python 保存dicom文件

使用Python可以使用pydicom库读取和保存DICOM文件。以下是一个简单的例子：

import pydicom

# 读取DICOM文件
dcm = pydicom.dcmread('example.dcm')

# 修改DICOM数据
dcm.PatientName = 'New Name'

# 保存修改后的DICOM文件
dcm.save_as('example_edited.dcm')

在这个例子中，我们使用`pydicom.dcmread`函数读取一个DICOM文件，然后修改了患者姓名，并使用`dcm.save_as`函数将修改后的DICOM文件保存到新文件中。注意，`dcm.save_as`函数会在保存文件时保留DICOM文件的元数据。

相关问题

python 写dicom文件

Python写DICOM文件需要使用`pydicom`库。以下是一个示例程序，说明如何使用pydicom库创建和保存DICOM文件。

import pydicom

# 创建一个DICOM数据对象
ds = pydicom.Dataset()
ds.PatientName = "John Doe"
ds.PatientID = "123456"

# 创建一个空的像素数据数组
pixels = numpy.zeros((512, 512), dtype=np.uint16)

# 设置DICOM图像信息
ds.Rows = pixels.shape[0]
ds.Columns = pixels.shape[1]
ds.PixelData = pixels.tobytes()

# 保存DICOM文件
ds.save_as("output.dcm")

print("DICOM文件已保存")

上述代码首先导入了`pydicom`库，然后创建了一个DICOM数据对象`ds`。通过设置对象的属性（如`PatientName`和`PatientID`）来为DICOM文件添加元数据。接下来，创建了一个空的像素数据数组，并将其设置为`ds`对象的`PixelData`属性。最后，使用`save_as()`方法将DICOM数据保存为文件。

请注意，确保在运行此代码之前，已经安装了`pydicom`库，并且可能需要导入其他必要的库（如`numpy`）。

这只是一个简单的示例，实际上，DICOM文件可能含有更多的元数据和复杂的像素数据。具体的文件内容和结构可以根据具体的需求进行创建和设置。

python 读取 dicom zip 文件

你可以使用pydicom库来读取和处理DICOM文件。下面是一个示例代码，演示了如何使用pydicom库来读取DICOM zip文件并将其转换为PNG文件：

import os
import pydicom
from pydicom.pixel_data_handlers.util import apply_voi_lut
from PIL import Image

# 定义DICOM文件所在的文件夹路径
dicom_folder = 'path/to/dicom/folder'

# 遍历文件夹中的所有文件
for file_name in os.listdir(dicom_folder):
    # 检查文件是否为zip文件
    if file_name.endswith('.zip'):
        # 解压缩zip文件
        zip_file_path = os.path.join(dicom_folder, file_name)
        unzip_folder = os.path.splitext(zip_file_path)[0]
        os.makedirs(unzip_folder, exist_ok=True)
        os.system(f'unzip {zip_file_path} -d {unzip_folder}')

        # 遍历解压缩后的文件夹中的所有文件
        for dicom_file_name in os.listdir(unzip_folder):
            dicom_file_path = os.path.join(unzip_folder, dicom_file_name)
            # 读取DICOM文件
            ds = pydicom.dcmread(dicom_file_path)

            # 提取像素数据
            pixel_array = ds.pixel_array

            # 应用VOI LUT
            if 'VOILUTSequence' in ds:
                voi_lut = ds.VOILUTSequence[0]
                pixel_array = apply_voi_lut(pixel_array, voi_lut)

            # 将像素数据转换为图像
            image = Image.fromarray(pixel_array)

            # 保存为PNG文件
            png_file_path = os.path.join(unzip_folder, f'{dicom_file_name}.png')
            image.save(png_file_path)

        # 删除解压缩后的文件夹
        os.system(f'rm -r {unzip_folder}')

这段代码首先遍历DICOM文件所在的文件夹，找到所有的zip文件。然后，它会解压缩每个zip文件，并遍历解压缩后的文件夹中的所有DICOM文件。对于每个DICOM文件，它会使用pydicom库读取文件，并提取像素数据。然后，它会应用VOI LUT（如果有的话），将像素数据转换为图像，并将图像保存为PNG文件。

请注意，你需要将代码中的`'path/to/dicom/folder'`替换为你实际的DICOM文件所在的文件夹路径。