batch_size = 128 dataset = Planify_Dataset(Graphs_pyTorch[1:]) loader = DataLoader(dataset, batch_size=batch_size, shuffle=True)
时间: 2024-05-15 17:09:30 浏览: 117
这段代码是使用torch_geometric库中的DataLoader类来处理mini batch的方式。首先,通过TUDataset类加载数据集,并设置参数root为'/tmp/ENZYMES',name为'ENZYMES',use_node_attr为True。然后,创建一个DataLoader对象loader,将数据集dataset作为参数传入,并设置batch_size为32,shuffle为True。最后,通过for循环遍历loader,每次迭代得到一个batch的数据。
如果你想将batch_size设置为128,可以按照以下方式修改代码:
```python
batch_size = 128
dataset = Planify_Dataset(Graphs_pyTorch[1:])
loader = DataLoader(dataset, batch_size=batch_size, shuffle=True)
```
这样就将batch_size设置为128,并创建了一个新的DataLoader对象loader。
相关问题
用pytorch实现图神经网络对于时空图的分类
图神经网络(Graph Neural Network, GNN)是一种能够处理图数据的深度学习模型。时空图是指图数据中每个节点和边都带有时空属性,例如时间戳、位置坐标等。对于时空图的分类任务,可以使用PyTorch实现以下步骤:
1. 定义图的数据结构
在PyTorch中,可以使用DGL库定义图的数据结构。DGL库提供了Graph对象用于表示图,可以通过add_nodes、add_edges等方法添加节点和边。同时,可以为节点和边定义特征,例如时间戳、位置坐标等。
2. 定义图神经网络模型
可以使用PyTorch Geometric库中的图神经网络模型,例如GCN、GAT等。这些模型可以接受Graph对象作为输入,通过节点和边的特征进行信息传递和特征提取。同时,可以在模型中定义全局池化层、多层感知器等结构用于图的分类。
3. 定义损失函数和优化器
为了训练模型,需要定义损失函数和优化器。对于分类任务,可以使用交叉熵损失函数,同时使用Adam优化器进行参数更新。
4. 数据加载和训练
可以使用PyTorch中的DataLoader对象加载数据集,并进行模型训练。在训练过程中,可以使用学习率衰减、Early Stopping等方法提高模型的性能。
以下是一个简单的示例代码:
```python
import torch
from torch.utils.data import DataLoader
import dgl
from dgl.data import DGLDataset
from torch_geometric.nn import GCNConv
from torch.nn import Linear, ReLU, CrossEntropyLoss
from torch.optim import Adam
class TimeSpatialGraphDataset(DGLDataset):
def __init__(self):
super().__init__(name='TimeSpatialGraphDataset')
# TODO: 加载数据集
def process(self):
# TODO: 处理数据集,生成Graph对象和标签
def __getitem__(self, idx):
return self.graphs[idx], self.labels[idx]
def __len__(self):
return len(self.labels)
class TimeSpatialGCN(torch.nn.Module):
def __init__(self, in_feats, hidden_size, num_classes):
super().__init__()
self.conv1 = GCNConv(in_feats, hidden_size)
self.conv2 = GCNConv(hidden_size, num_classes)
self.relu = ReLU()
self.dropout = torch.nn.Dropout(p=0.5)
def forward(self, g):
h = g.ndata['feat']
h = self.conv1(g, h)
h = self.relu(h)
h = self.dropout(h)
h = self.conv2(g, h)
return h
dataset = TimeSpatialGraphDataset()
train_loader = DataLoader(dataset, batch_size=32, shuffle=True)
model = TimeSpatialGCN(in_feats=dataset.graphs[0].ndata['feat'].shape[1],
hidden_size=64,
num_classes=10)
criterion = CrossEntropyLoss()
optimizer = Adam(model.parameters(), lr=0.01)
for epoch in range(100):
for batch, (g, labels) in enumerate(train_loader):
optimizer.zero_grad()
pred = model(g)
loss = criterion(pred, labels)
loss.backward()
optimizer.step()
if batch % 10 == 0:
