在Java中实现3D底图上灵活增加模型主要涉及使用Java3D库，这是一套强大的API，专为开发立体图形和交互式3D应用程序而设计。首先，你需要将Java3D库集成到你的项目中。如果你使用Maven，可以在项目的`pom.xml`文件中添加相应的依赖，如上面提供的`<dependency>`标签所示，引用`javax.media:j3d:1.3.1`版本。
创建一个Java程序，比如名为`Java3DSample`的类，用于构建和展示3D场景。这个过程包括以下几个步骤：
1. 初始化场景：创建一个`SimpleUniverse`对象，这是Java3D中的核心组件，负责管理3D视图和渲染。通过调用`new SimpleUniverse()`方法来实例化它。
2. 创建3D视图：创建一个`Canvas3D`对象，并将其添加到场景中。`canvas.setSize()`方法设置了窗口的大小，`setFullScreenWindow(true)`使窗口全屏显示。
3. 组织场景：使用`BranchGroup`来管理场景中的对象，这是一个层次结构容器，可以容纳多个3D模型。通过`new BranchGroup()`创建一个空的`BranchGroup`对象。
4. 创建3D底图：使用`Shape3D`类创建一个基础的3D底图，这里可能指的是一个平面或者地形。示例代码中的`createBottomPlane()`方法就是用来创建这样一个形状，可能通过`Primitive`或几何体类实现。
5. 增加模型：同样使用`Shape3D`类，但这里调用的是`createModel()`方法，该方法根据具体需求可以创建各种3D模型，如立方体、球体、圆柱体等。模型的细节、颜色、位置等可以通过`Color3f`和`Point3d`、`Vector3d`等向量类进行设置。
6. 将模型添加到场景：调用`branchGroup.addChild(model)`将模型添加到`BranchGroup`中，这样模型就会出现在底图上。
以上就是一个基本的流程，实际应用中可能还需要处理用户交互、灯光、纹理、动画等方面。通过灵活地组合和调整这些元素，你可以创建出丰富多彩的3D场景，使得模型能够在底图上自由移动、旋转或变形。这个示例只是入门级别的，高级应用通常需要更复杂的几何构造和渲染技术，以及对Java3D性能优化的理解。
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