import flowio import pandas as pd import os import csv # 设置输入和输出文件夹 input_folder = "D:/test_data_Fcs/" output_folder = "D:/test_data_Fcs/" # 遍历输入文件夹中的所有fcs文件 for filename in os.listdir(input_folder): if filename.endswith(".fcs"): # 从fcs文件中读取数据 fcs = flowio.FlowData(os.path.join(input_folder, filename)) events = fcs.events() # 将数据转换为pandas DataFrame df = pd.DataFrame(events) # 将DataFrame保存为csv文件 output_filename = os.path.join(output_folder, filename[:-4] + ".csv") df.to_csv(output_filename, index=False)出错:array.array' object is not callable
时间: 2024-03-21 22:40:59 浏览: 16
根据你提供的代码,我发现你没有在脚本开头导入 `numpy` 库,而 `flowio` 库的 `events()` 函数返回的是 `numpy.ndarray` 类型,需要使用 `numpy` 库的函数进行处理。因此,你需要在脚本开头导入 `numpy` 库,例如:`import numpy as np`。然后,你需要将 `events` 转换为 `pandas.DataFrame` 类型前,对它进行处理,代码如下:
```python
import flowio
import pandas as pd
import numpy as np
import os
import csv
# 设置输入和输出文件夹
input_folder = "D:/test_data_Fcs/"
output_folder = "D:/test_data_Fcs/"
# 遍历输入文件夹中的所有fcs文件
for filename in os.listdir(input_folder):
if filename.endswith(".fcs"):
# 从fcs文件中读取数据
fcs = flowio.FlowData(os.path.join(input_folder, filename))
# 处理events
events = fcs.events()
events = np.array(events.tolist())
# 将数据转换为pandas DataFrame
df = pd.DataFrame(events)
# 将DataFrame保存为csv文件
output_filename = os.path.join(output_folder, filename[:-4] + ".csv")
df.to_csv(output_filename, index=False)
```
这样就可以避免 `'array.array' object is not callable` 的问题了。