edges_attrs = torch.ones(data.edge_index.size(0))这行代码什么意思
时间: 2024-04-20 17:25:02 浏览: 16
这行代码的意思是创建了一个名为`edges_attrs`的张量,其长度与`data.edge_index`的行数相同,并且每个元素都被设置为1。`data.edge_index`表示图数据中的边索引,而`torch.ones()`函数用于创建一个元素都为1的张量。因此,这行代码的目的是初始化一个与图中边数相同的张量,用于存储每条边的属性值。
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data = Data(**data.__dict__) edges_attrs = torch.ones(data.edge_index.size(0)) data_set = DataLoader([Data(x = data.x.cuda(), edge_index = data.edge_index.cuda().t(), y = y.cuda(), edge_attr = edges_attrs.cuda().unsqueeze(-1))], batch_size=1, shuffle = True) 这段代码什么意思,解释各个变量
这段代码是用于数据处理和准备数据集的部分。让我逐个解释各个变量的含义:
1. `data = Data(**data.__dict__)`:这行代码创建了一个新的`Data`对象`data`,并使用原始`data`对象的属性来初始化它。这样做是为了获得一个完全相同的副本,以便在后续处理中进行修改,而不会影响原始数据。
2. `edges_attrs = torch.ones(data.edge_index.size(0))`:这行代码创建了一个张量`edges_attrs`,其长度与`data.edge_index`的行数相同,并填充为1。这个张量用于表示边的属性,每条边都被赋予了相同的属性值1。
3. `data_set = DataLoader([Data(x=data.x.cuda(), edge_index=data.edge_index.cuda().t(), y=y.cuda(), edge_attr=edges_attrs.cuda().unsqueeze(-1))], batch_size=1, shuffle=True)`:这行代码创建了一个`DataLoader`对象`data_set`,用于加载数据集。其中,`[Data(...)]`表示一个数据列表,列表中包含一个`Data`对象,该对象包含了经过处理后的特征数据`x`、边索引数据`edge_index`、目标标签数据`y`和边属性数据`edge_attr`。这些数据都被转移到GPU上进行计算(通过`.cuda()`方法)。`batch_size=1`表示每次迭代只加载一个样本,而`shuffle=True`表示每次加载数据时进行随机洗牌。
总体来说,这段代码的作用是将原始数据复制一份并进行一些处理,然后将处理后的数据放入一个数据加载器中,以便后续的模型训练或其他处理。
import networkx as nx from neo4j import GraphDatabase from torch_geometric.data import Data # Connect to Neo4j database driver = GraphDatabase.driver(uri, auth=(username, password)) # Define a Cypher query to retrieve nodes and relationships from Neo4j query = """ MATCH (n)-[r]->(m) RETURN id(n) AS source, id(m) AS target, type(r) AS edge_type, labels(n) AS source_labels, labels(m) AS target_labels, properties(n) AS source_props, properties(m) AS target_props """ # Execute the query and retrieve the results with driver.session() as session: results = session.run(query) # Convert the query results to a NetworkX graph graph = nx.MultiDiGraph() for record in results: graph.add_edge(record['source'], record['target'], key=record['edge_type'], source_labels=record['source_labels'], target_labels=record['target_labels'], source_props=record['source_props'], target_props=record['target_props']) # Convert the NetworkX graph to a PyTorch Geometric Data object x = [] edge_index = [] edge_attr = [] for node in graph.nodes(): node_attrs = [] for label in graph.nodes[node]['labels']: node_attrs.append(label) for prop in graph.nodes[node]['source_props']: node_attrs.append(prop) x.append(node_attrs) for source, target, data in graph.edges(keys=True, data=True): edge_index.append([source, target]) edge_attrs = [] for label in data['source_labels']: edge_attrs.append(label) for prop in data['properties']: edge_attrs.append(prop) edge_attr.append(edge_attrs) data = Data(x=torch.tensor(x), edge_index=torch.tensor(edge_index).t().contiguous(), edge_attr=torch.tensor(edge_attr))详细注释
这段代码的作用是从一个Neo4j数据库中检索节点和关系,将它们转化为一个PyTorch Geometric Data对象。以下是代码的详细注释:
```python
# 导入所需的包
import networkx as nx
from neo4j import GraphDatabase
from torch_geometric.data import Data
# 连接到Neo4j数据库
driver = GraphDatabase.driver(uri, auth=(username, password))
# 定义一个Cypher查询语句,用于从Neo4j数据库中检索节点和关系。
query = """
MATCH (n)-[r]->(m)
RETURN id(n) AS source, id(m) AS target, type(r) AS edge_type,
labels(n) AS source_labels, labels(m) AS target_labels,
properties(n) AS source_props, properties(m) AS target_props
"""
# 执行查询并检索结果
with driver.session() as session:
results = session.run(query)
# 将查询结果转化为一个NetworkX图
graph = nx.MultiDiGraph()
for record in results:
graph.add_edge(record['source'], record['target'], key=record['edge_type'],
source_labels=record['source_labels'], target_labels=record['target_labels'],
source_props=record['source_props'], target_props=record['target_props'])
# 将NetworkX图转化为一个PyTorch Geometric Data对象
x = []
edge_index = []
edge_attr = []
# 遍历图中的每个节点,将节点的属性存储在x列表中
for node in graph.nodes():
node_attrs = []
for label in graph.nodes[node]['labels']:
node_attrs.append(label)
for prop in graph.nodes[node]['source_props']:
node_attrs.append(prop)
x.append(node_attrs)
# 遍历图中的每条边,将边的属性存储在edge_index和edge_attr列表中
for source, target, data in graph.edges(keys=True, data=True):
edge_index.append([source, target])
edge_attrs = []
for label in data['source_labels']:
edge_attrs.append(label)
for prop in data['properties']:
edge_attrs.append(prop)
edge_attr.append(edge_attrs)
# 创建一个PyTorch Geometric Data对象
data = Data(x=torch.tensor(x), edge_index=torch.tensor(edge_index).t().contiguous(),
edge_attr=torch.tensor(edge_attr))
```
这段代码的主要步骤包括:
1. 首先,连接到一个Neo4j数据库。
2. 然后,定义一个Cypher查询语句来检索节点和关系。
3. 执行查询,并将结果转化为一个NetworkX图。
4. 遍历图中的每个节点,将节点的属性存储在x列表中。
5. 遍历图中的每条边,将边的属性存储在edge_index和edge_attr列表中。
6. 最后,创建一个PyTorch Geometric Data对象,其中包含节点属性x、边属性edge_attr和边索引edge_index。
这段代码的目的是将一个Neo4j图转化为一个PyTorch Geometric Data对象,以便进行图神经网络的训练和推理。