )) ]) for train_index, test_index in kf.split(X): X_train, X_test = X.iloc[train_index], X.iloc[test_index] y_train, y_test = y.iloc[train_index], y.iloc[test_index] pipeline.fit(X_train, y_train) y_pred = pipeline.predict(X_test) y_proba = pipeline.predict_proba(X_test)[:, 1] accuracy_scores.append(accuracy_score(y_test, y_pred)) precision_scores.append(precision_score(y_test, y_pred)) recall_scores.append(recall_score(y_test, y_pred)) f1_scores.append(f1_score(y_test, y_pred)) auc_scores.append(roc_auc_score(y_test, y_proba)) cm = confusion_matrix(y_test, y_pred) total_confusion_matrix += cm accuracy = np.mean(accuracy_scores) precision = np.mean(precision_scores) recall = np.mean(recall_scores) f1 = np.mean(f1_scores) auc = np.mean(auc_scores) print(“Gradient Boosting 参数:”) print(pipeline.named_steps[‘gb’].get_params()) print(f"Gradient Boosting 平均 accuracy: {accuracy:.2f}“) print(f"Gradient Boosting 平均 precision: {precision:.2f}”) print(f"Gradient Boosting 平均 recall: {recall:.2f}“) print(f"Gradient Boosting 平均 F1 score: {f1:.2f}”) print(f"Gradient Boosting 平均 AUC score: {auc:.2f}“) print(“综合混淆矩阵:”) print(total_confusion_matrix) pipeline.fit(X, y) test_data = pd.read_excel(‘C:/lydata/Testtest1.xlsx’) X_test = test_data.drop(‘HER2_G’, axis=1) y_test = test_data[‘HER2_G’] y_test_pred = pipeline.predict(X_test) y_test_proba = pipeline.predict_proba(X_test)[:, 1] accuracy_test = accuracy_score(y_test, y_test_pred) precision_test = precision_score(y_test, y_test_pred) recall_test = recall_score(y_test, y_test_pred) f1_test = f1_score(y_test, y_test_pred) auc_test = roc_auc_score(y_test, y_test_proba) print(f"测试集 accuracy: {accuracy_test:.2f}”) print(f"测试集 precision: {precision_test:.2f}“) print(f"测试集 recall: {recall_test:.2f}”) print(f"测试集 F1 score: {f1_test:.2f}“) print(f"测试集 AUC score: {auc_test:.2f}”) cm_test = confusion_matrix(y_test, y_test_pred) print(“测试集混淆矩阵:”)特征工程交叉应该放在代码什么位置

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