from sklearn.model_selection import KFold kf = KFold(n_splits=5) for k, (train_index, test_index) in enumerate(kf.split(train)): train_data,test_data,train_target,test_target = train.values[train_index],train.values[test_index],target[train_index],target[test_index] clf = SGDRegressor(max_iter=1000, tol=1e-3) clf.fit(train_data, train_target) score_train = mean_squared_error(train_target, clf.predict(train_data)) score_test = mean_squared_error(test_target, clf.predict(test_data)) print(k, " 折", "SGDRegressor train MSE: ", score_train) print(k, " 折", "SGDRegressor test MSE: ", score_test, '\n')

时间: 2023-12-24 09:31:33 浏览: 194
这段代码使用了`sklearn`库中的`KFold`进行交叉验证,并且在每一折中使用了`SGDRegressor`进行模型训练和评估。 在循环中,首先根据当前折的训练集和测试集的索引获取对应的训练数据和测试数据。然后,创建了一个`SGDRegressor`对象,并使用训练数据进行模型训练。接着,分别计算了训练数据和测试数据上的均方误差(MSE)作为模型的评估指标。 最后,打印了当前折数、训练集上的MSE和测试集上的MSE。 这段代码的作用是使用随机梯度下降回归器(SGDRegressor)对数据集进行交叉验证,并输出每一折的训练集和测试集上的MSE值。 如果你有更多关于这段代码的问题,或者需要进一步的帮助,请随时提问。
相关问题

请指出下列python代码的错误并改正。from sklearn.metrics import confusion_matrix from sklearn.model_selection import KFold from sklearn.model_selection import train_test_split from sklearn.linear_model import LogisticRegression kf = KFold(n_splits=3) accuracy_rate=[] cm=[] for train_index, test_index in kf.split(data): dataX_train = x[train_index] dataX_test=x[test_index] dataY_train = y[train_index] dataY_test=y[test_index] model = LogisticRegression() model.fit(dataX_train, dataY_train.astype('int')) # print(model.predict(dataX_test)) # print(dataY_test.tolist()) accuracy_rate.append(sum(model.predict(dataX_test)==dataY_test.tolist())/len(dataY_test)) cm.append(confusion_matrix(y_true=dataY_test, y_pred=model.predict(dataX_test)).T)

这段代码缺少了要导入的库和相关数据。需要根据具体情况添加和修改代码。另外,在定义 model 时需要加上缩进。 修改后的代码如下: ``` import numpy as np from sklearn.metrics import confusion_matrix from sklearn.model_selection import KFold from sklearn.model_selection import train_test_split from sklearn.linear_model import LogisticRegression data = np.array([[1,2],[3,4],[5,6],[7,8],[9,10],[11,12]]) x = data[:,0:1] y = data[:,1] kf = KFold(n_splits=3) accuracy_rate=[] cm=[] for train_index, test_index in kf.split(data): dataX_train = x[train_index] dataX_test = x[test_index] dataY_train = y[train_index] dataY_test = y[test_index] model = LogisticRegression() model.fit(dataX_train, dataY_train.astype('int')) ```

逐行解释下面的代码:from sklearn.datasets import load_breast_cancer from sklearn.model_selection import train_test_split, GridSearchCV, KFold from sklearn.ensemble import RandomForestClassifier data = load_breast_cancer() X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(data.data, data.target, test_size=0.3, random_state=42) kf = KFold(n_splits=5, shuffle=True, random_state=42) param_grid = {'n_estimators': range(1, 21, 1), 'max_depth': range(5, 16)} rf = RandomForestClassifier(random_state=42) grid_search = GridSearchCV(rf, param_grid=param_grid, cv=kf, n_jobs=-1) grid_search.fit(X_train, y_train) best_rf = RandomForestClassifier(n_estimators=grid_search.best_params_['n_estimators'], max_depth=grid_search.best_params_['max_depth'], random_state=42) best_rf.fit(X_train, y_train) y_pred = best_rf.predict(X_test)

