BLAST-Viewer：Web应用可视化BLAST命令行输出

资源摘要信息:"BLAST-Viewer是一个专门设计的Web应用程序，用于在Web浏览器中以更加易读的格式可视化BLAST（Basic Local Alignment Search Tool）的输出结果。BLAST是一种用于比较生物序列（如基因序列）的工具，它通过搜索序列数据库来查找具有相似性的序列，广泛应用于分子生物学和生物信息学领域。 BLAST-Viewer程序的特点在于它提供了一个用户友好的界面，允许用户在不同的BLAST程序（例如BLASTP、BLASTN、BLASTX等）和NCBI（美国国家生物技术信息中心）提供的数据库之间进行选择，甚至可以使用用户自己的数据库进行序列相似性搜索。 BLAST-Viewer应用程序是使用Python和HTML语言开发的，并通过Flask框架组合在一起。Flask是一个用Python编写的轻量级Web应用框架，它基于Werkzeug和Jinja2实现，并允许开发者快速构建Web应用。该程序需要的Python版本为3.8.5，以及相关的库版本，比如pip 21.0.1。 为了安装BLAST-Viewer程序，用户需要使用pip（Python的包管理工具）来安装Flask和Biopython。Biopython是一个Python库，它提供了多种用于生物计算的工具和函数，包括与BLAST交互的接口。安装命令分别是`pip install Flask`和`pip install biopython`。此外，用户还需要下载并安装BLAST+可执行文件，具体步骤会根据用户使用的操作系统环境而有所不同。 程序的运行方式很简单，用户只需要在终端中输入命令`python blast-viewer.py`，即可启动BLAST-Viewer应用程序。启动后，用户可以通过Web界面进行操作，进行序列比对并可视化结果。 BLAST-Viewer的发布形式为一个压缩包文件，文件名称为BLAST-Viewer-main。用户下载该压缩包后，解压即可开始安装和使用程序。 总的来说，BLAST-Viewer是生物信息学研究中一个非常有用的工具，它简化了BLAST输出结果的可视化过程，使得非专业用户也能够更容易地理解和分析BLAST搜索结果。"