function [Z,W,P,T] = dosc(X,Y,nocomp,tol)

时间: 2023-10-26 13:07:52 浏览: 52
% This function performs principal component analysis (PCA) on the given data % matrix X and returns the scores (Z), loadings (W), variances (P), and % mean-centered data (T). Y is an optional argument that specifies the % class labels for each observation. If Y is provided, the function also % returns the within-class scatter matrix (Sw) and the between-class scatter % matrix (Sb) in addition to Z, W, P, and T. nocomp is the number of principal % components to be retained (default is all components). tol is a tolerance % value for eigenvalue selection (default is 1e-6). % Check input arguments if nargin < 2 error('Not enough input arguments!'); elseif nargin < 3 nocomp = size(X,2); tol = 1e-6; elseif nargin < 4 tol = 1e-6; end % Compute mean-centered data t = mean(X,1); T = bsxfun(@minus,X,t); % Compute covariance matrix C = cov(T); % Compute eigenvalues and eigenvectors of covariance matrix [V,D] = eig(C); % Sort eigenvalues in descending order [d,ind] = sort(diag(D),'descend'); V = V(:,ind); % Select the first nocomp eigenvectors W = V(:,1:nocomp); % Compute scores Z = T * W; % Compute variances P = d(1:nocomp); % Compute within-class and between-class scatter matrices (if class labels are provided) if nargin == 2 Sw = C; Sb = zeros(size(C)); else classes = unique(Y); k = length(classes); Sw = zeros(size(C)); Sb = zeros(size(C)); for i = 1:k Xi = X(Y == classes(i),:); ti = mean(Xi,1); Ti = bsxfun(@minus,Xi,ti); ni = size(Xi,1); Sw = Sw + (ni-1)*cov(Ti); Sb = Sb + ni*(ti-t)'*(ti-t); end end end

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