ax = sns.scatterplot(x='log_Ruminococcaceae_Coriobacteriaceae', y='CDCA_TbMCA', hue="exposure_type", style='cycle', palette=['blue', 'red'], markers=['o', 'X'], s=100, data=log_ratios2) plt.legend(bbox_to_anchor=(1.05, 1), loc=2, borderaxespad=0.) #ax.axhline(0, color='lightgrey', ls='--') #ax.axvline(0, color='lightgrey', ls='--') plt.ylabel('Log10(CDCA/TbMCA)', fontsize=12) plt.xlabel('Log10(Rumino/Corio)', fontsize=12) plt.rcParams['font.family'] = 'sans-serif' plt.rcParams['font.sans-serif'] = 'Arial' plt.rcParams['svg.fonttype'] = 'none' plt.savefig('../figures/micro_metab_logratios_RCCT.svg', dpi=300, bbox_inches = "tight") plt.show() 解释一下这个代码
时间: 2024-01-09 11:04:17 浏览: 188
这段代码使用了Seaborn和Matplotlib库创建了一个散点图,并保存为SVG格式的文件。
首先,使用Seaborn的scatterplot函数创建散点图。其中,`x`参数和`y`参数分别指定了x轴和y轴的数据列,`hue`参数指定了颜色的分组列,`style`参数指定了样式的分组列。`palette`参数指定了颜色的调色板,`markers`参数指定了不同组别的标记符号,`s`参数指定了标记符号的大小,`data`参数指定了数据源。
然后,使用Matplotlib的plt.legend函数添加图例,并通过bbox_to_anchor参数和loc参数调整图例的位置。
接下来,使用plt.ylabel和plt.xlabel函数分别设置y轴和x轴的标签文字。之后,通过plt.rcParams设置字体相关的参数。
然后,使用plt.savefig函数将图形保存为SVG格式的文件,并指定了保存路径和dpi。
最后,调用plt.show函数显示图形。
根据代码中的注释,ax.axhline和ax.axvline这两行代码被注释掉了,所以在图形中没有显示水平和垂直的虚线。
这段代码的具体含义和效果可能还取决于输入数据和相关配置的具体设置。
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ax = sns.scatterplot(x='log_Ruminococcaceae_Verrucomicrobiaceae', y='log_Coriobacteriaceae_Verrucomicrobiaceae', hue="exposure_type", style='cycle', palette=['blue', 'red'], markers=['o', 'X'], data=log_ratios2) plt.legend(bbox_to_anchor=(1.05, 1), loc=2, borderaxespad=0.) ax.axhline(0, color='lightgrey', ls='--') ax.axvline(0, color='lightgrey', ls='--') plt.ylabel('Log10(Rumino/Corio)', fontsize=12) plt.xlabel('Log10(Rumino/Verruco)', fontsize=12) plt.rcParams['font.family'] = 'sans-serif' plt.rcParams['font.sans-serif'] = 'Arial' plt.rcParams['svg.fonttype'] = 'none' plt.savefig('../figures/micro_metab_logratios3.svg', dpi=300, bbox_inches = "tight") plt.show() 这段代码是什么意思
这段代码使用了Seaborn和Matplotlib库来生成一个散点图,并保存为SVG格式的文件。
首先,使用Seaborn的scatterplot函数创建散点图。其中,`x`参数和`y`参数分别指定了x轴和y轴的数据列,`hue`参数指定了颜色的分组列,`style`参数指定了样式的分组列。`palette`参数指定了颜色的调色板,`markers`参数指定了不同组别的标记符号。
然后,使用Matplotlib的plt.legend函数添加图例,并通过bbox_to_anchor参数和loc参数调整图例的位置。接下来,使用ax.axhline和ax.axvline函数分别添加水平和垂直的虚线。使用plt.ylabel和plt.xlabel函数分别设置y轴和x轴的标签文字。之后,通过plt.rcParams设置字体相关的参数。
最后,使用plt.savefig函数将图形保存为SVG格式的文件,并指定了保存路径和dpi。最后调用plt.show函数显示图形。
这段代码的具体含义和效果可能还取决于输入数据和相关配置的具体设置。
PCA_df = pd.DataFrame(PCAPipeline.fit_transform(X_train)) y_train.reset_index(drop=True, inplace=True) PCA_df = pd.concat([PCA_df, y_train], axis=1, ignore_index=True ) PCA_df.head(); plt.figure(figsize=(8,8)) sns.scatterplot(PCA_df[0],PCA_df[1],hue=PCA_df[3],palette=sns.color_palette("tab10", 2)) plt.show()
这段代码看起来像是使用PCA对训练数据进行降维,然后将降维后的数据和对应的标签合并成一个新的DataFrame,并画出散点图。其中,PCA_df是降维后的数据,X_train是原始数据,y_train是对应的标签,PCAPipeline是PCA模型的Pipeline。第一行代码使用fit_transform函数将训练数据进行降维,第二行代码将标签的索引重置并与降维后的数据进行合并,第三行代码画出散点图。
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