samtools mpileup 默认使用进程数量
时间: 2023-07-22 08:52:28 浏览: 185
cpup:将mpileup格式转换为基本计数tsv表
`samtools mpileup`命令默认使用单个进程来处理输入的序列比对文件。在处理大型数据集时,单个进程可能会导致计算时间过长。因此,你可以使用`samtools mpileup`命令的`-@`选项来指定使用的进程数量,以加快计算速度。
如果你没有使用`-@`选项来限制使用的进程数量,则`samtools mpileup`命令将会自动检测计算机的处理器核心数,并使用相应数量的进程来处理输入文件。例如,如果计算机有8个处理器核心,则`samtools mpileup`命令将默认使用8个进程来处理输入文件。但是,在某些情况下,限制使用的进程数量可能会更加稳定和可靠。
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