用代码实现人的DNA和病毒DNA均表示成由一些字母组成的字符串序列。然后检测某种病毒DNA序列是否在患者的DNA序列中出现过,如果出现过,则此人感染了该病毒,否则没有感染。例如,假设病毒的DNA序列为baa,患者1的DNA序列为aaabbba,则感染,患者2的DNA序列为babbba,则未感染。(注意,人的DNA序列是线性的,而病毒的DNA序列是环状的) 输入格式: 输入第一行中给出1个整数i(1≤i≤11),表示待检测的病毒DNA和患者DNA的对数。 输入i行串序列,每行由两个字符串组成(字符串中不含不可见字符),两字符串之间用一个空格分隔,分别代表病毒的DNA序列和患者的DNA序列,病毒的DNA序列和患者的DNA序列长度不超过500。 输出格式: 依次逐行输出每对检测样本的结果,感染输出:YES,未感染输出:NO。

时间: 2023-07-14 18:13:58 浏览: 76
以下是Python3代码实现: ```python def is_infected(virus_dna, patient_dna): virus_len, patient_len = len(virus_dna), len(patient_dna) # 扩展病毒DNA序列(变成环状) virus_dna += virus_dna for i in range(patient_len): if patient_dna[i:i+virus_len] in virus_dna: return "YES" return "NO" n = int(input()) for i in range(n): virus_dna, patient_dna = input().split() print(is_infected(virus_dna, patient_dna)) ``` 首先,我们定义一个函数 `is_infected`,输入参数为病毒DNA序列和患者DNA序列,输出为是否感染的结果。在函数中,我们先将病毒DNA序列扩展成环状(即将其复制一遍拼接在原序列后面),然后依次判断患者DNA序列中的每个长度为病毒DNA序列长度的子串是否在扩展后的病毒DNA序列中出现过。如果出现过,则说明此人感染了该病毒,否则没有感染。 在主程序中,我们先读入待检测的病毒DNA和患者DNA的对数,然后依次对每对检测样本调用 `is_infected` 函数,并输出其返回结果即可。
相关问题

DNA是由一些字母组成的字符串序列,要检测某种病毒DNA序列是否在患者的DNA序列中出现过,实际上就是字符串的模式匹配问题。请利用BF算法或者KMP算法在患者DNA序列中查找病毒DNA序列是否存在。

好的,针对这个问题,我可以先简单介绍一下BF算法和KMP算法的原理,再给出具体的实现方式。 BF算法(Brute-Force算法),也叫朴素模式匹配算法,是一种最简单的字符串匹配算法。它的思路是从主串的第一个字符开始,依次与模式串的每一个字符进行比较。如果匹配成功,则继续比较下一个字符,如果匹配失败,则主串指针后移一位,重新从下一个字符开始比较。 KMP算法(Knuth-Morris-Pratt算法)是一种更高效的字符串匹配算法。它的核心思想是,当模式串与主串不匹配时,尽可能地利用已经匹配过的信息,不要把指针回溯到已经比较过的位置,而是将模式串向右移动一定的距离,继续匹配。 下面是基于BF算法和KMP算法的Python实现代码,用于在患者DNA序列中查找病毒DNA序列是否存在: ``` # BF算法实现 def BF_matching(text, pattern): n, m = len(text), len(pattern) for i in range(n-m+1): if text[i:i+m] == pattern: return True return False # KMP算法实现 def KMP_matching(text, pattern): n, m = len(text), len(pattern) next = get_next(pattern) i, j = 0, 0 while i < n and j < m: if j == -1 or text[i] == pattern[j]: i, j = i+1, j+1 else: j = next[j] if j == m: return True else: return False # 获取KMP算法中的next数组 def get_next(pattern): m = len(pattern) next = [-1] * m i, j = 0, -1 while i < m - 1: if j == -1 or pattern[i] == pattern[j]: i, j = i+1, j+1 next[i] = j else: j = next[j] return next ``` 需要注意的是,如果DNA序列非常长,BF算法可能会比较慢。这时可以考虑使用更高效的字符串匹配算法,比如KMP算法。

