deepmd lammps安装
时间: 2023-12-01 19:05:07 浏览: 283
深度势场(DeepMD)与LAMMPS的集成需要一些步骤来进行安装。以下是安装DeepMD和LAMMPS的一般步骤:
1. 安装LAMMPS:首先,您需要安装LAMMPS分子动力学软件。您可以从LAMMPS官方网站(https://lammps.sandia.gov/)下载源代码,并按照官方提供的指导进行编译和安装。
2. 安装DeepMD-kit:DeepMD-kit是一个用于构建深度学习势场模型的工具包。您可以从DeepMD-kit的GitHub页面(https://github.com/deepmodeling/deepmd-kit)获取源代码。按照README文件中的指导进行安装。
3. 配置LAMMPS和DeepMD-kit:在安装完成后,您需要将DeepMD-kit与LAMMPS集成。为此,您可以使用LAMMPS的“USER-DEEPMD”软件包。进入LAMMPS源代码目录,找到“src”文件夹下的“MAKE”文件。在该文件中,您需要取消注释或添加以下行来启用“USER-DEEPMD”软件包:
```
# USER-DEEPMD package
package user-deepmd deepmd
```
保存并关闭文件,然后按照LAMMPS官方文档提供的指导重新编译和安装LAMMPS。
4. 配置DeepMD-kit:接下来,您需要在DeepMD-kit中配置DeepMD-LAMMPS插件。进入DeepMD-kit源代码目录,找到“examples”文件夹下的“lammps”文件夹。将其中的“liblammps_deepmd.so”和“deepmd”文件夹复制到LAMMPS安装目录下的“lib”文件夹中。
5. 测试安装:完成上述步骤后,您可以使用LAMMPS运行包含DeepMD势场的模拟。您可以参考LAMMPS和DeepMD-kit的文档和示例来深入了解如何配置和运行模拟。
请注意,以上步骤只是一般指导,具体安装过程可能因操作系统、编译环境和软件版本而有所不同。在安装过程中,请仔细阅读相关文档并遵循官方指南。
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