R语言针对这个代码survsvm.reg <- survivalsvm(Surv(month, OS) ~ ., data = train, type = "regression", gamma.mu = 1, opt.meth = "quadprog", kernel = "add_kernel"),如何获取综合布里尔得分和变量重要性排名的代码详细解释
时间: 2023-07-15 14:14:43 浏览: 82
获取综合布里尔得分的代码可以如下所示:
```R
# 首先,需要用生存模型预测出每个样本的生存概率
pred_prob <- predict(survsvm.reg, newdata = test, type = "prob")
# 然后,根据生存概率和实际事件发生情况,计算出每个样本的布里尔得分
br_score <- function(pred_prob, event) {
n <- length(pred_prob)
score <- rep(0, n)
for (i in 1:n) {
if (event[i] == 1) {
score[i] <- (pred_prob[i] - 1)^2
} else {
score[i] <- pred_prob[i]^2
}
}
return(mean(score))
}
br_score_test <- br_score(pred_prob[,2], test$OS)
# 最后,得到测试集的综合布里尔得分
br_score_test
```
其中,`predict(survsvm.reg, newdata = test, type = "prob")` 用于预测测试集样本的生存概率,`br_score()` 函数用于计算每个样本的布里尔得分。最终得到的 `br_score_test` 即为测试集的综合布里尔得分。
获取变量重要性排名的代码可以如下所示:
```R
# 首先,需要使用生存模型的变量重要性函数计算每个变量的重要性得分
imp_score <- varImp(survsvm.reg)
# 然后,按照得分从大到小排序,得到变量重要性排名
imp_rank <- sort(imp_score$importance, decreasing = TRUE)
```
其中,`varImp(survsvm.reg)` 用于计算生存模型每个变量的重要性得分,`sort()` 函数将得分按照从大到小排序。最终得到的 `imp_rank` 即为变量重要性排名。
阅读全文