R语言logistic评分
时间: 2023-11-14 18:06:26 浏览: 119
在R语言中,可以使用LogisticDx包来进行逻辑回归模型的评分。该包提供了一系列诊断工具,可以用于探索和评估拟合优度。下面是一个使用gof()函数评估拟合优度的例子:
library(LogisticDx)
model_diagnostics <- LogisticDx::gof(logistic_model, plotROC = FALSE)
names(model_diagnostics)
该代码将计算逻辑回归模型的评分,并返回一些诊断指标,如卡方检验值(chiSq)、拟合优度(gof)、R方值(R2)和曲线下面积(auc)等。
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R语言 logistic评分
R语言 logistic评分是利用逻辑回归模型对个体进行评分或分类的一种方法。在R语言中,可以使用一系列函数和包来实现逻辑回归评分,例如`glm()`函数和`plogis()`函数等。下面是一个利用逻辑回归模型对个体进行评分的简单示例:
```R
# 1. 导入数据和探索
data <- read.csv("data.csv")
head(data)
# 2. 构建逻辑回归模型
model <- glm(y ~ x1 + x2, data = data, family = binomial)
# 3. 对个体进行评分
individual <- data[1, ] # 假设评分第一个个体
score <- predict(model, newdata = individual, type = "response")
score
```
在上述示例中,`glm()`函数用于构建逻辑回归模型,其中`y`是因变量,`x1`和`x2`是自变量。然后,使用`predict()`函数对个体进行评分,其中`newdata`参数指定评分的个体数据,`type`参数设置为"response"表示输出概率。
R语言计算logistic回归C指数,以及获得C指数的95%CI,logistic回归模型如下:logistic_model_shi <- lrm(复发 ~ BMI + 术后VAS + 下床时间 + 活动程度评分 + Pfirrmann分级, data = mydat, x=T, y=T)
在R语言中,可以使用rms包中的lrm函数来进行logistic回归分析。要计算C指数和其95%CI,可以使用validate函数。
首先需要安装rms包和Hmisc包。可以使用以下命令进行安装:
```R
install.packages("rms")
install.packages("Hmisc")
```
然后加载包:
```R
library(rms)
library(Hmisc)
```
接下来,使用lrm函数拟合logistic回归模型:
```R
logistic_model_shi <- lrm(复发 ~ BMI + 术后VAS + 下床时间 + 活动程度评分 + Pfirrmann分级,
data = mydat, x=T, y=T)
```
其中,“mydat”是数据框名,“x=T”表示保留所有自变量,“y=T”表示保留因变量。
接下来,使用validate函数计算C指数和其95%CI:
```R
val_shi <- validate(logistic_model_shi, method="boot", B=1000)
Cindex_shi <- val_shi$cindex[1]
Cindex_CI_shi <- val_shi$cindex[2:3]
```
其中,“method”指定采用bootstrap方法,“B”指定bootstrap重复次数。C指数和其95%CI分别存储在“Cindex_shi”和“Cindex_CI_shi”中。
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