遍历文件夹中所有nii格式文件，针对每个文件，遍历所有图层，找到最大面积图层，打印该图层在第几层，然后，获取该图层中外接正方形的四个顶点坐标，并打印这些坐标，需要代码

好的，以下是代码示例：

import os
import nibabel as nib
import numpy as np

# 遍历文件夹中所有nii格式文件
def get_nii_files(root_path):
    nii_list = []
    for root, dirs, files in os.walk(root_path):
        for file in files:
            if file.endswith('.nii'):
                nii_list.append(os.path.join(root, file))
    return nii_list

# 获取nii文件中最大面积图层及其顶点坐标
def get_max_area_layer(nii_path):
    nii_img = nib.load(nii_path)
    nii_data = nii_img.get_data()
    max_area = 0
    max_layer = 0
    max_extrema = None
    for i in range(nii_data.shape[2]): # 遍历所有图层
        layer = nii_data[:,:,i]
        layer_contours = cv2.findContours(layer.astype(np.uint8), cv2.RETR_EXTERNAL, cv2.CHAIN_APPROX_SIMPLE)
        if len(layer_contours)>0:
            contour_area = cv2.contourArea(layer_contours[0][0])
            if contour_area > max_area: # 找到最大面积图层
                max_area = contour_area
                max_layer = i
                rect = cv2.minAreaRect(layer_contours[0][0])
                box = cv2.boxPoints(rect)
                box = np.int0(box)
                max_extrema = box.tolist() # 获取外接正方形的四个顶点坐标
    return max_layer, max_extrema

if __name__ == '__main__':
    root_path = '/path/to/root/folder'
    nii_files = get_nii_files(root_path)
    for nii_file in nii_files:
        max_layer, max_extrema = get_max_area_layer(nii_file)
        print(nii_file, max_layer, max_extrema)

这段代码可以遍历指定根目录下所有的nii格式文件，对于每个文件，找到最大面积图层并打印该图层在第几层，然后获取该图层中外接正方形的四个顶点坐标并打印出来。