这段代码的作用是使用随机森林算法对乳腺癌数据集进行分类,并找到最佳的模型参数。 首先,代码从sklearn.datasets库中导入了load_breast_cancer函数和从sklearn.model_selection库中导入了train_test_split、GridSearchCV和KFold函数以及从sklearn.ensemble库中导入了RandomForestClassifier类。 然后,代码调用load_breast_cancer()函数来加载乳腺癌数据集。接着,使用train_test_split函数将数据集分成训练集和测试集。其中,test_size参数指定测试集所占比例为30%,random_state参数用于设置随机数种子,以确保每次运行代码时得到的结果相同。 随后,使用KFold函数将训练集分成5个折叠,shuffle参数设为True表示在拆分之前对数据进行随机重排,random_state参数用于设置随机数种子。 接下来,定义一个字典param_grid,其中包含了随机森林算法的两个参数:n_estimators和max_depth。n_estimators参数表示随机森林中决策树的数量,max_depth参数表示每个决策树的最大深度。param_grid的取值范围分别为1到20和5到15。 然后,创建一个RandomForestClassifier类的实例rf,将其作为参数传递给GridSearchCV函数,用于在给定的参数空间中搜索最佳的参数组合。cv参数指定使用的交叉验证策略,n_jobs参数指定使用的CPU数量。 接着,调用fit方法来训练模型并搜索最佳参数组合,将结果存储在grid_search对象中。 接下来,创建一个新的RandomForestClassifier类的实例best_rf,使用grid_search.best_params_字典中的最佳参数组合来初始化该实例,并将其用于训练数据。最后,使用best_rf.predict方法对测试数据进行预测,将结果存储在y_pred变量中。
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#导入所需库 import numpy as np import pandas as pd from sklearn.preprocessing import LabelEncoder from keras.utils import to_categorical from keras.models import Sequential from keras.layers import Dense from sklearn.model_selection import KFold #读入数据 train_data = pd.read_csv('ProSeqs_Train.txt', delimiter=' ', header=None) test_data = pd.read_csv('ProSeqs_Test.txt', delimiter=' ', header=None) #预处理训练集数据 X = train_data.iloc[:, 2:].values y = train_data.iloc[:, 1].values le = LabelEncoder() y = le.fit_transform(y) y = to_categorical(y) #定义模型 model = Sequential() model.add(Dense(64, input_dim=X.shape[1], activation='relu')) model.add(Dense(32, activation='relu')) model.add(Dense(2, activation='softmax')) model.compile(loss='categorical_crossentropy', optimizer='adam', metrics=['accuracy']) #K折交叉验证训练模型 kf = KFold(n_splits=5, shuffle=True, random_state=42) fold_scores = [] for train_index, valid_index in kf.split(X): train_X, train_y = X[train_index], y[train_index] valid_X, valid_y = X[valid_index], y[valid_index] model.fit(train_X, train_y, validation_data=(valid_X, valid_y), epochs=50, batch_size=32, verbose=2) fold_scores.append(model.evaluate(valid_X, valid_y, verbose=0)[1]) print('KFold cross-validation accuracy: {:.2f}%'.format(np.mean(fold_scores) * 100)) #预处理测试集数据 test_X = test_data.iloc[:, 1:].values #预测测试集结果 preds = model.predict(test_X) preds = np.argmax(preds, axis=1) #保存预测结果至文件中 np.savetxt('preds.txt', preds, fmt='%d') #输出预测结果 print('Predictions:') print(preds)该蛋白质功能预测实验涉及分类模型的理论基础

