家蚕核型多角体病毒orf121基因克隆与非翻译区分析

"家蚕核型多角体病毒or f121克隆以及非翻译区分析 (2011年)" 这篇2011年的科研论文聚焦于家蚕核型多角体病毒（Bombyx mori nucleopolyhedrovirus, BmNPV）中的orf121基因。这个基因被认为与Ac145基因有同源性，并且属于杆状病毒的11K基因家族。尽管如此，orf121的具体功能在当时还未被完全揭示。研究者通过克隆orf121基因并分析其侧翼序列及转录时相，旨在增进对这个基因的理解。 首先，orf121基因的序列与GenBank上发布的T3株一致。orf121编码的蛋白质在N端具有一段高度疏水的氨基酸序列，这可能使其在细胞膜或其他脂质环境中发挥作用。而在C端，研究人员发现了一个几丁质结合域基序（C6基序），这暗示orf121可能参与几丁质相关的生物过程，如细胞壁构建或几丁质降解。 进一步的实验表明，orf121的转录活动在病毒感染后的6小时就能被检测到，并且持续到感染的晚期，这表明它可能是一个早期表达基因。早期基因通常在病毒感染初期即开始表达，对病毒的复制和宿主细胞的转化至关重要。 通过3' RACE（快速扩增cDNA末端）分析，研究者在orf121的终止密码子下游111个核苷酸处找到了一个AATAAA的加尾信号，这是一个常见的poly(A)尾巴的附加位点，对于mRNA的稳定性和翻译效率有着重要作用。同时，5' RACE（快速扩增cDNA5'末端）结果显示，orf121的转录起始位点位于起始密码子上游120bp处，这个位置对于理解基因的启动和调控机制非常重要。 这篇论文提供了orf121基因的详细特征，包括其结构、潜在功能和表达模式，这些信息有助于深入理解BmNPV的生命周期及其与宿主细胞相互作用的机制。对于未来开发针对家蚕核型多角体病毒的防治策略，这项研究具有基础性的科学价值。