Error in geom_line() : ℹ Error occurred in the 1st layer. Caused by error in `log()`: ! non-numeric argument to mathematical function这个报错什么意思

这个报错意味着在对数变换时，出现了非数值的参数。可能是因为您的数据中包含了缺失值或非数值的字符型变量。

您可以先查看一下您的数据是否包含缺失值或非数值的字符型变量，可以使用以下代码：

summary(data)

如果您发现有缺失值或非数值的字符型变量，可以先将其删除或替换为适当的数值。例如，使用以下代码可以将缺失值替换为0：

data[is.na(data)] <- 0

如果您的数据中没有缺失值或非数值的字符型变量，那么可能是因为log函数的参数出现了小于等于0的值，因为log函数在0及以下的值没有定义。您可以在绘制log-log图之前，先检查一下数据中是否存在小于等于0的值。例如，使用以下代码可以检查cd40变量是否存在小于等于0的值：

sum(data$cd40 <= 0)

如果存在小于等于0的值，可以考虑对cd40变量进行适当的变换，例如取其绝对值或加上一个较小的常数，以避免log函数出现非数值的情况。

相关问题

Error in `geom_line()`: ! Problem while setting up geom. ℹ Error occurred in the 1st layer. Caused by error in `compute_geom_1()`: ! `geom_line()` requires the following missing aesthetics: y Run `rlang::last_trace()` to see where the error occurred.

这是一个 R 语言中的错误提示，通常是因为你使用了 `geom_line()` 这个函数，但是没有指定 `y` 这个参数，从而导致绘图失败。你需要检查一下你的代码，看看是否缺少了某些必要的参数。你可以通过运行 `rlang::last_trace()` 来查看错误的具体位置。另外，你也可以在提问的时候提供更多的代码和上下文信息，这样我才能更好地帮助你解决问题。

Error in `geom_line()`: ! Problem while computing aesthetics. ℹ Error occurred in the 1st layer. Caused by error in `FUN()`: ! object 'X' not found Run `rlang::last_trace()` to see where the error occurred.

这个错误信息表明，在使用ggplot2函数绘图时出现了错误。其中，首先出现了一个错误，表示在计算美学时出现了问题，具体是在`geom_line()`函数中。紧接着出现了一个警告，表示错误发生在第一层图层。错误的原因是在计算美学时出现了问题，可能是由于`X`对象没有找到。建议使用`rlang::last_trace()`函数查看错误发生的位置并进行排查。常见的问题包括：

- 代码中没有定义`X`对象；
- 数据源中没有包含`X`列；
- `X`列名被错误地写成了其他名称；
- `X`列中包含了缺失值或非数值数据，导致绘图错误。

需要根据具体情况进行排查。以下是可能的代码修改：

ggplot(data, aes(x = X, y = Y, group = Group)) +
  geom_line(aes(color = Group)) +
  geom_point(size = 3, aes(color = Group)) +
  scale_color_brewer(palette = "Set1") +
  ylab("biomass (g)") +
  facet_grid('. ~ 处理2')

在修改后的代码中，`X`列被正确地定义在`aes()`函数中，并且`group`参数被添加到`aes()`函数中。同时，`geom_text()`函数被删除，因为这可能不是必要的。如果问题还未解决，建议使用`rlang::last_trace()`函数查看错误发生的位置并进行排查。