ff.create_annotated_heatmap 可以用anno_data 可以将P值array显示在相关系数矩阵上吗
时间: 2024-09-27 19:08:16 浏览: 52
`ff.create_annotated_heatmap`是Plotly Express(px)库中的一个函数,用于创建带有颜色编码的热力图,并可以添加额外的注解信息。在这个函数中,`anno_data`参数通常用于指定要在图表上的特定位置添加的文本数据,比如标签、标题或像你说的P值。
如果你有一个P值数组,你可以将其作为`anno_data`的一部分提供给`create_annotated_heatmap`,并在数据中关联每个P值到对应的坐标点(例如,对应的行和列索引)。这将会在对应单元格旁边显示P值,帮助解读热力图中的统计显著性。
示例代码可能看起来像这样:
```python
import plotly.express as px
import numpy as np
# 假设你的数据矩阵是corr_matrix,P值数组是p_values
corr_matrix = ... # 你的相关系数矩阵
p_values = ... # 你的P值数组
# 创建一个字典,将P值映射到相应的矩阵坐标
anno_data = [{'x': i, 'y': j, 'text': f"P值: {p}", 'font': {'size': 10}} for i, j, p in zip(*np.where(p_values))]
fig = px.imshow(corr_matrix, color_continuous_scale='coolwarm', annotation_data=anno_data)
fig.show()
```
相关问题
ff.create_annotated_heatmap 增加 p值text
`ff.create_annotated_heatmap` 是 plotly.express (ff) 库中的一个函数,它用于创建带注解的热力图。这个函数通常用于可视化数据集中两个变量之间的相关性,并通过颜色映射显示强度。如果你想在生成的热力图上添加P值文本,这通常是统计显著性测试的结果,例如皮尔逊相关系数的p值。
当你调用 `create_annotated_heatmap` 时,可以设置 `annotation_text` 或 `hovertemplate` 参数来指定需要显示的注解内容,包括P值。例如:
```python
import plotly.express as px
import pandas as pd
# 假设df是一个包含两列数值数据的数据框
heatmap_data = df.corr()
fig = px.imshow(heatmap_data, color_continuous_scale='coolwarm', # 设置颜色映射
labels=dict(color="Correlation", x="", y=""),
annotation_text=(heatmap_data.index, heatmap_data.columns, heatmap_data),
hovertemplate="Pearson's r: %{z:.3f} <br> P-value: %{text}<br>", # 添加P值文本
text=heatmap_data.apply(lambda r: f"P<0.05" if r['column_name'].p_value < 0.05 else "", axis=1)) # 根据p值条件填充文本
fig.show()
```
在这个例子中,`heatmap_data.apply` 函数用于检查每个单元格的p值是否小于0.05,如果是,则在hoverover模板 (`hovertemplate`) 中显示 "P<0.05",否则不会显示。
import plotly.figure_factory as ff fig = ff.create_annotated_heatmap() 可以用annotation_data 和 annotation_text吗
`import plotly.figure_factory as ff` 是 Plotly 库中的模块,用于创建各种交互式图表,其中 `ff.create_annotated_heatmap()` 函数主要用于生成带有注解的热力图。在这个函数中,你可以传入两个重要的参数:
- **z**:一个二维数组或列表,代表了热力图的数据矩阵。
- **anno** 或 **anno_text**:用于指定每个单元格的注解(`anno`),以及对应注解的文本(`anno_text`)。`anno` 是一个二维元组列表,其中每个元组包含 (x, y) 位置和对应的值,而 `anno_text` 则是与 `anno` 相关联的一系列文本字符串。
如果你提供了 `anno` 和 `anno_text`,它们会分别对应地图上每个点的坐标及其相应的文字说明,帮助用户更清楚地理解数据。不过,需要注意的是,`anno` 中的 `(x, y)` 表示的是数据集索引,而不是图形上的绝对坐标,需要先将索引转换为适合的坐标。
以下是完整的用法示例:
```python
import numpy as np
import plotly.figure_factory as ff
# 创建数据
data = np.random.rand(10, 10)
# 注解数据和文本
anno_data = [(i, j, f"Value {i}{j}") for i in range(10) for j in range(10)]
anno_text = [text for _, _, text in anno_data]
fig = ff.create_annotated_heatmap(z=data, annotation_data=anno_data, annotation_text=anno_text)
fig.show()
```
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