df =pd.read_excel("D:\HBVdata\HBV_P.xlsx") smile_list =df['Smiles'].tolist() mols =[Chem.MolFromSmiles(smile) for smile in smile_list] fingerprints =[Chem.RDKFingerprint(mol) for mol in mols] dg =pd.read_csv("D:\HBVdata\hbvfrag_recap_delete_duplicate.csv") smi_list =dg['mol'].tolist() submols =[Chem.MolFromSmarts(smi) for smi in smi_list] count_dict = {} for submol_idx, submol in enumerate(submols): count = 0 for mol in mols: if mol.HasSubstructMatch(submol): count += 1 smi = smi_list[submol_idx] count_dict[smi] = count total_count =sum(count_dict.values()) print(total_count) counts =[count_dict.values()] print(counts) freq =[ct / total_count for ct in counts]针对这段代码用字典的值除以total_count

时间: 2024-03-01 15:49:16 浏览: 13
这段代码是用来计算分子库中每个子结构出现的频率的。在计算频率时,使用了字典的值除以total_count的方法。具体来说,代码中的count_dict是一个字典,它的键是子结构的SMILES字符串,值是该子结构在分子库中出现的次数。total_count是所有子结构在分子库中出现的总次数。在计算频率时,代码通过将count_dict的值列表除以total_count来得到每个子结构的出现频率。最后,这些频率存储在freq列表中。
相关问题

df = pd.read_excel函数,具体

df = pd.read_excel是pandas库中的一个函数,用于读取Excel文件并将其转换为数据框(DataFrame)格式。该函数的具体参数和用法如下: 参数: - Excel文件路径:可以是本地文件路径,也可以是网络上的URL路径。 - sheet_name:可选参数,用于指定要读取的Excel表格的名称或索引。默认情况下,它将读取第一个表格。 - header:可选参数,用于指定将哪一行作为列名。默认情况下,它将使用第一行作为列名。 - index_col:可选参数,用于指定哪一列作为索引列。 - skiprows:可选参数,用于跳过指定的行数。 - nrows:可选参数,用于指定读取的行数。 - usecols:可选参数,用于指定要读取的列范围。 - dtype:可选参数,用于指定列的数据类型。 - na_values:可选参数,用于指定在读取过程中将被视为缺失值的值。 用法示例: ``` import pandas as pd # 读取本地Excel文件 df = pd.read_excel('data.xlsx') # 读取网络上的Excel文件 df = pd.read_excel('https://example.com/data.xlsx') # 读取指定表格和列范围的Excel文件 df = pd.read_excel('data.xlsx', sheet_name='Sheet1', usecols='A:C') # 跳过前两行并指定第一列作为索引列 df = pd.read_excel('data.xlsx', skiprows=2, index_col=0) ``` 通过使用这个函数,你可以方便地读取Excel文件中的数据并进行后续的数据分析和处理操作。

df = pd.read_excel

df = pd.read_excel是一个Python语言中的pandas库函数,用于读取Excel文件并将其转换为数据框(DataFrame)格式。该函数需要传入Excel文件的路径和文件名作为参数,例如: df = pd.read_excel('data.xlsx') 其中,'data.xlsx'是Excel文件的路径和文件名。读取成功后,数据框df就可以用于数据分析和处理。

