sim_mat_norm = np.zeros([len(all_sentences_words), len(all_sentences_words)]) for i in range(len(all_sentences_words)): for j in range(len(all_sentences_words)): if i != j: _len = len(all_sentences_words[i]) sim_mat_norm[i][j] = \ cosine_similarity(sentence_vectors[i].reshape(1, 300), sentence_vectors[j].reshape(1, 300))[ 0, 0] / _len nx_graph_norm = nx.from_numpy_array(sim_mat_norm)

时间: 2023-06-19 16:03:05 浏览: 90
这段代码的作用是构建一个词向量的余弦相似度矩阵,并将其转化为图结构。具体来说,它做了以下几个步骤: 1. 构建一个大小为(len(all_sentences_words), len(all_sentences_words))的零矩阵sim_mat_norm,用于存储所有句子两两之间的余弦相似度。 2. 对于每一对不同的句子i和j,计算它们的余弦相似度。这里使用了cosine_similarity函数,它可以计算两个向量之间的余弦相似度。 3. 将余弦相似度除以句子i的长度,得到一个归一化的相似度。这是为了避免长句子在相似度计算中占据过大的比重。 4. 将所有计算出来的相似度填入sim_mat_norm矩阵中。 5. 使用from_numpy_array函数将sim_mat_norm转化为一个图结构nx_graph_norm。这里使用了networkx库,它可以方便地构建、操作和可视化各种图结构。
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def create_laplacian_dict(self): # 拉普拉斯字典 def symmetric_norm_lap(adj): # rowsum = np.array(adj.sum(axis=1)) d_inv_sqrt = np.power(rowsum, -0.5).flatten() d_inv_sqrt[np.isinf(d_inv_sqrt)] = 0 d_mat_inv_sqrt = sp.diags(d_inv_sqrt) norm_adj = d_mat_inv_sqrt.dot(adj).dot(d_mat_inv_sqrt) return norm_adj.tocoo() def random_walk_norm_lap(adj): # 传入邻接矩阵 rowsum = np.array(adj.sum(axis=1)) # 行总和 d_inv = np.power(rowsum, -1.0).flatten() d_inv[np.isinf(d_inv)] = 0 d_mat_inv = sp.diags(d_inv) norm_adj = d_mat_inv.dot(adj) return norm_adj.tocoo() # 归一化的邻接稀疏矩阵 if self.laplacian_type == 'symmetric': # 解释器默认的是random—walk norm_lap_func = symmetric_norm_lap elif self.laplacian_type == 'random-walk': norm_lap_func = random_walk_norm_lap # 拉普拉斯的功能就用这个 else: raise NotImplementedError self.laplacian_dict = {} for r, adj in self.adjacency_dict.items(): self.laplacian_dict[r] = norm_lap_func(adj) A_in = sum(self.laplacian_dict.values()) self.A_in = self.convert_coo2tensor(A_in.tocoo())

可以看出这段代码是用来创建拉普拉斯字典的。其中使用了两种不同的归一化方法,分别是对称归一化和随机游走归一化。如果选择对称归一化,就使用函数symmetric_norm_lap,如果选择随机游走归一化,就使用函数random_walk_norm_lap。然后遍历邻接矩阵字典,对每一个邻接矩阵都进行相应的归一化操作,最后将所有的归一化邻接矩阵相加,得到A_in,并将其转换为张量格式。

N = len(RV_5min) - 1 RV_real_pred = np.zeros(N+1) RV_real_uub = np.zeros(N+1) RV_real_llb = np.zeros(N+1) RV_real_pred[0] = RV_5min[0] RV_real_uub[0] = RV_5min[0] RV_real_llb[0] = RV_5min[0] alpha=0.05 z_alpha = norm.ppf(1-alpha/2) for i in range(N): RV_real_pred[i+1] = c + beta*RV_5min[i] RV_real_uub[i+1] = RV_real_pred[i+1] + z_alpha*np.sqrt(np.var(RV_diff))*np.sqrt(1+beta**2) RV_real_llb[i+1] = RV_real_pred[i+1] - z_alpha*np.sqrt(np.var(RV_diff))*np.sqrt(1+beta**2) plt.plot(RV_5.index, np.maximum(0, RV_real_pred), 'k:') plt.plot(RV_5.index, np.maximum(0, RV_real_uub), 'r--', RV_5.index, np.maximum(0, RV_real_llb), 'r--') plt.xlabel('Time') plt.ylabel('RV') plt.legend(['Predicted', 'Upper Bound', 'Lower Bound']) plt.show() 画图x和y的长度不一样怎么改

