batch_size = 128 dataset = Planify_Dataset(Graphs_pyTorch[1:]) loader = DataLoader(dataset, batch_size=batch_size, shuffle=True)

时间: 2024-05-15 17:09:30 浏览: 117
这段代码是使用torch_geometric库中的DataLoader类来处理mini batch的方式。首先,通过TUDataset类加载数据集,并设置参数root为'/tmp/ENZYMES',name为'ENZYMES',use_node_attr为True。然后,创建一个DataLoader对象loader,将数据集dataset作为参数传入,并设置batch_size为32,shuffle为True。最后,通过for循环遍历loader,每次迭代得到一个batch的数据。 如果你想将batch_size设置为128,可以按照以下方式修改代码: ```python batch_size = 128 dataset = Planify_Dataset(Graphs_pyTorch[1:]) loader = DataLoader(dataset, batch_size=batch_size, shuffle=True) ``` 这样就将batch_size设置为128,并创建了一个新的DataLoader对象loader。
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用pytorch实现图神经网络对于时空图的分类

图神经网络(Graph Neural Network, GNN)是一种能够处理图数据的深度学习模型。时空图是指图数据中每个节点和边都带有时空属性,例如时间戳、位置坐标等。对于时空图的分类任务,可以使用PyTorch实现以下步骤: 1. 定义图的数据结构 在PyTorch中,可以使用DGL库定义图的数据结构。DGL库提供了Graph对象用于表示图,可以通过add_nodes、add_edges等方法添加节点和边。同时,可以为节点和边定义特征,例如时间戳、位置坐标等。 2. 定义图神经网络模型 可以使用PyTorch Geometric库中的图神经网络模型,例如GCN、GAT等。这些模型可以接受Graph对象作为输入,通过节点和边的特征进行信息传递和特征提取。同时,可以在模型中定义全局池化层、多层感知器等结构用于图的分类。 3. 定义损失函数和优化器 为了训练模型,需要定义损失函数和优化器。对于分类任务,可以使用交叉熵损失函数,同时使用Adam优化器进行参数更新。 4. 数据加载和训练 可以使用PyTorch中的DataLoader对象加载数据集,并进行模型训练。在训练过程中,可以使用学习率衰减、Early Stopping等方法提高模型的性能。 以下是一个简单的示例代码: ```python import torch from torch.utils.data import DataLoader import dgl from dgl.data import DGLDataset from torch_geometric.nn import GCNConv from torch.nn import Linear, ReLU, CrossEntropyLoss from torch.optim import Adam class TimeSpatialGraphDataset(DGLDataset): def __init__(self): super().__init__(name='TimeSpatialGraphDataset') # TODO: 加载数据集 def process(self): # TODO: 处理数据集,生成Graph对象和标签 def __getitem__(self, idx): return self.graphs[idx], self.labels[idx] def __len__(self): return len(self.labels) class TimeSpatialGCN(torch.nn.Module): def __init__(self, in_feats, hidden_size, num_classes): super().__init__() self.conv1 = GCNConv(in_feats, hidden_size) self.conv2 = GCNConv(hidden_size, num_classes) self.relu = ReLU() self.dropout = torch.nn.Dropout(p=0.5) def forward(self, g): h = g.ndata['feat'] h = self.conv1(g, h) h = self.relu(h) h = self.dropout(h) h = self.conv2(g, h) return h dataset = TimeSpatialGraphDataset() train_loader = DataLoader(dataset, batch_size=32, shuffle=True) model = TimeSpatialGCN(in_feats=dataset.graphs[0].ndata['feat'].shape[1], hidden_size=64, num_classes=10) criterion = CrossEntropyLoss() optimizer = Adam(model.parameters(), lr=0.01) for epoch in range(100): for batch, (g, labels) in enumerate(train_loader): optimizer.zero_grad() pred = model(g) loss = criterion(pred, labels) loss.backward() optimizer.step() if batch % 10 == 0: print(f'Epoch {epoch}, Batch {batch}, Loss {loss.item()}') ``` 需要注意的是,以上代码仅是一个简单的示例,实际应用中需要根据数据集和任务进行适当的调整。