相关推荐

import numpy as np import pylab as pl import pandas as pd from sklearn.linear_model import Ridge from sklearn.metrics import mean_squared_error from sklearn.model_selection import train_test_split X2=[] X3=[] X4=[] X5=[] X6=[] X7=[] df=pd.read_excel('C:/Users/86147/OneDrive/文档/777.xlsx',header=0,usecols=(3,)) X2=df.values.tolist() x2=[] for i in X2: if X2.index(i)<=2927: #两个单元楼的分隔数 x2.append(i) df=pd.read_excel('C:/Users/86147/OneDrive/文档/777.xlsx',header=0,usecols=(4,)) X3=df.values.tolist() x3=[] for i in X3: if X3.index(i)<=2927: x3.append(i) df=pd.read_excel('C:/Users/86147/OneDrive/文档/777.xlsx',header=0,usecols=(5,)) X4=df.values.tolist() x4=[] for i in X4: if X4.index(i)<=2927: x4.append(i) df=pd.read_excel('C:/Users/86147/OneDrive/文档/777.xlsx',header=0,usecols=(6,)) X5=df.values.tolist() x5=[] for i in X5: if X5.index(i)<=2927: x5.append(i) df=pd.read_excel('C:/Users/86147/OneDrive/文档/777.xlsx',header=0,usecols=(7,)) X6=df.values.tolist() x6=[] for i in X6: if X6.index(i)<=2927: x6.append(i) df=pd.read_excel('C:/Users/86147/OneDrive/文档/777.xlsx',header=0,usecols=(8,)) X7=df.values.tolist() x7=[] for i in X7: if X7.index(i)<=2927: x7.append(i) np.random.seed(42) q=np.array(X2[:2922]) w=np.array(x3[:2922]) e=np.array(x4[:2922]) r=np.array(x5[:2922]) t=np.array(x6[:2922]) p=np.array(x7[:2922]) eps=np.random.normal(0,0.05,152) X=np.c_[q,w,e,r,t,p] beta=[0.1,0.15,0.2,0.5,0.33,0.45] y=np.dot(X,beta)X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(X, y, test_size=0.2, random_state=42) alpha = 0.1 # 设置岭回归的惩罚参数 ridge = Ridge(alpha=alpha) ridge.fit(X_train, y_train) y_pred = ridge.predict(X_test) mse = mean_squared_error(y_test, y_pred) print('MSE:', mse) coef = ridge.coef_ # 计算岭回归的系数 intercept = ridge.intercept_ # 计算岭回归的截距 print('Coefficients:', coef) print('Intercept:', intercept)修改这个代码,要求增加时间序列x1参与建模

最新推荐

recommend-type

vb仓库管理系统(可执行程序+源码+ 开题报告+ 答辩稿)【VB】.zip

vb仓库管理系统(可执行程序+源码+ 开题报告+ 答辩稿)【VB】
recommend-type

中文翻译Introduction to Linear Algebra, 5th Edition 2.1节

中文翻译Introduction to Linear Algebra, 5th Edition 2.1节 线性代数的核心问题是求解方程组。这些方程都是线性的,即未知数仅与数相乘——我们绝不会 遇见 x 乘以 y。我们的第一个线性方程组较小。接下来你来看看它引申出多远: 两个方程 两个未知数 x − 2y = 1 3x + 2y = 11 (1) 我们一次从一个行开始。第一个方程 x − 2y = 1 得出了 xy 平面的一条直线。由于点 x = 1, y = 0 解 出该方程,因此它在这条直线上。因为 3 − 2 = 1,所以点 x = 3, y = 1 也在这条直线上。若我们选择 x = 101,那我们求出 y = 50。 这条特定直线的斜率是 12,是因为当 x 变化 2 时 y 增加 1。斜率在微积分中很重要,然而这是线 性代数! 图 2.1 将展示第一条直线 x − 2y = 1。此“行图”中的第二条直线来自第二个方程 3x + 2y = 11。你 不能错过两条线的交点 x = 3, y = 1。点 (3, 1) 位于两条线上并且解出两个方程。
recommend-type

管理建模和仿真的文件

管理Boualem Benatallah引用此版本:布阿利姆·贝纳塔拉。管理建模和仿真。约瑟夫-傅立叶大学-格勒诺布尔第一大学,1996年。法语。NNT:电话:00345357HAL ID:电话:00345357https://theses.hal.science/tel-003453572008年12月9日提交HAL是一个多学科的开放存取档案馆,用于存放和传播科学研究论文,无论它们是否被公开。论文可以来自法国或国外的教学和研究机构,也可以来自公共或私人研究中心。L’archive ouverte pluridisciplinaire
recommend-type