为了绘制图形,确保x和y的长度一致,可以使用相同的时间轴作为x轴。假设RV_5min.index是时间轴,可以将其作为x轴,而RV_5min作为y轴。请注意,RV_5min和RV_diff的长度可能不同,因此需要相应调整。 下面是修正后的代码: ```python N = len(RV_5min) - 1 RV_real_pred = np.zeros(N+1) RV_real_uub = np.zeros(N+1) RV_real_llb = np.zeros(N+1) RV_real_pred[0] = RV_5min[0] RV_real_uub[0] = RV_5min[0] RV_real_llb[0] = RV_5min[0] alpha=0.05 z_alpha = norm.ppf(1-alpha/2) for i in range(N): RV_real_pred[i+1] = c + beta*RV_5min[i] RV_real_uub[i+1] = RV_real_pred[i+1] + z_alpha*np.sqrt(np.var(RV_5min))*np.sqrt(1+beta**2) RV_real_llb[i+1] = RV_real_pred[i+1] - z_alpha*np.sqrt(np.var(RV_5min))*np.sqrt(1+beta**2) plt.plot(RV_5min.index, np.maximum(0, RV_real_pred), 'k:') plt.plot(RV_5min.index, np.maximum(0, RV_real_uub), 'r--', RV_5min.index, np.maximum(0, RV_real_llb), 'r--') plt.xlabel('Time') plt.ylabel('RV') plt.legend(['Predicted', 'Upper Bound', 'Lower Bound']) plt.show() ``` 这样修改后,x轴和y轴的长度应该一致,可以正确地绘制图形。
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Traceback (most recent call last): File "ADF.py", line 18, in <module> atoms.set_calculator(SinglePointCalculator(atoms, energy=0, forces=np.zeros((len(atoms), 3)), stress=np.zeros(6), neighborlist=nl)) File "/export/home/anliying/.local/lib/python3.8/site-packages/ase-3.22.1-py3.8.egg/ase/calculators/singlepoint.py", line 22, in init assert property in all_properties AssertionError。import numpy as np from ase.io import read from ase.build import make_supercell from ase.visualize import view from ase.neighborlist import NeighborList from ase.calculators.singlepoint import SinglePointCalculator # 读入三个POSCAR文件,计算原子分布函数 structures = [] for file in ['structure1.cif', 'structure2.cif', 'structure3.cif']: atoms = read(file) # 构造超胞,避免周期性边界对ADF计算的影响 atoms = make_supercell(atoms, [[2, 0, 0], [0, 2, 0], [0, 0, 2]]) # 计算邻居列表 nl = NeighborList([1.2] * len(atoms), self_interaction=False) nl.update(atoms) # 将邻居列表传递给SinglePointCalculator atoms.set_calculator(SinglePointCalculator(atoms, energy=0, forces=np.zeros((len(atoms), 3)), stress=np.zeros(6), neighborlist=nl)) # 计算原子分布函数 adf = atoms.get_atomic_distribution_function() structures.append(adf) # 将ADF转化为特征矩阵 bins = np.linspace(0, 10, num=100) # 分100个bin adf_hists = [np.histogram(adf, bins=bins)[0] for adf in structures] feature_matrix = np.array(adf_hists) / [len(atoms) for atoms in structures] # 归一化特征矩阵 feature_matrix = feature_matrix / np.linalg.norm(feature_matrix, axis=1, keepdims=True),基于错误改代码

