这段代码有什么错？ 怎么改正？p_list <- data.frame() for (i in c(1:35)) { res <- rcorr(data[,1], data[,i+7]) p_value <- signif(res$P[1,2], 2) cor_value <- round(res$r[1,2], 2) p_list[[i]] <- list(p_value, cor_value) }

这段代码有两个问题。第一个问题是，在第一行中，您将p_list设置为数据框，但在代码中却将其作为列表使用。第二个问题是，在第8行中，您试图将p值和相关性系数存储在p_list[[i]]中，但p_list是一个数据框，不能像列表那样使用双括号。为了解决这些问题，您可以将p_list设置为列表，并使用data.frame函数将p值和相关性系数存储为数据框，例如：

p_list <- list() 
for (i in c(1:35)) {           
  res <- rcorr(data[,1], data[,i+7])     
  p_value <- signif(res$P[1,2], 2)     
  cor_value <- round(res$r[1,2], 2)     
  p_list[[i]] <- data.frame(p_value, cor_value)
}

这样，您就可以将每个相关性分析的p值和相关性系数存储在p_list中，并将其作为数据框使用。

相关问题

解释这行代码res_df_list <- list() for(i in 1:length(model_obj_list)){ res_pred <- predict(model_obj_list[[i]], inputArr[, variable_cols], type="prob") res_df_list[[i]] <- res_pred[, "1"] } res_df <- as.data.frame(res_df_list) res_score <- rowMeans(res_df) checkDir(dirname(outprefix)) res_AUC_df <- summary_AUC(test_label=test_label, predict_value=res_score, outprefix=outprefix) res <- data.frame(test_label=test_label, predict_value=res_score)

这段代码主要是用来进行模型预测并计算测试数据的AUC值。具体实现步骤如下：

1. 创建一个空列表res_df_list，用于存储每个模型的预测结果。

2. 对于每个模型，使用predict函数对测试数据进行预测，并获取预测结果的第一列（即正样本的概率值），将其存储到res_df_list中。

3. 将res_df_list转换为数据框res_df，每行对应一个测试样本，每列对应一个模型的预测结果。

4. 对于每行数据，计算其对应每个模型的预测结果的平均值，作为该行数据的最终预测得分。

5. 调用summary_AUC函数计算测试数据的AUC值，并将结果存储在res_AUC_df中。

6. 将测试数据的真实标签和预测得分存储到数据框res中，并返回该数据框res。

N_allfiles <- list.files(path="/Analysis_B/20220326_JNILI/006_blastx/",pattern ="*_blastout_rename.txt") N_Total.data <- data.frame() for (i in N_allfiles){ N_path <- paste(path="/Analysis_B/20220326_JNILI/006_blastx/", i, sep="") N_A <- read.table(N_path,sep="") N_B <- strsplit(i,"_") i <- N_B[[1]][1] N_A$Sample <- i N_Total.data <- rbind(N_Total.data, N_A) } write.csv(N_Total.data, file ="/Analysis_B/20220326_JNILI/006_blastx/SampleID_blastN.csv",row.names = F)这段代码什么意思

这段代码的作用是将/Analysis_B/20220326_JNILI/006_blastx/文件夹下所有名字以"_blastout_rename.txt"结尾的文件读取并合并为一个数据框N_Total.data，并将合并后的数据框写入一个csv文件中。具体实现过程如下：

1. 使用list.files函数获取/Analysis_B/20220326_JNILI/006_blastx/文件夹下所有名字以"_blastout_rename.txt"结尾的文件名，保存到N_allfiles变量中。

2. 创建一个空数据框N_Total.data。

3. 使用for循环遍历N_allfiles列表，对于列表中的每一个文件名i，执行以下操作：

a. 将文件路径拼接到N_path变量中。

b. 使用read.table函数读取文件内容到N_A数据框中。

c. 使用strsplit函数将文件名i按"_"分割，获取第一个分割出来的字符串，即样本ID，并将其保存到i变量中。

d. 将样本ID作为新列Sample添加到N_A数据框中。

e. 使用rbind函数将N_A数据框合并到N_Total.data数据框中。

4. 使用write.csv函数将合并后的数据框N_Total.data写入到/Analysis_B/20220326_JNILI/006_blastx/SampleID_blastN.csv文件中，设置row.names参数为F表示不写入行名。

综上，这段代码主要的目的是对blastn分析的结果进行处理，将所有样本的结果合并为一个csv文件，并添加样本ID作为新的一列。