如何在Windows系统上将nii.gz转换为nii？除了用FSL

在Windows系统上将nii.gz转换为nii文件，如果不能使用FSL（FreeSurfer Licensee），您可以尝试以下几种方法：

1. 使用Matlab和niftiwrite工具箱：
如果您的系统中安装了Matlab，可以使用Matlab自带的niftiwrite函数来实现转换。首先确保您已经安装了支持NIfTI文件格式的工具箱。然后，您可以使用以下代码进行转换：

   nii = niftiread('yourfile.nii.gz'); % 读取nii.gz文件
   niftiwrite(nii, 'yourfile.nii'); % 写入nii文件

2. 使用命令行工具：
您可以使用支持命令行操作的工具如MRIcron或者3D Slicer中的命令行工具。例如，MRIcron中的mcverter工具可以这样使用：

   mcverter -i yourfile.nii.gz -o yourfile.nii -type nii

3. 使用在线转换服务：
如果您不希望安装额外软件，可以使用一些在线平台提供的NIfTI文件格式转换服务。只需将nii.gz文件上传到这些平台，它们会提供转换后的nii文件下载链接。

在尝试上述方法时，请确保您已经获取了相应的文件并拥有使用它们的权限。

相关问题

如何在Windows系统上将nii.gz转换为nii？

在Windows系统上将nii.gz转换为nii文件，可以使用多种医学图像处理软件或命令行工具。以下是使用免费开源软件FSL（FMRIB Software Library）来完成转换的步骤：

1. 首先，需要下载并安装FSL。访问FSL的官方网站下载适合Windows系统的安装包。

2. 安装完成后，需要将FSL的bin目录添加到系统的环境变量PATH中，这样可以在命令行中直接调用FSL的工具。具体操作为：
- 右键点击“计算机”图标，选择“属性”。
- 点击“高级系统设置”，然后点击“环境变量”按钮。
- 在“系统变量”区域找到名为“Path”的变量，点击“编辑”。
- 在“编辑环境变量”对话框中，点击“新建”，将FSL的bin目录路径添加进去，如 `C:\Program Files\fsl\bin`。

3. 安装并配置好环境变量后，打开命令提示符（可以在开始菜单中搜索`cmd`）。

4. 在命令提示符中，使用FSL的`gunzip`命令来解压nii.gz文件。格式如下：

   gunzip -c filename.nii.gz > filename.nii

其中`filename`是你想要转换的文件名，不要包括`.nii.gz`扩展名。

例如，如果有一个名为`example.nii.gz`的文件，你应该在命令行中输入：

gunzip -c example.nii.gz > example.nii

5. 转换完成后，你可以使用FSL的其他工具或者医学图像查看软件打开转换后的`.nii`文件。

将一个4D nii.gz转换成多个3D nii.gz

您可以使用Python中的NiBabel库来完成这项任务。以下是一个示例代码，可以将一个4D NIfTI文件分割成多个3D NIfTI文件：

import nibabel as nib
import os

# 读取4D NIfTI文件
img_4d = nib.load('path/to/4D/file.nii.gz')

# 获取4D数据的维度信息
nx, ny, nz, nt = img_4d.shape

# 循环遍历每个时间点，将其保存为一个3D NIfTI文件
for t in range(nt):
    # 提取当前时间点的3D数据
    img_3d = img_4d.dataobj[:, :, :, t]
    
    # 创建一个新的NIfTI对象，用于保存3D数据
    img_3d_nii = nib.Nifti1Image(img_3d, img_4d.affine)
    
    # 生成一个新的文件名，用于保存3D数据
    filename = 'path/to/3D/file_t{}.nii.gz'.format(t)
    
    # 保存3D数据为NIfTI文件
    nib.save(img_3d_nii, filename)
    
    # 输出保存的文件名
    print('Saved file:', filename)

该代码将会把4D NIfTI文件的每个时间点分别保存为一个3D NIfTI文件，并输出每个保存的文件名。请确保替换代码中的文件路径为您自己的路径。