GNN代码实现,要求包括训练和测试过程
时间: 2023-10-21 08:07:12 浏览: 175
GNN(图神经网络)的代码实现可分为以下几个步骤:
1. 数据处理:将图数据转换为可以输入到神经网络中的张量形式。
2. 模型定义:定义图神经网络模型,包括节点嵌入、图卷积层、池化层等。
3. 损失函数定义:根据任务需求定义损失函数,如分类任务可选择交叉熵损失函数。
4. 优化器定义:选择合适的优化器,如Adam优化器。
5. 训练过程:使用训练数据进行模型训练,并在每个epoch结束后计算训练集和验证集上的损失和准确率。
6. 测试过程:使用测试数据评估模型性能,计算测试集上的损失和准确率。
下面是一个简单的GNN代码实现,使用的是PyTorch框架:
```python
import torch
import torch.nn as nn
import torch.optim as optim
import torch.nn.functional as F
class GCNLayer(nn.Module):
def __init__(self, in_features, out_features):
super(GCNLayer, self).__init__()
self.linear = nn.Linear(in_features, out_features)
def forward(self, x, adj):
x = self.linear(x)
x = torch.spmm(adj, x)
x = F.relu(x)
return x
class GCN(nn.Module):
def __init__(self, input_dim, hidden_dim, output_dim):
super(GCN, self).__init__()
self.layer1 = GCNLayer(input_dim, hidden_dim)
self.layer2 = GCNLayer(hidden_dim, output_dim)
def forward(self, x, adj):
x = self.layer1(x, adj)
x = self.layer2(x, adj)
return x
# 数据处理
adj = torch.tensor([[0, 1, 0], [1, 0, 1], [0, 1, 0]]) # 邻接矩阵
features = torch.tensor([[1, 0], [0, 1], [1, 1]]) # 节点特征矩阵
labels = torch.tensor([0, 1, 0]) # 节点标签
# 模型定义
gcn = GCN(input_dim=2, hidden_dim=16, output_dim=2)
# 损失函数定义
criterion = nn.CrossEntropyLoss()
# 优化器定义
optimizer = optim.Adam(gcn.parameters(), lr=0.01)
# 训练过程
epochs = 100
for epoch in range(epochs):
optimizer.zero_grad()
output = gcn(features, adj)
loss = criterion(output, labels)
loss.backward()
optimizer.step()
# 计算训练集和验证集上的损失和准确率
with torch.no_grad():
train_output = gcn(features, adj)
train_loss = criterion(train_output, labels)
train_acc = (train_output.argmax(dim=1) == labels).float().mean()
val_output = gcn(features, adj)
val_loss = criterion(val_output, labels)
val_acc = (val_output.argmax(dim=1) == labels).float().mean()
print('Epoch: {:03d}, Train Loss: {:.4f}, Train Acc: {:.4f}, Val Loss: {:.4f}, Val Acc: {:.4f}'.format(
epoch, train_loss.item(), train_acc.item(), val_loss.item(), val_acc.item()))
# 测试过程
test_output = gcn(test_features, adj)
test_loss = criterion(test_output, test_labels)
test_acc = (test_output.argmax(dim=1) == test_labels).float().mean()
print('Test Loss: {:.4f}, Test Acc: {:.4f}'.format(test_loss.item(), test_acc.item()))
```
其中的GCNLayer定义了一个图卷积层,GCN定义了一个包含两个图卷积层的图神经网络模型。在训练过程中,使用Adam优化器进行模型优化,并使用CrossEntropyLoss作为损失函数。在每个epoch结束后,计算训练集和验证集上的损失和准确率。在测试过程中,评估模型性能并计算测试集上的损失和准确率。
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