Error in `geom_jitter()`: ! both `position` and `width`/`height` are supplied ℹ Only use one approach to alter the position Run `rlang::last_trace()` to see where the error occurred.

抱歉，我之前提供的代码可能导致了错误。根据错误信息，`geom_jitter()` 函数中同时提供了 `position` 和 `width`/`height` 参数，而这两个参数只能选择使用其中一个来修改点的位置。

如果你想要修改抖动点的位置，可以尝试使用 `position = position_jitter()` 参数来替代 `position = position_nudge()` 参数。以下是修改后的代码示例：

ggplot(df_long_st, aes(x = site, y = st, fill = site)) +
  geom_half_violin(side = "r", scale = "width", position = position_nudge(x = 0.1)) +
  geom_boxplot(width = 0.15, fill = "white", position = position_nudge(x = -0.1)) +
  geom_jitter(aes(color = site), width = 0.1, position = position_jitter(width = 0.1))

在这个代码中，`geom_jitter()` 函数中的 `position` 参数被修改为 `position = position_jitter(width = 0.1)`，并且 `width` 参数也被保留用于控制点的抖动幅度。

希望这次能够成功地修改抖动点的位置。如果还有其他问题，请随时提问。

相关问题

Error in `geom_density()`: ! Problem while computing aesthetics. ℹ Error occurred in the 1st layer. Caused by error: ! 找不到对象'CPM'

这个错误提示表明你在使用ggplot2库的`geom_density()`函数绘制图形时遇到了问题。具体来说，它找不到名为`CPM`的对象，这可能是以下几个原因：

1. **变量未定义**：`CPM`可能是你要在图上表示的数据列名，你需要确认这个列是否存在并且已经被正确地导入到数据框中。

# 确保数据框里有 'CPM' 这个列
head(data) # 查看前几行数据看看 'CPM' 是否在其中

2. **拼写错误**：检查一下列名是否准确无误，有时候打字错误也可能导致这个问题。

names(data) # 检查列名是否正确写成了 "CPM" 而不是 "cpm" 或其他形式

3. **非数值数据**：`geom_density`通常用于连续数值数据，如果你的`CPM`列包含非数值或者分类数据，那么需要转换或者排除这部分数据。

4. **缺失值处理**：如果有缺失值影响了`CPM`列，也需要提前处理，比如使用`na.omit()`去除缺失值。

5. **绘图范围限制**：如果`CPM`的值范围过大，可能会超出默认的绘图范围，尝试调整`xlim`或`ylim`。

6. **绘图对象问题**：确保你是在正确的数据框或者图层上调用`geom_density`。

解决完这些问题后，再尝试运行你的代码应该就可以正常绘图了。

in `geom_density()`: ! Problem while computing aesthetics. ℹ Error occurred in the 1st layer. Caused by error: ! 找不到对象'variable'

在使用`ggplot2`包的`geom_density()`函数创建密度图时，遇到"找不到对象'variable'"的问题，这通常是由于以下几个原因：

1. **缺失的Aesthetics**：`geom_density()`需要你提供x轴（默认是`stat = density()`计算得到的结果）以及颜色或填充依据的变量。比如，如果你想根据'variable'列生成密度图，你需要在`aes()`函数中指明`x = variable`和`fill = variable`或`color = variable`。

   ggplot(data, aes(x = variable, fill = variable)) +
       geom_density()

2. **拼写错误**：检查你在`aes()`中使用的变量名是否与数据集中的实际变量名一致，大小写敏感。

3. **变量未绑定到数据集**：确认`variable`确实存在于你的"data"数据帧中，可以使用`head(data)`或`names(data)`来查看数据集内容。

4. **变量不是一个数值型**：非数值类型的变量（如因子或字符）无法直接作为密度图的输入。如果是这种情况，可能需要先转换成数值形式。

5. **异常值或缺失值**：`variable`中有缺失值或极端值可能导致绘图出现问题。使用`na.rm = TRUE`或对数据预处理去除异常值可能是解决方案。

如果问题依然存在，确保已正确安装并加载了`ggplot2`和其他依赖库，然后逐步排查上述问题。