CentOS下Lammps并行安装教程与环境配置详解

本篇教程详细介绍了在CentOS系统下如何成功地并行安装Lammps、MPICH和相关的库，包括JPEG和FFTW。首先，作者建议在/home目录下创建两个子目录：一个是存放安装文件（例如software），另一个用于实际安装（如vm）。然后，按照以下步骤进行操作： 1. **安装FFTW**：作为root用户，进入解压后的FFTW文件夹，使用`./configure`命令配置安装路径（如/home/vm/fftw3），选择浮点数支持，然后依次执行`make`和`makeinstall`来编译和安装。 2. **安装MPICH**：同样在终端中，进入MPICH文件夹，通过`./configure`设置安装路径（如/home/vm/mpich3），然后进行编译和安装。 3. **安装JPEG库**：进入JPEG文件夹，配置安装路径（如/home/vm/jpeg），执行编译和安装过程。 4. **设置环境变量**：编辑`bashrc`文件，添加MPICH、FFTW和JPEG的bin路径以及lib路径到系统路径中，并更新环境变量。之后，使用`source .bashrc`使更改生效，通过`echo $PATH`验证路径是否已正确添加。 5. **MPICH特殊设置**：使用`ifconfig -a`命令获取本地IP地址，将其添加到`/etc/hosts`文件中，以便于Lammps的通信。 6. **配置MPD**：在/etc目录下创建一个名为mpd.conf的空文件，并编写必要的配置，用于MPICH的分布式计算管理。 在整个过程中，作者强调了每个步骤的重要性，并提供了详细的命令行指导。这些步骤确保了 Lammps的并行环境能够正常运行，包括必要的库依赖和配置调整。对于想要在CentOS系统上进行大规模科学计算或分子动力学模拟的用户来说，这是一个非常实用的教程。