pca(n_components=2)

时间: 2023-04-18 16:00:34 浏览: 213
pca(n_components=2)是一种使用主成分分析(PCA)算法进行降维的方法,其中n_components=2表示将数据降至二维。PCA是一种常用的数据降维技术,可以将高维数据转换为低维数据,以便更好地进行数据分析和可视化。在这种方法中,数据被投影到一个新的坐标系中,使得新的坐标系中的第一维度包含最大的方差,第二维度包含次大的方差,以此类推。这样,我们可以通过保留最大的方差来保留数据的最重要的信息,从而减少数据的维度。
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PCA(n_components=0.95)

PCA是一种常用的降维技术,它可以将高维数据降到低维,同时保留数据的大部分信息。其中,n_components参数用于指定降维后的维度数或者解释方差比例。当n_components为整数时,表示降维后的维度数;当n_components为小数时,表示降维后保留的解释方差比例。比如,当n_components=0.95时,表示降维后保留95%的解释方差,即将原始数据压缩至最少的维度,同时尽可能保留原始数据的信息。

n_components = 16 pca = PCA(n_components=n_components, svd_solver='randomized',whiten=True).fit(X_train) X_train_pca = pca.transform(X_train)

这是一个使用scikit-learn库中的PCA算法对数据进行降维的示例代码。具体来说,这段代码中: 1. n_components = 16:指定PCA算法将数据降到的维度为16维。 2. pca = PCA(n_components=n_components, svd_solver='randomized',whiten=True).fit(X_train):创建一个PCA对象,并将其应用于训练数据X_train上进行拟合。其中,n_components指定了PCA算法将数据降到的维度,svd_solver指定使用的求解器,whiten=True表示对数据进行白化处理,即将数据的每个特征缩放到相同的方差。 3. X_train_pca = pca.transform(X_train):将训练数据X_train降维到16维,得到新的训练数据X_train_pca。 通过PCA算法对数据进行降维可以达到以下效果: 1. 减少数据的维数,从而减少计算量,提高算法的效率。 2. 去除数据中的噪声和冗余信息,从而提高算法的鲁棒性和泛化能力。 3. 显式地提取数据的主要特征,从而更好地理解数据的本质特性。

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优化这段代码 for j in n_components: estimator = PCA(n_components=j,random_state=42) pca_X_train = estimator.fit_transform(X_standard) pca_X_test = estimator.transform(X_standard_test) cvx = StratifiedKFold(n_splits=5, shuffle=True, random_state=42) cost = [-5, -3, -1, 1, 3, 5, 7, 9, 11, 13, 15] gam = [3, 1, -1, -3, -5, -7, -9, -11, -13, -15] parameters =[{'kernel': ['rbf'], 'C': [2x for x in cost],'gamma':[2x for x in gam]}] svc_grid_search=GridSearchCV(estimator=SVC(random_state=42), param_grid=parameters,cv=cvx,scoring=scoring,verbose=0) svc_grid_search.fit(pca_X_train, train_y) param_grid = {'penalty':['l1', 'l2'], "C":[0.00001,0.0001,0.001, 0.01, 0.1, 1, 10, 100, 1000], "solver":["newton-cg", "lbfgs","liblinear","sag","saga"] # "algorithm":['auto', 'ball_tree', 'kd_tree', 'brute'] } LR_grid = LogisticRegression(max_iter=1000, random_state=42) LR_grid_search = GridSearchCV(LR_grid, param_grid=param_grid, cv=cvx ,scoring=scoring,n_jobs=10,verbose=0) LR_grid_search.fit(pca_X_train, train_y) estimators = [ ('lr', LR_grid_search.best_estimator_), ('svc', svc_grid_search.best_estimator_), ] clf = StackingClassifier(estimators=estimators, final_estimator=LinearSVC(C=5, random_state=42),n_jobs=10,verbose=0) clf.fit(pca_X_train, train_y) estimators = [ ('lr', LR_grid_search.best_estimator_), ('svc', svc_grid_search.best_estimator_), ] param_grid = {'final_estimator':[LogisticRegression(C=0.00001),LogisticRegression(C=0.0001), LogisticRegression(C=0.001),LogisticRegression(C=0.01), LogisticRegression(C=0.1),LogisticRegression(C=1), LogisticRegression(C=10),LogisticRegression(C=100), LogisticRegression(C=1000)]} Stacking_grid =StackingClassifier(estimators=estimators,) Stacking_grid_search = GridSearchCV(Stacking_grid, param_grid=param_grid, cv=cvx, scoring=scoring,n_jobs=10,verbose=0) Stacking_grid_search.fit(pca_X_train, train_y) var = Stacking_grid_search.best_estimator_ train_pre_y = cross_val_predict(Stacking_grid_search.best_estimator_, pca_X_train,train_y, cv=cvx) train_res1=get_measures_gridloo(train_y,train_pre_y) test_pre_y = Stacking_grid_search.predict(pca_X_test) test_res1=get_measures_gridloo(test_y,test_pre_y) best_pca_train_aucs.append(train_res1.loc[:,"AUC"]) best_pca_test_aucs.append(test_res1.loc[:,"AUC"]) best_pca_train_scores.append(train_res1) best_pca_test_scores.append(test_res1) train_aucs.append(np.max(best_pca_train_aucs)) test_aucs.append(best_pca_test_aucs[np.argmax(best_pca_train_aucs)].item()) train_scores.append(best_pca_train_scores[np.argmax(best_pca_train_aucs)]) test_scores.append(best_pca_test_scores[np.argmax(best_pca_train_aucs)]) pca_comp.append(n_components[np.argmax(best_pca_train_aucs)]) print("n_components:") print(n_components[np.argmax(best_pca_train_aucs)])

优化这段代码train_aucs=[] test_aucs=[]#train_aucs和test_aucs用来存储每次训练和测试的AUC值,AUC是一种常用的二分类模型性能评估指标 train_scores=[] test_scores=[]#train_scores和test_scores则是用来存储每次训练和测试的得分 loopn=5 #number of repetition while splitting train/test dataset with different random state. np.random.seed(10)#设置随机数生成器的种子,确保每次运行时生成的随机数一致。 random_states=np.random.choice(range(101), loopn, replace=False)#np.random.choice()用于从给定的范围内选择指定数量的随机数,range设置范围,loopn表示选择的随机数的数量,replace=False表示选择的随机数不可重复 scoring='f1'#设置性能指标 pca_comp=[]#设置空列表,储主成分分析(PCA)的组件 for i in range(loopn): train_X,test_X, train_y, test_y ,indices_train,indices_test= train_test_split(train, #通过train_test_split函数将数据集划分为训练集(train_X, train_y)和测试集(test_X, test_y),indices_train和indices_test返回索引 target,indices, test_size = 0.3,#数据集的70%,测试集占30% stratify=target, random_state=random_states[i]#随机状态(random_states[i])添加到random_states列表中 ) print("train_x.shpae:") print(train_X.shape) standardScaler = StandardScaler() standardScaler.fit(train_X) X_standard = standardScaler.transform(train_X) X_standard_test = standardScaler.transform(test_X) #calculate max n_components estimator = PCA(n_components=0.99,random_state=42) pca_X_train = estimator.fit_transform(X_standard) n_components=range(10,min(pca_X_train.shape),10) print(n_components) best_pca_train_aucs=[] best_pca_test_aucs=[] best_pca_train_scores=[] best_pca_test_scores=[]

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