上述的要求中读取数据格式为“.nii”格式,但是要现在文件夹里读取.nii的.gz压缩格式并解压后读取,建议使用python语言并使用opencv+[simpleITK|nibabel]库对数据进行读取,修改一下上面给出的代码
时间: 2024-03-26 07:42:10 浏览: 54
好的,根据您的需求,我为您修改了代码,使用了Python语言和nibabel库对数据进行读取,同时解压缩了.nii.gz文件。代码如下:
```python
import nibabel as nib
import cv2
import os
import gzip
# 定义读取路径和文件名
path = "/path/to/your/folder"
filename = "your_file.nii.gz"
# 解压缩.gz文件
with gzip.open(os.path.join(path, filename), 'rb') as f_in:
with open(os.path.join(path, filename[:-3]), 'wb') as f_out:
f_out.write(f_in.read())
# 读取.nii文件
img = nib.load(os.path.join(path, filename[:-3]))
img_array = img.get_fdata()
# 将3D图像转换为2D图像
for i in range(img_array.shape[2]):
img_2d = img_array[:, :, i]
img_2d_scaled = cv2.normalize(img_2d, None, 0, 255, cv2.NORM_MINMAX, dtype=cv2.CV_8U)
cv2.imshow("2D image from .nii file", img_2d_scaled)
cv2.waitKey(0)
```
希望这个代码能够满足您的需求。
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