lammps并行安装配置

LAMMPS（Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator）是一个流行的分子动力学模拟软件，它支持并行计算以加速大规模模拟。要在LAMMPS上进行并行安装和配置，通常需要以下几个步骤：

1. **下载与获取**: 首先，访问LAMMPS官网 <https://lammps.sandia.gov/> 下载源代码版本，因为预编译的二进制包可能不包含并行支持。

2. **构建选择**: 挑选一个适合并行计算的构建选项，如`mpi`，这将启用MPI（Message Passing Interface）并行ism。在configure脚本中添加`--enable-mpi`选项，例如：

   ./configure --prefix=/path/to/install --enable-mpi

3. **编译**: 进入源码目录，然后运行`make`命令。对于大型系统，可能需要使用`mpicc`代替`cc`来指定 MPI 编译器。

4. **安装**：完成编译后，使用`make install`将LAMMPS安装到选定的路径，包括必要的库和可执行文件。

5. **环境设置**：在bash shell或其他shell下，确保PATH变量包含了LAMMPS的bin目录，并且设置了适当的环境变量，如`MPICH_ROOT`或`OMPI_ROOT`，取决于你的MPI实现。

6. **测试与验证**：你可以通过运行一些并行示例来检查安装是否成功。LAMMPS文档中有详细的教程和示例。