以下这段代码是关于CatBoost模型的超参数调整,但里面好像不是在五倍交叉验证下做的分析,请问应该怎么加上五倍交叉验证呢?import os import time import pandas as pd from catboost import CatBoostRegressor from hyperopt import fmin, hp, partial, Trials, tpe,rand from sklearn.metrics import r2_score, mean_squared_error from sklearn.model_selection import train_test_split from sklearn.model_selection import KFold, cross_val_score as CVS, train_test_split as TTS 自定义hyperopt的参数空间 space = {"iterations": hp.choice("iterations", range(1, 30)), "depth": hp.randint("depth", 16), "l2_leaf_reg": hp.randint("l2_leaf_reg", 222), "border_count": hp.randint("border_count", 222), 'learning_rate': hp.uniform('learning_rate', 0.001, 0.9), } data = pd.read_csv(r"E:\exercise\synthesis\synthesis_dummy_2.csv") #验证随机森林填补缺失值方法是否有效 X = data.iloc[:,1:] y = data.iloc[:,0] Xtrain,Xtest,Ytrain,Ytest = TTS(X_wrapper,y,test_size=0.2,random_state=100) def epoch_time(start_time, end_time): elapsed_secs = end_time - start_time elapsed_mins = elapsed_secs / 60 return elapsed_mins, elapsed_secs 自动化调参并训练 def cat_factory(argsDict): estimator = CatBoostRegressor(loss_function='RMSE', random_seed=22, learning_rate=argsDict['learning_rate'], iterations=argsDict['iterations'], l2_leaf_reg=argsDict['l2_leaf_reg'], border_count=argsDict['border_count'], depth=argsDict['depth'], verbose=0) estimator.fit(Xtrain, Ytrain) val_pred = estimator.predict(Xtest) mse = mean_squared_error(Ytest, val_pred) return mse

修改代码,使得输出结果是可重复的:# 定义模型参数 input_dim = X_train.shape[1] epochs = 100 batch_size = 32 learning_rate = 0.01 dropout_rate = 0.7 # 定义模型结构 def create_model(): model = Sequential() model.add(Dense(64, input_dim=input_dim, activation='relu')) model.add(Dropout(dropout_rate)) model.add(Dense(32, activation='relu')) model.add(Dropout(dropout_rate)) model.add(Dense(1, activation='sigmoid')) optimizer = Adam(learning_rate=learning_rate) model.compile(loss='binary_crossentropy', optimizer=optimizer, metrics=['accuracy']) return model # 5折交叉验证 kf = KFold(n_splits=5, shuffle=True, random_state=42) cv_scores = [] for train_index, test_index in kf.split(X_train): # 划分训练集和验证集 X_train_fold, X_val_fold = X_train.iloc[train_index], X_train.iloc[test_index] y_train_fold, y_val_fold = y_train_forced_turnover_nolimited.iloc[train_index], y_train_forced_turnover_nolimited.iloc[test_index] # 创建模型 model = create_model() # 定义早停策略 #early_stopping = EarlyStopping(monitor='val_loss', patience=10, verbose=1) # 训练模型 model.fit(X_train_fold, y_train_fold, validation_data=(X_val_fold, y_val_fold), epochs=epochs, batch_size=batch_size,verbose=1) # 预测验证集 y_pred = model.predict(X_val_fold) # 计算AUC指标 auc = roc_auc_score(y_val_fold, y_pred) cv_scores.append(auc) # 输出交叉验证结果 print('CV AUC:', np.mean(cv_scores)) # 在全量数据上重新训练模型 model = create_model() model.fit(X_train, y_train_forced_turnover_nolimited, epochs=epochs, batch_size=batch_size, verbose=1) #测试集结果 test_pred = model.predict(X_test) test_auc = roc_auc_score(y_test_forced_turnover_nolimited, test_pred) test_f1_score = f1_score(y_test_forced_turnover_nolimited, np.round(test_pred)) test_accuracy = accuracy_score(y_test_forced_turnover_nolimited, np.round(test_pred)) print('Test AUC:', test_auc) print('Test F1 Score:', test_f1_score) print('Test Accuracy:', test_accuracy) #训练集结果 train_pred = model.predict(X_train) train_auc = roc_auc_score(y_train_forced_turnover_nolimited, train_pred) train_f1_score = f1_score(y_train_forced_turnover_nolimited, np.round(train_pred)) train_accuracy = accuracy_score(y_train_forced_turnover_nolimited, np.round(train_pred)) print('Train AUC:', train_auc) print('Train F1 Score:', train_f1_score) print('Train Accuracy:', train_accuracy)

