# 获取第三列之后的所有列 cols_Factor_424 = sample_424[2:] # 将列转换为float格式 sample_424[cols_Factor_424] = sample_424[cols_Factor_424].astype(float)

时间: 2024-02-01 20:03:10 浏览: 69
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pandas pivot_table() 按日期分多列数据的方法

这段代码的作用是获取 DataFrame `sample_424` 的第三列及其后的所有列,并将这些列的数据类型转换为浮点型(float)。 首先,使用`sample_424[2:]`获取第三列及其后的所有列,将其赋值给变量`cols_Factor_424`。这里用到了 Pandas 中的切片(Slicing)操作,`sample_424[2:]`相当于获取`sample_424`的第三列及其后的所有列,因为 DataFrame 中的列是按照列的索引(从0开始)排序的。 接下来,使用`astype(float)`将`cols_Factor_424`中的所有列的数据类型转换为浮点型。`astype()`函数可以将 DataFrame 或 Series 中的数据类型转换为指定的类型,这里将其转换为浮点型。
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PCA_Plot_3=function (data,Annotation,VAR,Color) { # logcountdata row:genes,column: samples pca <- prcomp(data) pca_out<-as.data.frame(pca$x) df_out<- pca_out %>%tibble::rownames_to_column(var=VAR) %>% left_join(., Annotation) #df_out<- merge (pca_out,Annotation,by.x=0,by.y=0) # label_color<- factor(df_out[,group]) ggplot(df_out,aes_string(x="PC1",y="PC2")) +geom_point(aes_string(colour = Color)) } Deseq2_Deseq_function_2=function (Countdata,Coldata) { dds_fil <- DESeq2:: DESeqDataSetFromMatrix(countData =Countdata, colData = Coldata, design = ~Group) dds_fil_Deg<- DESeq2::DESeq(dds_fil) return(dds_fil_Deg) } pheatmap_singscore=function (pathways,data,Annotation) { Gene_select_anno= data[,colnames(data) %in% pathways] %>%t()%>%.[,rownames(Annotation)] # return(Gene_select_anno) # Anno_expression_data=Gene_select_anno[,c("SYMBOL",Group_select)] %>% as.data.frame() %>% distinct() %>% na.omit() # rownames(Anno_expression_data)=Anno_expression_data[,"SYMBOL"] # Annotation=group_anno["Gene_type"] # input= Anno_expression_data[,Group_select] # F2_pheatmap <- pheatmap::pheatmap(input, cellwigermline calling GATKdth = 10, cellheight = 12, scale = "row", # treeheight_row = 5, # show_rownames = T,show_colnames = T, # annotation_col= Annotation, # # annotation_row=Annotation, # annotation_legend=Label_def, # cluster_rows = T, cluster_cols = F,clustering_distance_rows = "euclidean") pheatmap::pheatmap(Gene_select_anno, cellwigermline=5, cellheight = 10,cellwidth = 10, scale = "row", treeheight_row = 5, show_rownames = T,show_colnames = F, annotation_col= Annotation, # annotation_row=Annotation, #annotation_legend=Label_def, cluster_rows = T, cluster_cols = F,clustering_distance_rows = "euclidean") } matrix.please<-function(x) { m<-as.matrix(x[,-1]) rownames(m)<-x[,1] m } 这是r语言的代码,告诉我每一条代码的作用和意义

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