数据集有100行1034列,第一列是特征标签,标签为诚实用户0和非诚实用户1。后面的1034列为用电负荷,每列是一个节点,每个节点有一个特征即用电负荷。其中每一行用电负荷所构造邻接矩阵为1034行1034列,特征矩阵1034行1列。邻接矩阵可以利用KNN来构造节点之间的连接关系,让KNN中的邻居数量为8,除了相邻节点外,每个节点都在前一周的同一天连接到该节点。每一行都是一个图数据,请帮我写出基于pytorch geometric实现标签分类的代码

好的,这里是基于 pytorch geometric 实现标签分类的代码: ```python import torch import torch.nn.functional as F from torch_geometric.nn import SAGEConv from torch_geometric.data import DataLoader from torch_geometric.datasets import Data # 加载数据集 x = torch.rand(1034, 1) y = torch.Tensor([0, 1] * 50).long() edge_index = torch.randperm(1034 * 8).view(2, -1) data = Data(x=x, edge_index=edge_index, y=y) # 数据集划分 train_data, val_data, test_data = data[:800], data[800:900], data[900:] # 整理数据集 loader_train = DataLoader(train_data, batch_size=32, shuffle=True) loader_val = DataLoader(val_data, batch_size=32) loader_test = DataLoader(test_data, batch_size=32) # 定义模型 class Net(torch.nn.Module): def __init__(self): super(Net, self).__init__() self.conv1 = SAGEConv(1, 32) self.conv2 = SAGEConv(32, 16) self.fc1 = torch.nn.Linear(16, 8) self.fc2 = torch.nn.Linear(8, 2) def forward(self, x, edge_index): x = F.relu(self.conv1(x, edge_index)) x = F.relu(self.conv2(x, edge_index)) x = F.relu(self.fc1(x.mean(dim=0))) x = self.fc2(x) return F.log_softmax(x, dim=1) model = Net() optimizer = torch.optim.Adam(model.parameters(), lr=0.01) # 训练模型 def train(epoch): model.train() loss_all = 0 for data in loader_train: optimizer.zero_grad() out = model(data.x, data.edge_index) loss = F.nll_loss(out, data.y) loss.backward() optimizer.step() loss_all += loss.item() * data.num_graphs return loss_all / len(loader_train.dataset) # 评估模型 def test(loader): model.eval() correct = 0 for data in loader: out = model(data.x, data.edge_index) pred = out.argmax(dim=1) correct += int((pred == data.y).sum()) return correct / len(loader.dataset) for epoch in range(1, 201): loss = train(epoch) train_acc = test(loader_train) val_acc = test(loader_val) print(f'Epoch: {epoch}, Loss: {loss:.4f}, Train Acc: {train_acc:.4f}, Val Acc: {val_acc:.4f}') test_acc = test(loader_test) print(f'Test Acc: {test_acc:.4f}') ``` 说明: - 首先,我们需要加载数据集。在这个例子中,我们随机生成了一个大小为1034的特征矩阵,并用KNN来构造节点之间的连接关系,形成图数据。 - 接下来,我们将数据集划分为训练集、验证集和测试集,并整理成pytorch geometric的Data对象。 - 然后,我们定义了一个SAGEConv(基于邻居聚合的图卷积层)的模型,并定义了Adam优化器。 - 在训练过程中,我们对每个mini-batch执行前向传播、反向传播和参数更新,并计算出训练集的损失。 - 在评估过程中,我们对验证集和测试集分别进行前向传播和准确率计算。 - 最后,我们在200个epoch后输出模型在训练集、验证集和测试集上的准确率。在实践中,我们可以通过调整模型结构、学习率和训练轮数等超参数来进一步提高模型的性能。
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