识别MATLAB微分方程求解中的混沌行为:分析非线性方程混沌行为的实用技巧

![matlab求解微分方程](https://img-blog.csdnimg.cn/2021062810300367.png?x-oss-process=image/watermark,type_ZmFuZ3poZW5naGVpdGk,shadow_10,text_aHR0cHM6Ly9ibG9nLmNzZG4ubmV0L3dlaXhpbl80MTQ3OTY3OA==,size_16,color_FFFFFF,t_70) # 1. MATLAB微分方程求解概述 微分方程是描述物理、工程和金融等领域中动态系统的数学模型。MATLAB提供了强大的工具来求解微分方程,包括内置求解器和自定义函数
recommend-type

physon如何做ERP系统

作为一个AI语言模型,我可以给您提供一些基本的建议和思路: 1.明确需求和目标:在开始开发ERP系统之前,需要明确您的业务需求和目标,了解您的业务流程、流程数据、员工角色和权限、财务管理等方面的要求,这样才能更好的设计和开发ERP系统。 2.选择技术框架和开发工具:选择合适的技术框架和开发工具是ERP系统开发的关键。选择一种流行的技术框架和工具可以提高开发效率和质量。 3.设计数据库:ERP系统需要一个功能强大的数据库来存储数据。设计数据库需要考虑数据的完整性、安全性和可扩展性。 4.设计系统架构:系统架构是ERP系统的骨架,需要考虑系统的可扩展性、可维护性和性能。 5.开发和测试:
recommend-type

zigbee-cluster-library-specification

最新的zigbee-cluster-library-specification说明文档。
recommend-type

"互动学习:行动中的多样性与论文攻读经历"

多样性她- 事实上SCI NCES你的时间表ECOLEDO C Tora SC和NCESPOUR l’Ingén学习互动,互动学习以行动为中心的强化学习学会互动,互动学习,以行动为中心的强化学习计算机科学博士论文于2021年9月28日在Villeneuve d'Asq公开支持马修·瑟林评审团主席法布里斯·勒菲弗尔阿维尼翁大学教授论文指导奥利维尔·皮耶昆谷歌研究教授:智囊团论文联合主任菲利普·普雷教授,大学。里尔/CRISTAL/因里亚报告员奥利维耶·西格德索邦大学报告员卢多维奇·德诺耶教授,Facebook /索邦大学审查员越南圣迈IMT Atlantic高级讲师邀请弗洛里安·斯特鲁布博士,Deepmind对于那些及时看到自己错误的人...3谢谢你首先,我要感谢我的两位博士生导师Olivier和Philippe。奥利维尔,"站在巨人的肩膀上"这句话对你来说完全有意义了。从科学上讲,你知道在这篇论文的(许多)错误中,你是我可以依
recommend-type

探索MATLAB微分方程求解中的分岔分析:揭示方程动态行为的秘密

![matlab求解微分方程](https://img-blog.csdnimg.cn/2021062810300367.png?x-oss-process=image/watermark,type_ZmFuZ3poZW5naGVpdGk,shadow_10,text_aHR0cHM6Ly9ibG9nLmNzZG4ubmV0L3dlaXhpbl80MTQ3OTY3OA==,size_16,color_FFFFFF,t_70) # 1. MATLAB微分方程求解概述 微分方程在科学、工程和金融等领域有着广泛的应用。MATLAB作为一种强大的数值计算软件,提供了丰富的微分方程求解工具。本章将概述
recommend-type

ic验证工作中如何在平台中加入发数的总数?

在进行IC验证工作时,可以通过以下步骤在平台中加入发数的总数: 1. 打开IC验证工具(如Cadence Virtuoso)并打开对应的设计文件。 2. 在设计文件中选择需要计算发数的部分电路或模块。 3. 在IC验证工具中打开时序分析工具(如Cadence Tempus)。 4. 在时序分析工具中设置好时钟频率、时钟周期等参数。 5. 执行时序分析,生成时序报告。 6. 在时序报告中查找发数统计信息,将其记录下来。 7. 将发数统计信息添加到平台中,以便在之后的仿真或验证中使用。 需要注意的是,发数统计信息可能因为设计文件的不同而有所差异,需要根据实际情况进行调整和计算。
recommend-type

JSBSim Reference Manual

JSBSim参考手册,其中包含JSBSim简介,JSBSim配置文件xml的编写语法,编程手册以及一些应用实例等。其中有部分内容还没有写完,估计有生之年很难看到完整版了,但是内容还是很有参考价值的。