CentOS7.0下LAMMPS并行安装全步骤指南

"这篇教程详细介绍了在CentOS7.0操作系统上如何单机并行安装LAMMPS分子模拟软件。教程中包含了从下载安装包、安装依赖库到编译LAMMPS的完整步骤。" 在Linux系统，特别是CentOS 7.0环境下，LAMMPS (Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator) 的安装过程通常涉及多个步骤，包括准备安装包、安装必要的依赖库以及编译和配置LAMMPS源代码。以下是具体步骤： 1. **安装包准备** 提供了一个百度网盘链接，包含LAMMPs安装包。首先需要下载这些文件，然后使用`tar`命令进行解压。例如，如果解压命令为`$sudo tar -vxzf <文件名>`，应将`<文件名>`替换为实际的下载文件名，并确保解压到指定的目录，如`~/software`。 2. **安装FFTW (Fastest Fourier Transform in the West)** FFTW是一个高效的傅立叶变换库，是LAMMPS中的重要依赖。使用`yum`命令安装必要的开发工具和库，如`build-essential`、`gfortran`、`cshlibstdc++5`、`libjpeg62`等。接着，进入FFTW的源代码目录，使用`./configure`配置安装路径，`make`编译，最后`make install`完成安装。 3. **安装MPICH** MPICH是实现MPI (Message Passing Interface) 的一种实现，用于并行计算。同样地，进入MPICH的源代码目录，通过`./configure`设置安装路径，然后使用`make`和`make install`进行编译和安装。 4. **安装JPEG库** JPEG库是处理JPEG图像格式所必需的，虽然在LAMMPS的基本安装中可能不是必须的，但某些特定功能可能需要它。按照类似FFTW的步骤进行安装。 5. **安装voro++** voro++是一个计算三维空间区域体积的库，对于LAMMPS的某些计算可能有用。如果不需要这个功能，可以跳过此步骤。否则，将voro++复制到LAMMPS的VORONOI目录，然后在该目录下编译并安装。 6. **修改LAMMPS的Makefile.lammps** 在成功安装voro++后，需要更新LAMMPS的Makefile.lammps，以便在编译时正确链接voro++库。这里需要设置`voronoi_SYSINC`和`voronoi_SYSLIB`变量，指定voro++的头文件和库文件路径。 7. **编译LAMMPS** 最后，进入LAMMPS源代码目录，根据系统配置和需求编辑Makefile，选择合适的编译选项。例如，选择MPICH作为并行通信库，然后运行`make yes-all`生成所有模块，接着执行`make`或`make parallel`来编译LAMMPS。 8. **测试安装** 安装完成后，可以使用`make test`来运行LAMMPS的内置测试，确保安装无误。 请注意，整个安装过程需要管理员权限（使用`sudo`），并且在执行每个命令时要确保正确无误，特别是在输入文件路径和命令时。此外，由于软件版本可能会更新，建议在安装前检查最新文档以获取最新的安装指南。