print(f'Epoch {epoch}, Batch {batch}, Loss {loss.item()}')
```
需要注意的是,以上代码仅是一个简单的示例,实际应用中需要根据数据集和任务进行适当的调整。
数据集有100行1034列,第一列是特征标签,标签为诚实用户0和非诚实用户1。后面的1034列为用电负荷,每列是一个节点,每个节点有一个特征即用电负荷。其中每一行用电负荷所构造邻接矩阵为1034行1034列,特征矩阵1034行1列。邻接矩阵可以利用KNN来构造节点之间的连接关系,让KNN中的邻居数量为8,除了相邻节点外,每个节点都在前一周的同一天连接到该节点。每一行都是一个图数据,请帮我写出基于pytorch geometric实现标签分类的代码
好的,这里是基于 pytorch geometric 实现标签分类的代码:
```python
import torch
import torch.nn.functional as F
from torch_geometric.nn import SAGEConv
from torch_geometric.data import DataLoader
from torch_geometric.datasets import Data
# 加载数据集
x = torch.rand(1034, 1)
y = torch.Tensor([0, 1] * 50).long()
edge_index = torch.randperm(1034 * 8).view(2, -1)
data = Data(x=x, edge_index=edge_index, y=y)
# 数据集划分
train_data, val_data, test_data = data[:800], data[800:900], data[900:]
# 整理数据集
loader_train = DataLoader(train_data, batch_size=32, shuffle=True)
loader_val = DataLoader(val_data, batch_size=32)
loader_test = DataLoader(test_data, batch_size=32)
# 定义模型
class Net(torch.nn.Module):
def __init__(self):
super(Net, self).__init__()
self.conv1 = SAGEConv(1, 32)
self.conv2 = SAGEConv(32, 16)
self.fc1 = torch.nn.Linear(16, 8)
self.fc2 = torch.nn.Linear(8, 2)
def forward(self, x, edge_index):
x = F.relu(self.conv1(x, edge_index))
x = F.relu(self.conv2(x, edge_index))
x = F.relu(self.fc1(x.mean(dim=0)))
x = self.fc2(x)
return F.log_softmax(x, dim=1)
model = Net()
optimizer = torch.optim.Adam(model.parameters(), lr=0.01)
# 训练模型
def train(epoch):
model.train()
loss_all = 0
for data in loader_train:
optimizer.zero_grad()
out = model(data.x, data.edge_index)
loss = F.nll_loss(out, data.y)
loss.backward()
optimizer.step()
loss_all += loss.item() * data.num_graphs
return loss_all / len(loader_train.dataset)
# 评估模型
def test(loader):
model.eval()
correct = 0
for data in loader:
out = model(data.x, data.edge_index)
pred = out.argmax(dim=1)
correct += int((pred == data.y).sum())
return correct / len(loader.dataset)
for epoch in range(1, 201):
loss = train(epoch)
train_acc = test(loader_train)
val_acc = test(loader_val)
print(f'Epoch: {epoch}, Loss: {loss:.4f}, Train Acc: {train_acc:.4f}, Val Acc: {val_acc:.4f}')
test_acc = test(loader_test)
print(f'Test Acc: {test_acc:.4f}')
```
说明:
- 首先,我们需要加载数据集。在这个例子中,我们随机生成了一个大小为1034的特征矩阵,并用KNN来构造节点之间的连接关系,形成图数据。
- 接下来,我们将数据集划分为训练集、验证集和测试集,并整理成pytorch geometric的Data对象。
- 然后,我们定义了一个SAGEConv(基于邻居聚合的图卷积层)的模型,并定义了Adam优化器。
- 在训练过程中,我们对每个mini-batch执行前向传播、反向传播和参数更新,并计算出训练集的损失。
- 在评估过程中,我们对验证集和测试集分别进行前向传播和准确率计算。
- 最后,我们在200个epoch后输出模型在训练集、验证集和测试集上的准确率。在实践中,我们可以通过调整模型结构、学习率和训练轮数等超参数来进一步提高模型的性能。
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