def filterNormalization(self, block_size=64, all_at_once = False): """ Normalize signal intensity. @block_size (integer) A block size determining the divided volume size. This argument is passed to the block_separator function. @all_at_once (bool) A flag determining all-at-onec processing. This argument is passed to the block_separator function. """ print("Intensity normalization") if self.peak_air == None: raise Exception('Call the calculateNormalizationParam in ahead.') maxid = [self.peak_air, self.peak_soil] maxid = [i-self.hist_x[0] for i in maxid] plt.figure() plt.plot(self.hist_x, self.hist_y) plt.plot(self.hist_x[maxid], self.hist_y[maxid],'ro') plt.xlabel('intensity') plt.ylabel('count') plt.pause(.01) i_block = self.block_separator(overlapping = 1, block_size = block_size, all_at_once = all_at_once) for blocks, indexes in i_block: blocks = tqdm_multiprocessing(functools.partial(normalizeIntensity, peak_air=self.peak_air, peak_soil=self.peak_soil), blocks) self.updateStack(blocks, indexes, overlapping = 1, block_size = block_size) return请完整详细解释每一行的代码意思

时间: 2023-06-02 07:05:09 浏览: 59
def filterNormalization(self, block_size=64, all_at_once=False): """ Normalize signal intensity. @block_size (integer): A block size determining the divided volume size. This argument is passed to the block_separator function. @all_at_once (bool): A flag determining all-at-once processing. This argument is passed to the block_separator function. """ # 打印字符串 print("Intensity normalization") # 如果没有设置峰值,抛出异常 if self.peak_air == None: raise Exception('Call the calculateNormalizationParam in ahead.') # 设置峰值 maxid = [self.peak_air, self.peak_soil] maxid = [i-self.hist_x[0] for i in maxid] # 绘图 plt.figure() plt.plot(self.hist_x, self.hist_y) plt.plot(self.hist_x[maxid], self.hist_y[maxid],'ro') plt.xlabel('intensity') plt.ylabel('count') plt.pause(.01) # 将数据分块处理 i_block = self.block_separator(overlapping=1, block_size=block_size, all_at_once=all_at_once) # 对分块数据进行处理 for blocks, indexes in i_block: # 对分块数据进行处理 blocks = tqdm_multiprocessing(functools.partial(normalizeIntensity, peak_air=self.peak_air, peak_soil=self.peak_soil), blocks) # 更新数据 self.updateStack(blocks, indexes, overlapping=1, block_size=block_size) # 返回结果 return

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class MLP(nn.Module): def __init__( self, input_size: int, output_size: int, n_hidden: int, classes: int, dropout: float, normalize_before: bool = True ): super(MLP, self).__init__() self.input_size = input_size self.dropout = dropout self.n_hidden = n_hidden self.classes = classes self.output_size = output_size self.normalize_before = normalize_before self.model = nn.Sequential( nn.Linear(self.input_size, n_hidden), nn.Dropout(self.dropout), nn.ReLU(), nn.Linear(n_hidden, self.output_size), nn.Dropout(self.dropout), nn.ReLU(), ) self.after_norm = torch.nn.LayerNorm(self.input_size, eps=1e-5) self.fc = nn.Sequential( nn.Dropout(self.dropout), nn.Linear(self.input_size, self.classes) ) self.output_layer = nn.Linear(self.output_size, self.classes) def forward(self, x): self.device = torch.device('cuda') # x = self.model(x) if self.normalize_before: x = self.after_norm(x) batch_size, length, dimensions = x.size(0), x.size(1), x.size(2) output = self.model(x) return output.mean(dim=1) class LabelSmoothingLoss(nn.Module): def __init__(self, size: int, smoothing: float, ): super(LabelSmoothingLoss, self).__init__() self.size = size self.criterion = nn.KLDivLoss(reduction="none") self.confidence = 1.0 - smoothing self.smoothing = smoothing def forward(self, x: torch.Tensor, target: torch.Tensor) -> torch.Tensor: batch_size = x.size(0) if self.smoothing == None: return nn.CrossEntropyLoss()(x, target.view(-1)) true_dist = torch.zeros_like(x) true_dist.fill_(self.smoothing / (self.size - 1)) true_dist.scatter_(1, target.view(-1).unsqueeze(1), self.confidence) kl = self.criterion(torch.log_softmax(x, dim=1), true_dist) return kl.sum() / batch_size

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