在linux终端可以通过RNAfold-v使用相关功能,但是python中无法import RNA
时间: 2024-03-08 15:49:46 浏览: 109
Advances in long noncoding RNAs: identification, structure prediction and function annotation.
如果你在Linux终端中已经可以使用RNAfold-v,但在Python中无法导入RNA模块,可能是因为你缺少相关的Python绑定。你需要安装RNA Python绑定,才能在Python中使用RNAfold-v的相关功能。
RNA Python绑定有两个版本:ViennaRNA Python绑定和RNAstructure Python绑定。如果你使用的是ViennaRNA,可以使用以下命令安装ViennaRNA Python绑定:
```
sudo apt-get install python3-pip libviennarna-dev
sudo pip3 install viennarna
```
如果你使用的是RNAstructure,可以使用以下命令安装RNAstructure Python绑定:
```
sudo apt-get install python3-pip librna-dev
sudo pip3 install RNAstructure
```
安装完成后,在Python中导入RNA模块即可使用RNAfold-v的相关功能。例如:
```python
import RNA
# 使用RNAfold-v进行RNA二级结构预测
seq = "AUGCUGAUAGUC"
(ss, mfe) = RNA.fold(seq)
print(ss)
print(mfe)
```
希望这可以帮助到你。
阅读全文