python中层次聚类结果
时间: 2023-12-11 11:08:57 浏览: 189
python中层次聚类法.docx
在Python中,可以使用SciPy库中的`scipy.cluster.hierarchy`模块进行层次聚类并得到聚类结果。具体步骤如下:
1. 构建距离矩阵:使用`scipy.spatial.distance.pdist()`函数计算每对样本之间的距离,并将它们存储在距离矩阵中。
2. 进行层次聚类:使用`scipy.cluster.hierarchy.linkage()`函数,输入距离矩阵和连接方式(如Ward、single、complete等),得到聚类树。
3. 可视化聚类树:使用`scipy.cluster.hierarchy.dendrogram()`函数,输入聚类树和一些参数(如标签、颜色等),得到可视化的聚类树。
4. 划分聚类簇:使用`scipy.cluster.hierarchy.fcluster()`函数,输入聚类树、距离阈值和一些参数,得到最终的聚类结果。
下面是一个简单的示例代码,展示如何使用SciPy进行层次聚类并得到聚类结果:
```python
import numpy as np
from scipy.spatial.distance import pdist
from scipy.cluster.hierarchy import linkage, dendrogram, fcluster
# 构造样本数据
X = np.random.rand(10, 2)
# 计算距离矩阵
dist_mat = pdist(X)
# 进行层次聚类
Z = linkage(dist_mat, method='ward')
# 可视化聚类树
dendrogram(Z)
# 划分聚类簇
labels = fcluster(Z, t=2, criterion='distance')
print(labels)
```
在这个示例中,我们首先生成了10个二维随机样本,然后计算了它们之间的距离矩阵。接着使用Ward连接方式进行层次聚类,并将得到的聚类树可视化。最后,我们使用距离阈值为2的方式划分聚类簇,并输出聚类结果。
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