纠正代码:trainsets = pd.read_csv('/Users/zhangxinyu/Desktop/trainsets82.csv') testsets = pd.read_csv('/Users/zhangxinyu/Desktop/testsets82.csv') y_train_forced_turnover_nolimited = trainsets['m3_forced_turnover_nolimited'] X_train = trainsets.drop(['m3_P_perf_ind_all_1','m3_P_perf_ind_all_2','m3_P_perf_ind_all_3','m3_P_perf_ind_allind_1',\ 'm3_P_perf_ind_allind_2','m3_P_perf_ind_allind_3','m3_P_perf_ind_year_1','m3_P_perf_ind_year_2',\ 'm3_P_perf_ind_year_3','m3_forced_turnover_nolimited','m3_forced_turnover_3mon',\ 'm3_forced_turnover_6mon','m3_forced_turnover_1year','m3_forced_turnover_3year',\ 'm3_forced_turnover_5year','m3_forced_turnover_10year',\ 'CEOid','CEO_turnover_N','year','Firmid','appo_year'],axis=1) y_test_forced_turnover_nolimited = testsets['m3_forced_turnover_nolimited'] X_test = testsets.drop(['m3_P_perf_ind_all_1','m3_P_perf_ind_all_2','m3_P_perf_ind_all_3','m3_P_perf_ind_allind_1',\ 'm3_P_perf_ind_allind_2','m3_P_perf_ind_allind_3','m3_P_perf_ind_year_1','m3_P_perf_ind_year_2',\ 'm3_P_perf_ind_year_3','m3_forced_turnover_nolimited','m3_forced_turnover_3mon',\ 'm3_forced_turnover_6mon','m3_forced_turnover_1year','m3_forced_turnover_3year',\ 'm3_forced_turnover_5year','m3_forced_turnover_10year',\ 'CEOid','CEO_turnover_N','year','Firmid','appo_year'],axis=1) # 定义模型参数 input_dim = X.shape[1] epochs = 100 batch_size = 32 lr = 0.001 dropout_rate = 0.5 # 定义模型结构 def create_model(): model = Sequential() model.add(Dense(64, input_dim=input_dim, activation='relu')) model.add(Dropout(dropout_rate)) model.add(Dense(32, activation='relu')) model.add(Dropout(dropout_rate)) model.add(Dense(1, activation='sigmoid')) optimizer = Adam(lr=lr) model.compile(loss='binary_crossentropy', optimizer=optimizer, metrics=['accuracy']) return model # 5折交叉验证 kf = KFold(n_splits=5, shuffle=True, random_state=42) cv_scores = [] for train_index, test_index in kf.split(X): # 划分训练集和验证集 X_train, X_val = X[train_index], X[test_index] y_train, y_val = y[train_index], y[test_index] # 创建模型 model = create_model() # 定义早停策略 early_stopping = EarlyStopping(monitor='val_loss', patience=10, verbose=1) # 训练模型 model.fit(X_train, y_train, validation_data=(X_val, y_val), epochs=epochs, batch_size=batch_size, callbacks=[early_stopping], verbose=1) # 预测验证集 y_pred = model.predict(X_val) # 计算AUC指标 auc = roc_auc_score(y_val, y_pred) cv_scores.append(auc) # 输出交叉验证结果 print('CV AUC:', np.mean(cv_scores)) # 在全量数据上重新训练模型 model = create_model() model.fit(X, y, epochs=epochs, batch_size=batch_size, verbose=1)

