批量转换nii.gz文件为nii格式
时间: 2024-10-19 10:06:00 浏览: 173
批量转换.nii.gz(压缩版的NIFTI文件)为.nii(未压缩格式)通常涉及到解压并重新保存原始数据。这个过程可以用一些通用的编程语言(如Python)或者特定的图像处理工具来完成,比如FSL(FMRIB Software Library)、AFNI或者直接在SPM中操作。
以下是使用Python和 nibabel 库的一个简单示例:
```python
import os
from nibabel import load, save
# 设置源文件夹和目标文件夹
source_folder = 'path/to/your/nii.gz/folder'
target_folder = 'path/to/save/uncompressed/nii'
if not os.path.exists(target_folder):
os.makedirs(target_folder)
# 遍历文件夹内的.nii.gz文件
for file in os.listdir(source_folder):
if file.endswith('.nii.gz'):
# 加载.nii.gz文件
img_nifti_gz = load(os.path.join(source_folder, file))
# 解压并保存为.nii格式
img_nifti = img_nifti_gz.dataobj
new_file_name = file[:-7] # 删除gz后缀
save(img_nifti, os.path.join(target_folder, new_file_name + '.nii'))
```
运行这段脚本前,请确保已经安装了`nibabel`库 (`pip install nibabel`)。
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