tcga中diagnosis_id代表什么
时间: 2024-03-29 18:40:50 浏览: 113
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TCGA(The Cancer Genome Atlas)中的diagnosis_id代表病理诊断编号,是对参与研究的肿瘤样本进行分类的标识符。它是由TCGA病理学家通过病理分析和组织学检查来确定的,用于标识每个样本的肿瘤类型和分级。
TCGA的diagnosis_id是一个由数字和字母组成的编码,通常包括肿瘤类型、组织来源、性别、年龄等信息。例如,“01”表示原发肿瘤,“02”表示继发肿瘤,“03”表示转移肿瘤,“06”表示白血病,“07”表示淋巴瘤等等。同时,还会结合其他信息,如病人的性别和年龄,肿瘤的具体位置和大小等,来更加准确地描述肿瘤的类型和性质。
在TCGA数据分析中,diagnosis_id可以用于筛选和比较不同肿瘤类型和亚型之间的基因表达、突变、CNV等差异,为深入了解肿瘤发生和发展的机制提供了重要的线索。
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