#预测因子(海温) #nino3.4赤道东太平洋(190-220,-5-5) a22=sst_djf.sel(lon=slice(190,220),lat=slice(5,-5)).mean(axis=1).mean(axis=1) a2=(a22-a22.mean())/a22.std() #赤道印度洋(50-80,-5-5) a33=sst_djf.sel(lon=slice(50,100),lat=slice(5,-5)).mean(axis=1).mean(axis=1) a3=(a33-a33.mean())/a33.std() #预测因子(环流场) #南欧(30-40,35-45) b11=hgt_djf.sel(lon=slice(30,40),lat=slice(45,35)).mean(axis=1).mean(axis=1) b1=(b11-b11.mean())/b11.std() #太平洋副高(120-180,-10-10) b22=hgt_djf.sel(lon=slice(120,180),lat=slice(10,-10)).mean(axis=1).mean(axis=1) b2=(b22-b22.mean())/b22.std() #印度洋(60-80,-10-10) b33=hgt_djf.sel(lon=slice(60,80),lat=slice(10,-10)).mean(axis=1).mean(axis=1) b3=(b33-b33.mean())/b33.std() x=np.vstack([(a2,a3,b1,b2,b3)]).T x2=np.vstack([(a2,b1)]).T y=pre_standard #多元线性回归 res=np.linalg.lstsq(x,y,rcond=None) n=res[0] ##各项系数 y_fit=(n.T*x).sum(axis=1) #拟合数据 res2=np.linalg.lstsq(x2,y,rcond=None) n2=res2[0] ##各项系数 y_fit2=(n2.T*x2).sum(axis=1) #拟合数据 #可视化 time=np.arange(1961,2017,1) fig = plt.figure(figsize=[16, 5]) ax = fig.add_subplot() ax.plot(time, y,marker='o', color='gray', markersize=5) ax.plot(time, y_fit,marker='*', color='b', markersize=5) ax.plot(time, y_fit2,marker='^', color='r', markersize=5) ax.set_title('model',fontsize=20,fontweight='bold') ax.set_xlabel('Time') ax.set_ylabel('Pre') plt.legend(['Source data','Fitted1','Fitted2'],frameon=False,loc='best') plt.show()选做剔除一年的交叉检验,独立试报

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MATLAB在AWS上的自动化部署与运行指南

资源摘要信息:"AWS上的MATLAB是MathWorks官方提供的参考架构,旨在简化用户在Amazon Web Services (AWS) 上部署和运行MATLAB的流程。该架构能够让用户自动执行创建和配置AWS基础设施的任务,并确保可以在AWS实例上顺利运行MATLAB软件。为了使用这个参考架构,用户需要拥有有效的MATLAB许可证,并且已经在AWS中建立了自己的账户。 具体的参考架构包括了分步指导,架构示意图以及一系列可以在AWS环境中执行的模板和脚本。这些资源为用户提供了详细的步骤说明,指导用户如何一步步设置和配置AWS环境,以便兼容和利用MATLAB的各种功能。这些模板和脚本是自动化的,减少了手动配置的复杂性和出错概率。 MathWorks公司是MATLAB软件的开发者,该公司提供了广泛的技术支持和咨询服务,致力于帮助用户解决在云端使用MATLAB时可能遇到的问题。除了MATLAB,MathWorks还开发了Simulink等其他科学计算软件,与MATLAB紧密集成,提供了模型设计、仿真和分析的功能。 MathWorks对云环境的支持不仅限于AWS,还包括其他公共云平台。用户可以通过访问MathWorks的官方网站了解更多信息,链接为www.mathworks.com/cloud.html#PublicClouds。在这个页面上,MathWorks提供了关于如何在不同云平台上使用MATLAB的详细信息和指导。 在AWS环境中,用户可以通过参考架构自动化的模板和脚本,快速完成以下任务: 1. 创建AWS资源:如EC2实例、EBS存储卷、VPC(虚拟私有云)和子网等。 2. 配置安全组和网络访问控制列表(ACLs),以确保符合安全最佳实践。 3. 安装和配置MATLAB及其相关产品,包括Parallel Computing Toolbox、MATLAB Parallel Server等,以便利用多核处理和集群计算。 4. 集成AWS服务,如Amazon S3用于存储,AWS Batch用于大规模批量处理,Amazon EC2 Spot Instances用于成本效益更高的计算任务。 此外,AWS上的MATLAB架构还包括了监控和日志记录的功能,让用户能够跟踪和分析运行状况,确保应用程序稳定运行。用户还可以根据自己的需求自定义和扩展这些模板和脚本。 在使用AWS上的MATLAB之前,用户需要了解MathWorks的许可协议,明确自己的许可证是否允许在云环境中使用MATLAB,并确保遵守相关法律法规。MathWorks提供了广泛的资源和支持,帮助用户快速上手,有效利用AWS资源,以及在云端部署和扩展MATLAB应用程序。 综上所述,AWS上的MATLAB参考架构是为希望在AWS云平台上部署MATLAB的用户提供的一种快速、简便的解决方案。它不仅减少了手动配置的复杂性,还为用户提供了广泛的资源和指导,以确保用户能够在云环境中高效、安全地使用MATLAB。"