医学研究者最近发现了某些新病毒,通过对这些病毒的分析,得知它们的dna序列都是环状的。现在研究者已收集了大量的病毒dna和人的dna数据,想快速检测出这些人是否感染了相应的病毒。为了方便研究,研究者将人的dna和病毒的dna均表示成由一些字母组成的字符串序列,然后检测某种病毒dna序列在患者的dna序列中是否出现过,如果出现过则此人感染了该病毒,否则没有感染。例如,假设病毒的dna序列为baa,患者1的dna序列为aaabbba,则感染;患者2的dna序列为babbba,则未感染。(注意,人的dna序列是线性的,而病毒的dna序列是环状的。)

### 回答1: 最近医学研究者发现了某些新病毒,通过对这些病毒的分析,得知它们的DNA序列都是环状的。现在研究者已经收集了大量的病毒DNA和人的DNA数据,想快速检测出这些人是否感染了相应的病毒。为了方便研究,研究者将人的DNA和病毒的DNA序列均表示成由一些字母组成的字符串序列,然后检测某种病毒的DNA序列是否出现在患者的DNA序列中,如果出现则说明该人感染了该病毒,否则没有感染。例如,假设假设病毒的DNA序列为“baa”,病人1的DNA序列为“aaaabbba”,则感染病毒的可能性较大,而病人2的DNA序列为“babbba”,则没有感染。注:人的DNA序列是线性的,而病毒的DNA序列是环状的。 ### 回答2: 这是一道典型的模式匹配问题。解决这种问题的常见方法是使用字符串匹配算法。字符串匹配算法分为暴力匹配和高效算法两种。 暴力匹配法就是简单粗暴地将模式串和文本串中的字符一个一个比较,如果匹配则继续比较下一个字符,如果不匹配则从文本串中的下一个字符重新开始匹配。这种方法的时间复杂度为O(mn),其中m和n分别为模式串和文本串的长度,由于此题中病毒的dna序列都是环状的,所以在匹配时需要将模式串重复一遍,这样才能确保能够匹配到所有可能的情况。 高效算法有很多种,比如KMP算法、Boyer-Moore算法和Rabin-Karp算法等。这些算法的时间复杂度都为O(m+n),其中m和n同样为模式串和文本串的长度,但是它们的效率通常比暴力匹配要高。 因此,研究者可以考虑使用高效的字符串匹配算法来快速检测出人体dna序列中是否存在相应的病毒dna序列。其中KMP算法是比较常见和简单的一种,适用于字符串长度比较短的情况,如果字符串长度较长,则可以考虑Boyer-Moore算法或Rabin-Karp算法。在实际应用中,还可以根据具体情况来选择不同的算法来解决问题。 ### 回答3: 病毒dna序列环状与人的dna序列线性的不同特性会给研究者的检测带来一定的困难,因此需要采取一些特殊的方法来检测病毒感染。 针对这个问题,研究者可以考虑使用字符串的匹配算法,比如最简单的暴力算法。具体步骤如下: 1. 对于每一个患者,遍历他的整个dna序列,以病毒的dna序列长度作为步长,将该长度的子串和病毒的dna序列做比较,直到所有的子串都被比较完成。 2. 在比较的过程中,需要注意环状特性的处理。在每一次比较时,需要将dna序列的首尾相接,才能正确地比较。 3. 如果某个子串和病毒的dna序列完全匹配,则可以确定该患者感染了该病毒;如果所有的子串都和病毒的dna序列都不匹配,则说明该患者没有感染该病毒。 不过,这个暴力算法的时间复杂度比较高,为O(n*m),其中n为人dna序列长度,m为病毒dna序列长度。为了提高检测速度,研究者可以考虑使用KMP算法、Boyer-Moore算法等更高效的字符串匹配算法,来实现快速检测。 除了这些算法之外,还可以采用机器学习的方法。比如,可以使用深度学习中的循环神经网络(RNN)来训练一个模型,让模型学会如何检测病毒感染。在训练过程中,可以使用大量的已知感染情况的数据来训练模型,让它能够自动识别出患者的dna序列是否存在病毒dna序列,从而实现检测。 总的来说,针对新发现的环状病毒的检测,医学研究者可以采用字符串匹配算法或机器学习算法来实现快速检测。这些方法有各自的优点和适用范围,研究者需要根据实际情况选择合适的方法来解决问题。

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