一个sdf文件里如何有多个化合物的结构
时间: 2024-03-03 22:52:41 浏览: 19
SDF(Structure Data File)文件是一种用于存储分子结构信息的文件格式,可以包含一个或多个分子结构。
在SDF文件中,每个分子结构由多行文本表示,通常包括结构式、分子名、化学式、分子量等信息。不同的分子结构之间由一个空行分隔。
如果一个SDF文件包含多个分子结构,则可以通过一个循环来表示每个分子的信息。循环的开始和结束由“$$$$”符号表示。在循环中,每个分子结构的信息以相同的格式进行存储,但使用不同的文本表示。
例如,以下是一个包含两个分子结构的SDF文件的示例:
```
Marvin 08292111282D
2 1 0 0 0 0 999 V2000
-0.5 0.0 0.0 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0.5 0.0 0.0 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
1 2 1 0 0 0
M END
$$$$
Marvin 08292111282D
3 2 0 0 0 0 999 V2000
-0.5 -0.5 0.0 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0.5 -0.5 0.0 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0.0 0.5 0.0 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
1 2 1 0 0 0
2 3 1 0 0 0
M END
$$$$
```
在上述示例中,第一个分子结构由两个原子组成(编号为1和2),第二个分子结构由三个原子组成(编号为1、2和3)。两个分子结构之间由“$$$$”符号分隔。