写一个python脚本，不依赖模块提取cds文件中最长转录本并输入到一个新文件中

好的，这个问题我可以为您提供一种实现思路：

1. 打开cds文件并读取所有的序列信息；
2. 根据cds的定义，确定ATG和TGA的位置，从而找到所有的转录本；
3. 针对每一条转录本，计算出它的长度并保存最长的那个；
4. 将最长的转录本写到新文件中。

以下是一个示例脚本：

cds_file = "input.cds"  # 输入文件
out_file = "output.txt"  # 输出文件

# 读取cds文件
with open(cds_file, 'r') as f:
    sequences = f.read().split('>')[1:]

longest_sequence = ""  # 最长转录本
longest_length = 0  # 最长转录本的长度

# 针对每一条转录本，计算它的长度
for seq in sequences:
    seq_list = seq.split('\n')[1:-1]  # 去掉首尾空行以及序列名
    seq_string = ''.join(seq_list).upper()  # 将碱基序列拼成字符串并转为大写
    start_codons = [i for i in range(len(seq_string)) if seq_string.startswith('ATG', i)]  # 找到所有的ATG起始密码子
    stop_codons = [i for i in range(len(seq_string)) if seq_string.startswith('TGA', i)]  # 找到所有的TGA终止密码子
    for i in start_codons:
        for j in stop_codons:
            if j > i and (j-i) % 3 == 0:  # 如果满足ATG在前，TGA在后，且长度是3的倍数，那么就是一个转录本
                transcript = seq_string[i:j+3]
                if len(transcript) > longest_length:  # 如果这个转录本比之前保存的最长的还长，那么就更新最长转录本
                    longest_sequence = transcript
                    longest_length = len(transcript)

# 将最长转录本写到新文件中
with open(out_file, 'w') as f:
    f.write(longest_sequence)

请注意，这个脚本没有使用任何外部模块，但它还有一些局限性，例如它并没有处理一些边缘情况，例如文件格式不正常等。如果您需要更完备的脚本，请使用更加严谨的方法来实现。