import numpy as np from sklearn import datasets from sklearn.linear_model import LinearRegression np.random.seed(10) class Newton(object): def init(self,epochs=50): self.W = None self.epochs = epochs def get_loss(self, X, y, W,b): """ 计算损失 0.5sum(y_pred-y)^2 input: X(2 dim np.array):特征 y(1 dim np.array):标签 W(2 dim np.array):线性回归模型权重矩阵 output:损失函数值 """ #print(np.dot(X,W)) loss = 0.5np.sum((y - np.dot(X,W)-b)2) return loss def first_derivative(self,X,y): """ 计算一阶导数g = (y_pred - y)*x input: X(2 dim np.array):特征 y(1 dim np.array):标签 W(2 dim np.array):线性回归模型权重矩阵 output:损失函数值 """ y_pred = np.dot(X,self.W) + self.b g = np.dot(X.T, np.array(y_pred - y)) g_b = np.mean(y_pred-y) return g,g_b def second_derivative(self,X,y): """ 计算二阶导数 Hij = sum(X.T[i]X.T[j]) input: X(2 dim np.array):特征 y(1 dim np.array):标签 output:损失函数值 """ H = np.zeros(shape=(X.shape[1],X.shape[1])) H = np.dot(X.T, X) H_b = 1 return H, H_b def fit(self, X, y): """ 线性回归 y = WX + b拟合,牛顿法求解 input: X(2 dim np.array):特征 y(1 dim np.array):标签 output:拟合的线性回归 """ self.W = np.random.normal(size=(X.shape[1])) self.b = 0 for epoch in range(self.epochs): g,g_b = self.first_derivative(X,y) # 一阶导数 H,H_b = self.second_derivative(X,y) # 二阶导数 self.W = self.W - np.dot(np.linalg.pinv(H),g) self.b = self.b - 1/H_bg_b print("itration:{} ".format(epoch), "loss:{:.4f}".format( self.get_loss(X, y , self.W,self.b))) def predict(): """ 需要自己实现的代码 """ pass def normalize(x): return (x - np.min(x))/(np.max(x) - np.min(x)) if name == "main": np.random.seed(2) X = np.random.rand(100,5) y = np.sum(X3 + X**2,axis=1) print(X.shape, y.shape) # 归一化 X_norm = normalize(X) X_train = X_norm[:int(len(X_norm)*0.8)] X_test = X_norm[int(len(X_norm)*0.8):] y_train = y[:int(len(X_norm)0.8)] y_test = y[int(len(X_norm)0.8):] # 牛顿法求解回归问题 newton=Newton() newton.fit(X_train, y_train) y_pred = newton.predict(X_test,y_test) print(0.5np.sum((y_test - y_pred)**2)) reg = LinearRegression().fit(X_train, y_train) y_pred = reg.predict(X_test) print(0.5np.sum((y_test - y_pred)**2)) ——修改代码中的问题,并补全缺失的代码,实现牛顿最优化算法

from transformers import pipeline, BertTokenizer, BertModel import numpy as np import torch import jieba tokenizer = BertTokenizer.from_pretrained('bert-base-chinese') model = BertModel.from_pretrained('bert-base-chinese') ner_pipeline = pipeline('ner', model='bert-base-chinese') with open('output/weibo1.txt', 'r', encoding='utf-8') as f: data = f.readlines() def cosine_similarity(v1, v2): return np.dot(v1, v2) / (np.linalg.norm(v1) * np.linalg.norm(v2)) def get_word_embedding(word): input_ids = tokenizer.encode(word, add_special_tokens=True) inputs = torch.tensor([input_ids]) outputs = model(inputs)[0][0][1:-1] word_embedding = np.mean(outputs.detach().numpy(), axis=0) return word_embedding def get_privacy_word(seed_word, data): privacy_word_list = [] seed_words = jieba.lcut(seed_word) jieba.load_userdict('data/userdict.txt') for line in data: words = jieba.lcut(line.strip()) ner_results = ner_pipeline(''.join(words)) for seed_word in seed_words: seed_word_embedding = get_word_embedding(seed_word) for ner_result in ner_results: if ner_result['word'] == seed_word and ner_result['entity'] == 'O': continue if ner_result['entity'] != seed_word: continue word = ner_result['word'] if len(word) < 3: continue word_embedding = get_word_embedding(word) similarity = cosine_similarity(seed_word_embedding, word_embedding) print(similarity, word) if similarity >= 0.6: privacy_word_list.append(word) privacy_word_set = set(privacy_word_list) return privacy_word_set 上述代码运行之后,结果为空集合,哪里出问题了,帮我修改一下

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